MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020932	TGT	2	6	518866	518871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453589
11502	NC_020932	AGC	2	6	518877	518882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453589
11503	NC_020932	TTC	2	6	518883	518888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453589
11504	NC_020932	GCC	2	6	519160	519165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453589
11505	NC_020932	AACT	2	8	519285	519292	50 %	25 %	0 %	25 %	478453589
11506	NC_020932	AGC	2	6	519303	519308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453589
11507	NC_020932	AAC	2	6	519331	519336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453589
11508	NC_020932	GA	3	6	519374	519379	50 %	0 %	50 %	0 %	478453589
11509	NC_020932	CAA	2	6	519392	519397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453589
11510	NC_020932	AAG	2	6	519458	519463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453589
11511	NC_020932	CTC	2	6	519474	519479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453589
11512	NC_020932	CTTC	2	8	519485	519492	0 %	50 %	0 %	50 %	478453589
11513	NC_020932	TGT	2	6	519502	519507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453589
11514	NC_020932	ATAA	2	8	519706	519713	75 %	25 %	0 %	0 %	478453589
11515	NC_020932	TTG	2	6	519716	519721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453589
11516	NC_020932	AAAG	2	8	519775	519782	75 %	0 %	25 %	0 %	478453589
11517	NC_020932	AAG	2	6	519797	519802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453589
11518	NC_020932	AAC	2	6	519825	519830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453589
11519	NC_020932	TC	3	6	519833	519838	0 %	50 %	0 %	50 %	478453589
11520	NC_020932	ACA	2	6	519859	519864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453589
11521	NC_020932	AATA	2	8	519918	519925	75 %	25 %	0 %	0 %	478453589
11522	NC_020932	TCT	2	6	519934	519939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453589
11523	NC_020932	TGC	2	6	519982	519987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453589
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11525	NC_020932	AAT	3	9	520185	520193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453589
11526	NC_020932	GAAG	2	8	520290	520297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020932	AT	3	6	520316	520321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020932	AAAG	2	8	520329	520336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_020932	T	6	6	520377	520382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020932	TTGGA	2	10	520400	520409	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020932	T	6	6	520423	520428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_020932	ACA	2	6	520431	520436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_020932	AACC	2	8	520464	520471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_020932	A	7	7	520535	520541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_020932	T	6	6	520557	520562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_020932	A	7	7	520608	520614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11538	NC_020932	AAAG	2	8	520674	520681	75 %	0 %	25 %	0 %	478453590
11539	NC_020932	CAA	2	6	520730	520735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453590
11540	NC_020932	GAACT	2	10	520887	520896	40 %	20 %	20 %	20 %	478453590
11541	NC_020932	TTG	2	6	520918	520923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453590
11542	NC_020932	TCA	2	6	520991	520996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_020932	A	7	7	521001	521007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020932	CTAA	2	8	521022	521029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11545	NC_020932	AAT	2	6	521046	521051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020932	ACTT	2	8	521056	521063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_020932	GCT	2	6	521147	521152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_020932	CAAAA	2	10	521166	521175	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11549	NC_020932	AGA	2	6	521224	521229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020932	ATA	2	6	521258	521263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_020932	CTA	2	6	521332	521337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_020932	TCCC	2	8	521494	521501	0 %	25 %	0 %	75 %	478453591
11553	NC_020932	CAT	3	9	521514	521522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453591
11554	NC_020932	TCG	2	6	521532	521537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453591
11555	NC_020932	TTG	2	6	521618	521623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453591
11556	NC_020932	ATT	2	6	521712	521717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453591
11557	NC_020932	GCA	2	6	521741	521746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453591
11558	NC_020932	CT	3	6	521749	521754	0 %	50 %	0 %	50 %	478453591
11559	NC_020932	ACA	2	6	521825	521830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453591
11560	NC_020932	CCT	2	6	521840	521845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453591
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11562	NC_020932	A	7	7	521953	521959	100 %	0 %	0 %	0 %	478453591
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11565	NC_020932	GTC	2	6	522258	522263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453592
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11571	NC_020932	TTCT	2	8	522519	522526	0 %	75 %	0 %	25 %	478453592
11572	NC_020932	CTT	2	6	522527	522532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453592
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11603	NC_020932	ATTC	2	8	523970	523977	25 %	50 %	0 %	25 %	478453594
11604	NC_020932	TGC	2	6	524034	524039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453594
11605	NC_020932	GCT	2	6	524050	524055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453594
11606	NC_020932	GGAG	2	8	524074	524081	25 %	0 %	75 %	0 %	478453594
11607	NC_020932	TCA	2	6	524084	524089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453594
11608	NC_020932	TCA	2	6	524127	524132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453594
11609	NC_020932	ACT	2	6	524257	524262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453594
11610	NC_020932	A	6	6	524317	524322	100 %	0 %	0 %	0 %	478453594
11611	NC_020932	CAA	2	6	524386	524391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453594
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11614	NC_020932	TCA	2	6	524477	524482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453595
11615	NC_020932	CTA	2	6	524527	524532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453595
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11618	NC_020932	CTAG	2	8	524706	524713	25 %	25 %	25 %	25 %	478453595
11619	NC_020932	TGC	2	6	524756	524761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453595
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11621	NC_020932	TCT	2	6	524790	524795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453595
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11623	NC_020932	TCA	2	6	524975	524980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453595
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11744	NC_020932	ATGTCA	2	12	529644	529655	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478453597
11745	NC_020932	ACACC	2	10	529707	529716	40 %	0 %	0 %	60 %	478453597
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11989	NC_020932	ACAAGA	2	12	540194	540205	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478453609
11990	NC_020932	GGA	2	6	540219	540224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453609
11991	NC_020932	CCCT	2	8	540232	540239	0 %	25 %	0 %	75 %	478453609
11992	NC_020932	CTA	2	6	540317	540322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453609
11993	NC_020932	TCCC	2	8	540349	540356	0 %	25 %	0 %	75 %	478453609
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11999	NC_020932	CGAA	2	8	540518	540525	50 %	0 %	25 %	25 %	478453609
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