MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020932	ATA	2	6	585196	585201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453655
13002	NC_020932	AG	3	6	585213	585218	50 %	0 %	50 %	0 %	478453655
13003	NC_020932	ATT	2	6	585261	585266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453655
13004	NC_020932	CAT	2	6	585386	585391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453655
13005	NC_020932	TCC	2	6	585420	585425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453655
13006	NC_020932	T	6	6	585451	585456	0 %	100 %	0 %	0 %	478453655
13007	NC_020932	AGC	2	6	585459	585464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453655
13008	NC_020932	AAACT	2	10	585562	585571	60 %	20 %	0 %	20 %	478453655
13009	NC_020932	CCT	2	6	585577	585582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453655
13010	NC_020932	AAC	2	6	585585	585590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453655
13011	NC_020932	ACA	2	6	585594	585599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453655
13012	NC_020932	GAC	2	6	585606	585611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453655
13013	NC_020932	CT	3	6	585698	585703	0 %	50 %	0 %	50 %	478453656
13014	NC_020932	CTA	2	6	585724	585729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453656
13015	NC_020932	CTC	2	6	585748	585753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453656
13016	NC_020932	AAC	2	6	585761	585766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453656
13017	NC_020932	T	6	6	585834	585839	0 %	100 %	0 %	0 %	478453656
13018	NC_020932	AAAT	2	8	585880	585887	75 %	25 %	0 %	0 %	478453656
13019	NC_020932	CAT	2	6	585907	585912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453656
13020	NC_020932	TA	3	6	586033	586038	50 %	50 %	0 %	0 %	478453656
13021	NC_020932	T	6	6	586076	586081	0 %	100 %	0 %	0 %	478453657
13022	NC_020932	GCT	2	6	586092	586097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453657
13023	NC_020932	ACG	2	6	586109	586114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453657
13024	NC_020932	AACT	2	8	586199	586206	50 %	25 %	0 %	25 %	478453657
13025	NC_020932	GTCT	2	8	586441	586448	0 %	50 %	25 %	25 %	478453657
13026	NC_020932	CAA	2	6	586468	586473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453657
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13028	NC_020932	TCA	2	6	586557	586562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453657
13029	NC_020932	ACCAA	2	10	586654	586663	60 %	0 %	0 %	40 %	478453658
13030	NC_020932	CGC	2	6	586675	586680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453658
13031	NC_020932	GAG	2	6	586723	586728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453658
13032	NC_020932	TGC	2	6	586775	586780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453658
13033	NC_020932	AC	3	6	586810	586815	50 %	0 %	0 %	50 %	478453658
13034	NC_020932	TCT	2	6	586890	586895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453658
13035	NC_020932	TGC	2	6	586923	586928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453658
13036	NC_020932	CTT	2	6	587080	587085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453659
13037	NC_020932	ATTC	2	8	587158	587165	25 %	50 %	0 %	25 %	478453659
13038	NC_020932	ATC	2	6	587215	587220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453659
13039	NC_020932	CATA	2	8	587322	587329	50 %	25 %	0 %	25 %	478453659
13040	NC_020932	TTA	2	6	587505	587510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453659
13041	NC_020932	TCT	2	6	587514	587519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453659
13042	NC_020932	TCTT	2	8	587571	587578	0 %	75 %	0 %	25 %	478453659
13043	NC_020932	TA	3	6	587589	587594	50 %	50 %	0 %	0 %	478453659
13044	NC_020932	T	7	7	587596	587602	0 %	100 %	0 %	0 %	478453659
13045	NC_020932	TC	4	8	587624	587631	0 %	50 %	0 %	50 %	478453660
13046	NC_020932	GAA	2	6	587649	587654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453660
13047	NC_020932	ACGT	2	8	587741	587748	25 %	25 %	25 %	25 %	478453660
13048	NC_020932	GAG	2	6	587761	587766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453660
13049	NC_020932	T	6	6	587817	587822	0 %	100 %	0 %	0 %	478453660
13050	NC_020932	CAA	3	9	587842	587850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453660
13051	NC_020932	AAC	2	6	587863	587868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453660
13052	NC_020932	AGCA	2	8	587903	587910	50 %	0 %	25 %	25 %	478453660
13053	NC_020932	ATC	2	6	588065	588070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453661
13054	NC_020932	GAT	2	6	588071	588076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453661
13055	NC_020932	AAC	2	6	588158	588163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453661
13056	NC_020932	CTT	2	6	588170	588175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453661
13057	NC_020932	ATCAC	2	10	588216	588225	40 %	20 %	0 %	40 %	478453661
13058	NC_020932	CGA	2	6	588243	588248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453661
13059	NC_020932	TAT	2	6	588292	588297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453661
13060	NC_020932	ACT	2	6	588344	588349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453662
13061	NC_020932	CTT	2	6	588425	588430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453662
13062	NC_020932	ATA	2	6	588453	588458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453662
13063	NC_020932	ACC	2	6	588475	588480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453662
