MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020932	GGT	2	6	540690	540695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_020932	CTT	2	6	540734	540739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_020932	T	7	7	540745	540751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_020932	CCT	2	6	540817	540822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453610
12006	NC_020932	TCCC	2	8	540866	540873	0 %	25 %	0 %	75 %	478453610
12007	NC_020932	GAG	2	6	540880	540885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453610
12008	NC_020932	CAA	2	6	540937	540942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453610
12009	NC_020932	A	7	7	541003	541009	100 %	0 %	0 %	0 %	478453610
12010	NC_020932	CTC	2	6	541044	541049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453610
12011	NC_020932	CTA	2	6	541099	541104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453610
12012	NC_020932	CT	5	10	541134	541143	0 %	50 %	0 %	50 %	478453610
12013	NC_020932	T	6	6	541224	541229	0 %	100 %	0 %	0 %	478453610
12014	NC_020932	TGA	2	6	541286	541291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453610
12015	NC_020932	GTT	2	6	541335	541340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453610
12016	NC_020932	ACA	2	6	541364	541369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453611
12017	NC_020932	CAG	2	6	541393	541398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453611
12018	NC_020932	CTT	2	6	541401	541406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453611
12019	NC_020932	A	6	6	541418	541423	100 %	0 %	0 %	0 %	478453611
12020	NC_020932	CAA	2	6	541491	541496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453611
12021	NC_020932	TCC	2	6	541499	541504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453611
12022	NC_020932	T	8	8	541654	541661	0 %	100 %	0 %	0 %	478453611
12023	NC_020932	CTTC	2	8	541664	541671	0 %	50 %	0 %	50 %	478453611
12024	NC_020932	T	8	8	541700	541707	0 %	100 %	0 %	0 %	478453611
12025	NC_020932	CTA	2	6	541719	541724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453611
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12030	NC_020932	TCC	2	6	541980	541985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453611
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12034	NC_020932	CT	3	6	542152	542157	0 %	50 %	0 %	50 %	478453612
12035	NC_020932	ACT	2	6	542178	542183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453612
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12039	NC_020932	AGA	2	6	542345	542350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453612
12040	NC_020932	GCA	2	6	542383	542388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453612
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12042	NC_020932	AAAC	2	8	542515	542522	75 %	0 %	0 %	25 %	478453612
12043	NC_020932	CTT	2	6	542542	542547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453612
12044	NC_020932	GC	3	6	542560	542565	0 %	0 %	50 %	50 %	478453612
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12046	NC_020932	CT	3	6	542632	542637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12047	NC_020932	GAAA	2	8	542648	542655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_020932	GCAA	2	8	542685	542692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12049	NC_020932	ACC	2	6	542815	542820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_020932	A	6	6	542857	542862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_020932	GAA	2	6	542871	542876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_020932	TAC	2	6	542901	542906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_020932	A	6	6	542911	542916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_020932	CTAT	2	8	542936	542943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12055	NC_020932	A	6	6	542951	542956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_020932	CT	3	6	542987	542992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12057	NC_020932	CAAA	2	8	543014	543021	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12058	NC_020932	TCT	2	6	543178	543183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453613
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12062	NC_020932	GAA	2	6	543314	543319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453613
12063	NC_020932	GA	3	6	543402	543407	50 %	0 %	50 %	0 %	478453613
12064	NC_020932	GAA	2	6	543512	543517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453613
12065	NC_020932	A	8	8	543607	543614	100 %	0 %	0 %	0 %	478453613
12066	NC_020932	TGA	2	6	543667	543672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453613
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12089	NC_020932	CT	3	6	544641	544646	0 %	50 %	0 %	50 %	478453615
12090	NC_020932	TAA	2	6	544729	544734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453615
12091	NC_020932	ATGG	2	8	544813	544820	25 %	25 %	50 %	0 %	478453615
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12095	NC_020932	GCTT	2	8	545037	545044	0 %	50 %	25 %	25 %	478453615
12096	NC_020932	T	7	7	545059	545065	0 %	100 %	0 %	0 %	478453615
12097	NC_020932	CTTC	2	8	545088	545095	0 %	50 %	0 %	50 %	478453615
12098	NC_020932	TCCCTC	2	12	545118	545129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12099	NC_020932	CTA	2	6	545140	545145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12104	NC_020932	TGT	2	6	545323	545328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453616
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12109	NC_020932	TGT	2	6	545555	545560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453616
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12112	NC_020932	TATTC	2	10	545847	545856	20 %	60 %	0 %	20 %	478453616
12113	NC_020932	CGA	2	6	545882	545887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453616
12114	NC_020932	AGC	2	6	545905	545910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453616
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12116	NC_020932	ATA	2	6	546126	546131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453616
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12121	NC_020932	GAG	2	6	546288	546293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453616
12122	NC_020932	TGC	2	6	546325	546330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453616
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12124	NC_020932	A	6	6	546381	546386	100 %	0 %	0 %	0 %	478453616
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12247	NC_020932	CTG	2	6	551838	551843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453620
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12353	NC_020932	GTT	2	6	556664	556669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12355	NC_020932	TCT	2	6	556699	556704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12356	NC_020932	GCTT	2	8	556729	556736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12357	NC_020932	ACC	2	6	556755	556760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12358	NC_020932	CGAA	2	8	556778	556785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12359	NC_020932	CTTT	2	8	556815	556822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12360	NC_020932	T	8	8	556834	556841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12361	NC_020932	TCT	2	6	556854	556859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12362	NC_020932	AG	3	6	556868	556873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12363	NC_020932	A	9	9	556894	556902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12364	NC_020932	GGAT	2	8	556960	556967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12365	NC_020932	TGT	2	6	556976	556981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453626
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12368	NC_020932	TTG	2	6	557092	557097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453626
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