MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020932	TG	3	6	451096	451101	0 %	50 %	50 %	0 %	478453535
10003	NC_020932	ACC	2	6	451126	451131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453535
10004	NC_020932	TTA	2	6	451191	451196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453535
10005	NC_020932	AGA	2	6	451216	451221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453535
10006	NC_020932	GAC	2	6	451352	451357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453535
10007	NC_020932	GCT	2	6	451460	451465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453535
10008	NC_020932	TGC	2	6	451509	451514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453535
10009	NC_020932	GTA	2	6	451641	451646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453535
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10011	NC_020932	T	6	6	451746	451751	0 %	100 %	0 %	0 %	478453535
10012	NC_020932	AAC	2	6	451764	451769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453535
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10015	NC_020932	GCT	2	6	451859	451864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453535
10016	NC_020932	CA	3	6	451951	451956	50 %	0 %	0 %	50 %	478453535
10017	NC_020932	CCT	2	6	451961	451966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453535
10018	NC_020932	GAA	2	6	451970	451975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453535
10019	NC_020932	ACT	2	6	452181	452186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453535
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10021	NC_020932	CCG	2	6	452209	452214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453535
10022	NC_020932	TC	4	8	452252	452259	0 %	50 %	0 %	50 %	478453535
10023	NC_020932	AGA	3	9	452263	452271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453535
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10033	NC_020932	GTTG	2	8	452620	452627	0 %	50 %	50 %	0 %	478453535
10034	NC_020932	CTAAAG	2	12	452637	452648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478453535
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10037	NC_020932	A	6	6	452723	452728	100 %	0 %	0 %	0 %	478453535
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10040	NC_020932	T	6	6	452794	452799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_020932	CTT	2	6	452854	452859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_020932	T	6	6	452911	452916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_020932	GGA	2	6	452971	452976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_020932	CATG	2	8	453022	453029	25 %	25 %	25 %	25 %	478453536
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10053	NC_020932	TCT	2	6	453391	453396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453536
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10055	NC_020932	GAAA	2	8	453406	453413	75 %	0 %	25 %	0 %	478453536
10056	NC_020932	TC	3	6	453415	453420	0 %	50 %	0 %	50 %	478453536
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10060	NC_020932	GAA	2	6	453485	453490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453536
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10062	NC_020932	ATT	2	6	453544	453549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453536
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10071	NC_020932	GAG	2	6	454102	454107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020932	GCAA	2	8	454142	454149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10073	NC_020932	T	7	7	454202	454208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10095	NC_020932	CAC	2	6	454890	454895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453537
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10101	NC_020932	TGA	2	6	455090	455095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453537
10102	NC_020932	GTAC	2	8	455187	455194	25 %	25 %	25 %	25 %	478453537
10103	NC_020932	A	7	7	455215	455221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020932	TCT	2	6	455224	455229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453538
10105	NC_020932	TCCA	2	8	455291	455298	25 %	25 %	0 %	50 %	478453538
10106	NC_020932	ACAT	2	8	455325	455332	50 %	25 %	0 %	25 %	478453538
10107	NC_020932	TCA	3	9	455355	455363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453538
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10112	NC_020932	CTT	2	6	455645	455650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453538
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10114	NC_020932	TC	4	8	455771	455778	0 %	50 %	0 %	50 %	478453538
10115	NC_020932	CAA	2	6	455821	455826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453538
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10117	NC_020932	TC	3	6	455943	455948	0 %	50 %	0 %	50 %	478453538
10118	NC_020932	C	6	6	455991	455996	0 %	0 %	0 %	100 %	478453538
10119	NC_020932	CT	3	6	456086	456091	0 %	50 %	0 %	50 %	478453538
10120	NC_020932	TTCTC	2	10	456105	456114	0 %	60 %	0 %	40 %	478453538
10121	NC_020932	GCA	2	6	456156	456161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453538
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10123	NC_020932	TATCT	2	10	456266	456275	20 %	60 %	0 %	20 %	478453538
10124	NC_020932	TCAA	2	8	456285	456292	50 %	25 %	0 %	25 %	478453538
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10127	NC_020932	GAT	2	6	456455	456460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_020932	A	6	6	456479	456484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_020932	TAA	2	6	456500	456505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_020932	T	6	6	456565	456570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_020932	AG	3	6	456610	456615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10230	NC_020932	A	6	6	461491	461496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10231	NC_020932	AAG	2	6	461536	461541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_020932	TAAAA	2	10	461579	461588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10233	NC_020932	A	8	8	461632	461639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10234	NC_020932	CAC	2	6	461641	461646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10235	NC_020932	CTTT	2	8	461691	461698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10236	NC_020932	GTA	2	6	461718	461723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_020932	AGG	2	6	461749	461754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_020932	AGC	2	6	461972	461977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453544
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10240	NC_020932	A	7	7	462107	462113	100 %	0 %	0 %	0 %	478453544
10241	NC_020932	AGA	2	6	462153	462158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453544
10242	NC_020932	TTA	2	6	462189	462194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453544
10243	NC_020932	AAAC	2	8	462216	462223	75 %	0 %	0 %	25 %	478453544
10244	NC_020932	GAA	2	6	462256	462261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453545
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10494	NC_020932	CTG	2	6	473380	473385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453551
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