13064	NC_020932	AAC	3	9	588519	588527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453662
13065	NC_020932	T	6	6	588530	588535	0 %	100 %	0 %	0 %	478453662
13066	NC_020932	TGA	2	6	588543	588548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453662
13067	NC_020932	ACT	2	6	588550	588555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453662
13068	NC_020932	T	7	7	588611	588617	0 %	100 %	0 %	0 %	478453663
13069	NC_020932	TAT	2	6	588625	588630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453663
13070	NC_020932	TGA	2	6	588668	588673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453663
13071	NC_020932	AGC	2	6	588697	588702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453663
13072	NC_020932	CGCA	2	8	588706	588713	25 %	0 %	25 %	50 %	478453663
13073	NC_020932	AG	3	6	588720	588725	50 %	0 %	50 %	0 %	478453663
13074	NC_020932	T	6	6	588727	588732	0 %	100 %	0 %	0 %	478453663
13075	NC_020932	TC	3	6	588771	588776	0 %	50 %	0 %	50 %	478453663
13076	NC_020932	TAA	2	6	588787	588792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453663
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13078	NC_020932	GCA	2	6	588861	588866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453664
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13083	NC_020932	GGC	2	6	589093	589098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478453664
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13085	NC_020932	CAA	2	6	589147	589152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453664
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13087	NC_020932	ATA	2	6	589227	589232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453664
13088	NC_020932	CA	3	6	589236	589241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_020932	GCA	2	6	589265	589270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453665
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13091	NC_020932	CTT	2	6	589312	589317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453665
13092	NC_020932	AGT	2	6	589360	589365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453665
13093	NC_020932	CCGA	2	8	589440	589447	25 %	0 %	25 %	50 %	478453665
13094	NC_020932	GAAA	2	8	589546	589553	75 %	0 %	25 %	0 %	478453665
13095	NC_020932	CGA	2	6	589587	589592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453665
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13099	NC_020932	AAG	2	6	589791	589796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453665
13100	NC_020932	TCT	2	6	589800	589805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453665
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13102	NC_020932	CT	3	6	589953	589958	0 %	50 %	0 %	50 %	478453666
13103	NC_020932	CAA	2	6	589962	589967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453666
13104	NC_020932	T	6	6	590137	590142	0 %	100 %	0 %	0 %	478453666
13105	NC_020932	CAA	2	6	590193	590198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453666
13106	NC_020932	TCA	2	6	590211	590216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453666
13107	NC_020932	GTAT	2	8	590253	590260	25 %	50 %	25 %	0 %	478453666
13108	NC_020932	T	6	6	590305	590310	0 %	100 %	0 %	0 %	478453667
13109	NC_020932	TTG	2	6	590334	590339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453667
13110	NC_020932	GA	3	6	590340	590345	50 %	0 %	50 %	0 %	478453667
13111	NC_020932	ACG	2	6	590455	590460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453667
13112	NC_020932	TCT	2	6	590484	590489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453667
13113	NC_020932	TGA	2	6	590525	590530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453667
13114	NC_020932	CAA	2	6	590532	590537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453667
13115	NC_020932	TTA	2	6	590599	590604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453668
13116	NC_020932	CAC	2	6	590687	590692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453668
13117	NC_020932	CGA	2	6	590758	590763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453668
13118	NC_020932	AC	3	6	590782	590787	50 %	0 %	0 %	50 %	478453668
13119	NC_020932	TTCA	2	8	590835	590842	25 %	50 %	0 %	25 %	478453668
13120	NC_020932	GAT	2	6	590898	590903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453668
13121	NC_020932	GCA	2	6	591006	591011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453668
13122	NC_020932	CTTC	2	8	591028	591035	0 %	50 %	0 %	50 %	478453668
13123	NC_020932	TTA	2	6	591181	591186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453668
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13132	NC_020932	CTTC	2	8	591437	591444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13211	NC_020932	A	7	7	594675	594681	100 %	0 %	0 %	0 %	478453673
13212	NC_020932	AG	3	6	594831	594836	50 %	0 %	50 %	0 %	478453673
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13233	NC_020932	ACA	2	6	596036	596041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453674
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13235	NC_020932	ATT	2	6	596095	596100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453674
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13239	NC_020932	TGT	2	6	596251	596256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453674
13240	NC_020932	AT	3	6	596285	596290	50 %	50 %	0 %	0 %	478453674
13241	NC_020932	CAT	2	6	596310	596315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453674
13242	NC_020932	T	6	6	596333	596338	0 %	100 %	0 %	0 %	478453674
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