MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020932	ACAA	2	8	563030	563037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12502	NC_020932	ATT	2	6	563045	563050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020932	AAT	2	6	563056	563061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020932	ATTTT	2	10	563068	563077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020932	AAAAAT	2	12	563088	563099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_020932	A	6	6	563114	563119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_020932	TTG	2	6	563183	563188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453633
12508	NC_020932	TTC	2	6	563210	563215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453633
12509	NC_020932	CCT	2	6	563224	563229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453633
12510	NC_020932	AAAG	2	8	563284	563291	75 %	0 %	25 %	0 %	478453633
12511	NC_020932	CTA	2	6	563332	563337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453633
12512	NC_020932	ATC	2	6	563389	563394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453633
12513	NC_020932	AAC	2	6	563537	563542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453634
12514	NC_020932	ACA	2	6	563571	563576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453634
12515	NC_020932	TTC	2	6	563578	563583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453634
12516	NC_020932	ATCA	2	8	563719	563726	50 %	25 %	0 %	25 %	478453634
12517	NC_020932	TCC	2	6	563752	563757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453634
12518	NC_020932	GAA	2	6	563782	563787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453634
12519	NC_020932	GTT	2	6	563979	563984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453634
12520	NC_020932	CGA	2	6	564000	564005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453634
12521	NC_020932	TCA	2	6	564053	564058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453634
12522	NC_020932	ATT	2	6	564088	564093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453634
12523	NC_020932	GAG	2	6	564144	564149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453634
12524	NC_020932	T	6	6	564397	564402	0 %	100 %	0 %	0 %	478453634
12525	NC_020932	ACG	2	6	564412	564417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453634
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12527	NC_020932	GGAA	2	8	564451	564458	50 %	0 %	50 %	0 %	478453634
12528	NC_020932	TCA	2	6	564536	564541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453634
12529	NC_020932	TTTC	2	8	564699	564706	0 %	75 %	0 %	25 %	478453634
12530	NC_020932	TCT	2	6	564707	564712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453634
12531	NC_020932	CTT	2	6	564738	564743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453634
12532	NC_020932	CT	3	6	564809	564814	0 %	50 %	0 %	50 %	478453634
12533	NC_020932	CGA	2	6	564862	564867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453635
12534	NC_020932	TTC	2	6	564870	564875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453635
12535	NC_020932	ATT	2	6	564885	564890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453635
12536	NC_020932	T	6	6	564917	564922	0 %	100 %	0 %	0 %	478453635
12537	NC_020932	AGA	2	6	564930	564935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453635
12538	NC_020932	T	7	7	564980	564986	0 %	100 %	0 %	0 %	478453635
12539	NC_020932	ACA	2	6	565067	565072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453635
12540	NC_020932	CAA	2	6	565136	565141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453635
12541	NC_020932	AC	3	6	565146	565151	50 %	0 %	0 %	50 %	478453635
12542	NC_020932	TCT	2	6	565168	565173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453635
12543	NC_020932	CTA	2	6	565225	565230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453635
12544	NC_020932	T	6	6	565437	565442	0 %	100 %	0 %	0 %	478453636
12545	NC_020932	ACAG	2	8	565470	565477	50 %	0 %	25 %	25 %	478453636
12546	NC_020932	TTC	2	6	565529	565534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453636
12547	NC_020932	ATA	2	6	565549	565554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453636
12548	NC_020932	AAT	2	6	565572	565577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453636
12549	NC_020932	TTAA	2	8	565635	565642	50 %	50 %	0 %	0 %	478453636
12550	NC_020932	GCA	2	6	565647	565652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453636
12551	NC_020932	AGC	2	6	565691	565696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453636
12552	NC_020932	CT	3	6	565736	565741	0 %	50 %	0 %	50 %	478453636
12553	NC_020932	TAA	2	6	565795	565800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453636
12554	NC_020932	CTG	2	6	565804	565809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453636
12555	NC_020932	CTG	2	6	565895	565900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453636
12556	NC_020932	CT	3	6	566026	566031	0 %	50 %	0 %	50 %	478453636
12557	NC_020932	AAT	2	6	566083	566088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453636
12558	NC_020932	CAG	2	6	566089	566094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453636
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12560	NC_020932	T	6	6	566114	566119	0 %	100 %	0 %	0 %	478453636
12561	NC_020932	ACA	2	6	566293	566298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453636
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12563	NC_020932	TCT	2	6	566349	566354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453636
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12565	NC_020932	TCT	2	6	566637	566642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453636
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12569	NC_020932	CTT	2	6	566773	566778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453636
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12571	NC_020932	CACT	2	8	566830	566837	25 %	25 %	0 %	50 %	478453636
12572	NC_020932	CTG	2	6	566860	566865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453636
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12574	NC_020932	A	6	6	566951	566956	100 %	0 %	0 %	0 %	478453636
12575	NC_020932	AAGCA	2	10	566963	566972	60 %	0 %	20 %	20 %	478453636
12576	NC_020932	TA	3	6	566996	567001	50 %	50 %	0 %	0 %	478453636
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12581	NC_020932	GTC	2	6	567270	567275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453636
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12588	NC_020932	CAT	2	6	567685	567690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453636
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12590	NC_020932	TTA	2	6	567834	567839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453636
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12592	NC_020932	T	6	6	568013	568018	0 %	100 %	0 %	0 %	478453636
12593	NC_020932	TTG	2	6	568062	568067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453637
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12595	NC_020932	AACCC	2	10	568157	568166	40 %	0 %	0 %	60 %	478453637
12596	NC_020932	TTC	2	6	568209	568214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453637
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12601	NC_020932	AATA	2	8	568278	568285	75 %	25 %	0 %	0 %	478453637
12602	NC_020932	AAC	2	6	568341	568346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453637
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12609	NC_020932	CAC	2	6	568697	568702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453637
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12611	NC_020932	ATCA	2	8	568827	568834	50 %	25 %	0 %	25 %	478453637
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12616	NC_020932	A	6	6	568996	569001	100 %	0 %	0 %	0 %	478453637
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12619	NC_020932	TTC	2	6	569026	569031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453637
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12621	NC_020932	TAAA	2	8	569116	569123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12750	NC_020932	CTG	2	6	573888	573893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453641
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12867	NC_020932	A	8	8	578968	578975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12874	NC_020932	TTC	2	6	579207	579212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453647
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12992	NC_020932	GCAA	2	8	584645	584652	50 %	0 %	25 %	25 %	478453653
12993	NC_020932	T	6	6	584670	584675	0 %	100 %	0 %	0 %	478453653
12994	NC_020932	GCA	2	6	584787	584792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453654
12995	NC_020932	TC	3	6	584851	584856	0 %	50 %	0 %	50 %	478453654
12996	NC_020932	TCTT	2	8	584870	584877	0 %	75 %	0 %	25 %	478453654
12997	NC_020932	GTTGT	2	10	584929	584938	0 %	60 %	40 %	0 %	478453654
12998	NC_020932	TTC	2	6	584942	584947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453654
12999	NC_020932	AGA	2	6	585098	585103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453654
13000	NC_020932	TTC	2	6	585127	585132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453654

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