MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_020932	ATT	2	6	653450	653455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453725
14503	NC_020932	AC	3	6	653496	653501	50 %	0 %	0 %	50 %	478453725
14504	NC_020932	CTT	2	6	653505	653510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453725
14505	NC_020932	GCT	2	6	653540	653545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453725
14506	NC_020932	A	6	6	653718	653723	100 %	0 %	0 %	0 %	478453725
14507	NC_020932	CTT	2	6	653738	653743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453725
14508	NC_020932	GAA	2	6	653855	653860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453725
14509	NC_020932	CT	3	6	654021	654026	0 %	50 %	0 %	50 %	478453726
14510	NC_020932	AGA	2	6	654059	654064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453726
14511	NC_020932	CAA	2	6	654102	654107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453726
14512	NC_020932	TCA	3	9	654140	654148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453726
14513	NC_020932	ATT	2	6	654191	654196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453726
14514	NC_020932	TTA	2	6	654278	654283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453726
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14516	NC_020932	ATC	2	6	654485	654490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453726
14517	NC_020932	CAA	2	6	654498	654503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453726
14518	NC_020932	CTTTT	2	10	654506	654515	0 %	80 %	0 %	20 %	478453726
14519	NC_020932	T	7	7	654512	654518	0 %	100 %	0 %	0 %	478453726
14520	NC_020932	ATT	2	6	654533	654538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453726
14521	NC_020932	AAG	2	6	654562	654567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453726
14522	NC_020932	CTC	2	6	654570	654575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453726
14523	NC_020932	CTT	2	6	654621	654626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453726
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14532	NC_020932	A	7	7	655106	655112	100 %	0 %	0 %	0 %	478453727
14533	NC_020932	A	7	7	655124	655130	100 %	0 %	0 %	0 %	478453727
14534	NC_020932	AAG	2	6	655145	655150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453727
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14537	NC_020932	GAT	2	6	655228	655233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_020932	T	6	6	655356	655361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_020932	A	9	9	655382	655390	100 %	0 %	0 %	0 %	478453728
14540	NC_020932	TTC	2	6	655496	655501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453728
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14543	NC_020932	T	6	6	655674	655679	0 %	100 %	0 %	0 %	478453728
14544	NC_020932	GAA	2	6	655754	655759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453728
14545	NC_020932	A	6	6	656040	656045	100 %	0 %	0 %	0 %	478453728
14546	NC_020932	TTTA	2	8	656113	656120	25 %	75 %	0 %	0 %	478453728
14547	NC_020932	GAA	2	6	656150	656155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453728
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14550	NC_020932	AATC	2	8	656230	656237	50 %	25 %	0 %	25 %	478453728
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14552	NC_020932	A	6	6	656322	656327	100 %	0 %	0 %	0 %	478453728
14553	NC_020932	TAAA	2	8	656413	656420	75 %	25 %	0 %	0 %	478453728
14554	NC_020932	A	6	6	656418	656423	100 %	0 %	0 %	0 %	478453728
14555	NC_020932	AAC	2	6	656428	656433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14557	NC_020932	GGA	3	9	656447	656455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453729
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14559	NC_020932	ATA	2	6	656652	656657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453729
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14602	NC_020932	A	7	7	658402	658408	100 %	0 %	0 %	0 %	478453729
14603	NC_020932	CTC	2	6	658412	658417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453729
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14605	NC_020932	CTA	2	6	658492	658497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_020932	GGA	2	6	658550	658555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020932	GTC	2	6	658621	658626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453730
14608	NC_020932	GA	3	6	658644	658649	50 %	0 %	50 %	0 %	478453730
14609	NC_020932	TCA	2	6	658691	658696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453730
14610	NC_020932	GCGT	2	8	658720	658727	0 %	25 %	50 %	25 %	478453730
14611	NC_020932	TGAT	2	8	658898	658905	25 %	50 %	25 %	0 %	478453730
14612	NC_020932	GCT	2	6	658978	658983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453730
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14617	NC_020932	A	8	8	659184	659191	100 %	0 %	0 %	0 %	478453730
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14991	NC_020932	TCTT	2	8	675384	675391	0 %	75 %	0 %	25 %	478453742
14992	NC_020932	TGA	2	6	675453	675458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453742
14993	NC_020932	TTCTC	2	10	675481	675490	0 %	60 %	0 %	40 %	478453743
14994	NC_020932	TCT	2	6	675502	675507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453743
14995	NC_020932	CT	3	6	675559	675564	0 %	50 %	0 %	50 %	478453743
14996	NC_020932	TCA	2	6	675590	675595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453743
14997	NC_020932	T	6	6	675738	675743	0 %	100 %	0 %	0 %	478453743
14998	NC_020932	A	7	7	675748	675754	100 %	0 %	0 %	0 %	478453743
14999	NC_020932	A	6	6	675771	675776	100 %	0 %	0 %	0 %	478453743
15000	NC_020932	TC	3	6	675780	675785	0 %	50 %	0 %	50 %	478453743

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