MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19125	NC_020932	AGA	2	6	864686	864691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453893
19126	NC_020932	TCT	2	6	864692	864697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453893
19127	NC_020932	AGG	2	6	864700	864705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453893
19128	NC_020932	AG	3	6	864707	864712	50 %	0 %	50 %	0 %	478453893
19129	NC_020932	ATC	2	6	864766	864771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453893
19130	NC_020932	GTTT	2	8	864977	864984	0 %	75 %	25 %	0 %	478453893
19131	NC_020932	TGTT	2	8	864997	865004	0 %	75 %	25 %	0 %	478453893
19132	NC_020932	TTC	2	6	865081	865086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453893
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19134	NC_020932	CT	3	6	865198	865203	0 %	50 %	0 %	50 %	478453893
19135	NC_020932	TTC	2	6	865234	865239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453893
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19151	NC_020932	AG	3	6	866403	866408	50 %	0 %	50 %	0 %	478453894
19152	NC_020932	TAA	2	6	866442	866447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453894
19153	NC_020932	A	9	9	866491	866499	100 %	0 %	0 %	0 %	478453894
19154	NC_020932	TA	3	6	866541	866546	50 %	50 %	0 %	0 %	478453894
19155	NC_020932	GGA	2	6	866561	866566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453894
19156	NC_020932	GTT	2	6	866582	866587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453894
19157	NC_020932	CCTCTA	2	12	866631	866642	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19158	NC_020932	CTT	2	6	866678	866683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453895
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19160	NC_020932	TTTG	2	8	866735	866742	0 %	75 %	25 %	0 %	478453895
19161	NC_020932	CTG	2	6	866757	866762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453895
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19163	NC_020932	CTT	2	6	866891	866896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453895
19164	NC_020932	CTC	2	6	866910	866915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453895
19165	NC_020932	T	6	6	866936	866941	0 %	100 %	0 %	0 %	478453895
19166	NC_020932	TA	3	6	866973	866978	50 %	50 %	0 %	0 %	478453895
19167	NC_020932	GC	3	6	866991	866996	0 %	0 %	50 %	50 %	478453895
19168	NC_020932	ATC	2	6	867021	867026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453895
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19170	NC_020932	TTG	2	6	867429	867434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453895
19171	NC_020932	GCAT	2	8	867472	867479	25 %	25 %	25 %	25 %	478453895
19172	NC_020932	TGC	2	6	867609	867614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453895
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19176	NC_020932	AG	3	6	867714	867719	50 %	0 %	50 %	0 %	478453895
19177	NC_020932	GTT	2	6	867815	867820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453895
19178	NC_020932	TCA	2	6	867823	867828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453895
19179	NC_020932	T	7	7	867929	867935	0 %	100 %	0 %	0 %	478453895
19180	NC_020932	CAGCC	2	10	867984	867993	20 %	0 %	20 %	60 %	478453895
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19182	NC_020932	CTTG	2	8	868058	868065	0 %	50 %	25 %	25 %	478453895
19183	NC_020932	CA	4	8	868073	868080	50 %	0 %	0 %	50 %	478453895
19184	NC_020932	CAT	2	6	868164	868169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453895
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19186	NC_020932	GATA	2	8	868265	868272	50 %	25 %	25 %	0 %	478453895
19187	NC_020932	TCG	2	6	868359	868364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453895
19188	NC_020932	GAT	2	6	868511	868516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453895
19189	NC_020932	TC	3	6	868574	868579	0 %	50 %	0 %	50 %	478453895
19190	NC_020932	CTT	2	6	868598	868603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453895
19191	NC_020932	GTA	2	6	868609	868614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453895
19192	NC_020932	GTT	2	6	868628	868633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453895
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19201	NC_020932	GGA	2	6	868909	868914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453895
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19226	NC_020932	T	7	7	870276	870282	0 %	100 %	0 %	0 %	478453896
19227	NC_020932	TCT	2	6	870390	870395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453896
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19229	NC_020932	ACG	2	6	870413	870418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453896
19230	NC_020932	TCC	2	6	870491	870496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453896
19231	NC_020932	ACA	2	6	870525	870530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453896
19232	NC_020932	AGA	2	6	870666	870671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453896
19233	NC_020932	T	6	6	870715	870720	0 %	100 %	0 %	0 %	478453896
19234	NC_020932	CCTG	2	8	870738	870745	0 %	25 %	25 %	50 %	478453896
19235	NC_020932	AGA	2	6	870786	870791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453896
19236	NC_020932	TG	3	6	870800	870805	0 %	50 %	50 %	0 %	478453896
19237	NC_020932	ATT	2	6	870806	870811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453896
19238	NC_020932	T	7	7	870817	870823	0 %	100 %	0 %	0 %	478453896
19239	NC_020932	GGT	2	6	871010	871015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453896
19240	NC_020932	AAT	2	6	871022	871027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453896
19241	NC_020932	CTT	2	6	871042	871047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453896
19242	NC_020932	TGA	2	6	871052	871057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453896
19243	NC_020932	TAA	2	6	871075	871080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453896
19244	NC_020932	GTATC	2	10	871110	871119	20 %	40 %	20 %	20 %	478453896
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