MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_020932	ATA	2	6	833899	833904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453873
18503	NC_020932	TTC	2	6	833930	833935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453873
18504	NC_020932	AGCC	2	8	833976	833983	25 %	0 %	25 %	50 %	478453873
18505	NC_020932	CCT	2	6	834027	834032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453873
18506	NC_020932	AG	3	6	834048	834053	50 %	0 %	50 %	0 %	478453873
18507	NC_020932	AGA	2	6	834154	834159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453873
18508	NC_020932	TAG	2	6	834161	834166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453873
18509	NC_020932	AG	3	6	834165	834170	50 %	0 %	50 %	0 %	478453873
18510	NC_020932	GGA	2	6	834216	834221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453873
18511	NC_020932	A	6	6	834238	834243	100 %	0 %	0 %	0 %	478453873
18512	NC_020932	AAT	2	6	834323	834328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453873
18513	NC_020932	AGA	2	6	834353	834358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453873
18514	NC_020932	TAA	2	6	834445	834450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453873
18515	NC_020932	TACA	2	8	834569	834576	50 %	25 %	0 %	25 %	478453873
18516	NC_020932	T	6	6	834623	834628	0 %	100 %	0 %	0 %	478453873
18517	NC_020932	AGA	2	6	834671	834676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453873
18518	NC_020932	ATCACA	2	12	834693	834704	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478453873
18519	NC_020932	ATG	2	6	834723	834728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453873
18520	NC_020932	T	7	7	834769	834775	0 %	100 %	0 %	0 %	478453873
18521	NC_020932	GAAG	2	8	834812	834819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_020932	T	6	6	834877	834882	0 %	100 %	0 %	0 %	478453874
18523	NC_020932	AAAT	2	8	834980	834987	75 %	25 %	0 %	0 %	478453874
18524	NC_020932	AAT	2	6	834990	834995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453874
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18527	NC_020932	CAC	2	6	835092	835097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453874
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18532	NC_020932	AAGC	2	8	835432	835439	50 %	0 %	25 %	25 %	478453874
18533	NC_020932	CGC	2	6	835454	835459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453874
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18538	NC_020932	CGC	2	6	835826	835831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453874
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18544	NC_020932	TGA	2	6	836108	836113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453874
18545	NC_020932	GGA	2	6	836144	836149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453874
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18551	NC_020932	AAG	2	6	836673	836678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453874
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18553	NC_020932	T	7	7	836746	836752	0 %	100 %	0 %	0 %	478453874
18554	NC_020932	GA	3	6	836753	836758	50 %	0 %	50 %	0 %	478453874
18555	NC_020932	A	7	7	836793	836799	100 %	0 %	0 %	0 %	478453874
18556	NC_020932	A	6	6	836831	836836	100 %	0 %	0 %	0 %	478453874
18557	NC_020932	CTA	2	6	836857	836862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18562	NC_020932	GAAG	2	8	837002	837009	50 %	0 %	50 %	0 %	478453875
18563	NC_020932	CTTG	2	8	837100	837107	0 %	50 %	25 %	25 %	478453875
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18571	NC_020932	A	6	6	837455	837460	100 %	0 %	0 %	0 %	478453875
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18602	NC_020932	GGGA	2	8	838535	838542	25 %	0 %	75 %	0 %	478453876
18603	NC_020932	TCT	2	6	838650	838655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453876
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18610	NC_020932	T	6	6	839011	839016	0 %	100 %	0 %	0 %	478453877
18611	NC_020932	TGGG	2	8	839074	839081	0 %	25 %	75 %	0 %	478453877
18612	NC_020932	TG	3	6	839083	839088	0 %	50 %	50 %	0 %	478453877
18613	NC_020932	TG	3	6	839104	839109	0 %	50 %	50 %	0 %	478453877
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18841	NC_020932	A	8	8	850679	850686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18842	NC_020932	A	7	7	850688	850694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18843	NC_020932	GT	3	6	850733	850738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18846	NC_020932	A	6	6	850803	850808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18855	NC_020932	GA	3	6	851320	851325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18856	NC_020932	GCC	2	6	851329	851334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18857	NC_020932	CGC	2	6	851421	851426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18866	NC_020932	GTC	2	6	852084	852089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18870	NC_020932	CAT	2	6	852432	852437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18998	NC_020932	AGG	2	6	859620	859625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18999	NC_020932	A	8	8	859683	859690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19000	NC_020932	A	6	6	859747	859752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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