MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_020932	CGC	2	6	316542	316547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453419
7003	NC_020932	TGTGT	2	10	316554	316563	0 %	60 %	40 %	0 %	478453419
7004	NC_020932	TGA	2	6	316568	316573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453419
7005	NC_020932	CAT	3	9	316676	316684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453419
7006	NC_020932	GTG	2	6	316723	316728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453419
7007	NC_020932	TGC	2	6	316787	316792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453419
7008	NC_020932	AAG	2	6	316797	316802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453419
7009	NC_020932	AAG	2	6	316864	316869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453419
7010	NC_020932	TAA	2	6	316898	316903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453419
7011	NC_020932	GGA	2	6	317036	317041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453419
7012	NC_020932	AAG	2	6	317080	317085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453419
7013	NC_020932	CG	4	8	317097	317104	0 %	0 %	50 %	50 %	478453419
7014	NC_020932	AGA	2	6	317111	317116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453419
7015	NC_020932	GTT	2	6	317121	317126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453419
7016	NC_020932	AGA	3	9	317135	317143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453419
7017	NC_020932	TGA	2	6	317195	317200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453419
7018	NC_020932	CTC	3	9	317220	317228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453420
7019	NC_020932	TAAAG	2	10	317441	317450	60 %	20 %	20 %	0 %	478453420
7020	NC_020932	GAT	2	6	317451	317456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453420
7021	NC_020932	TCC	2	6	317527	317532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453420
7022	NC_020932	TAA	2	6	317564	317569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453420
7023	NC_020932	TGT	2	6	317597	317602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453420
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7029	NC_020932	A	6	6	317903	317908	100 %	0 %	0 %	0 %	478453420
7030	NC_020932	CTT	2	6	317929	317934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453420
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7032	NC_020932	ATGGA	2	10	318066	318075	40 %	20 %	40 %	0 %	478453420
7033	NC_020932	CAA	2	6	318171	318176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453420
7034	NC_020932	CTT	2	6	318193	318198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453420
7035	NC_020932	CAA	2	6	318210	318215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453420
7036	NC_020932	CTC	2	6	318228	318233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453420
7037	NC_020932	CAA	2	6	318243	318248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453420
7038	NC_020932	CAT	2	6	318317	318322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_020932	A	7	7	318329	318335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_020932	A	7	7	318343	318349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_020932	GCC	2	6	318362	318367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_020932	AATT	2	8	318396	318403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_020932	A	6	6	318413	318418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020932	TTG	2	6	318434	318439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_020932	A	6	6	318441	318446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_020932	ATA	2	6	318463	318468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_020932	TCA	2	6	318512	318517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453421
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7050	NC_020932	TGC	2	6	318710	318715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453421
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7054	NC_020932	A	8	8	318934	318941	100 %	0 %	0 %	0 %	478453421
7055	NC_020932	AAG	2	6	318949	318954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453421
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7057	NC_020932	GAG	2	6	319057	319062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453421
7058	NC_020932	CTC	2	6	319090	319095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453421
7059	NC_020932	GGT	2	6	319161	319166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453421
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7061	NC_020932	TA	3	6	319213	319218	50 %	50 %	0 %	0 %	478453421
7062	NC_020932	GTC	2	6	319272	319277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453421
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7072	NC_020932	TAA	2	6	319688	319693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453421
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7075	NC_020932	ACG	2	6	319799	319804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453421
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7087	NC_020932	AAAAAG	2	12	320208	320219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_020932	CCT	4	12	320292	320303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453422
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7091	NC_020932	TACA	2	8	320392	320399	50 %	25 %	0 %	25 %	478453422
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7097	NC_020932	TCA	2	6	320601	320606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453422
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7105	NC_020932	ATC	2	6	320963	320968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453422
7106	NC_020932	TTCT	2	8	320999	321006	0 %	75 %	0 %	25 %	478453422
7107	NC_020932	GTT	2	6	321015	321020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453422
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7110	NC_020932	T	6	6	321080	321085	0 %	100 %	0 %	0 %	478453422
7111	NC_020932	GCT	2	6	321097	321102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453422
7112	NC_020932	AAGAA	2	10	321136	321145	80 %	0 %	20 %	0 %	478453422
7113	NC_020932	AAG	2	6	321160	321165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453422
7114	NC_020932	T	7	7	321196	321202	0 %	100 %	0 %	0 %	478453422
7115	NC_020932	T	6	6	321209	321214	0 %	100 %	0 %	0 %	478453422
7116	NC_020932	ATA	2	6	321273	321278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453422
7117	NC_020932	T	6	6	321436	321441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_020932	T	6	6	321463	321468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_020932	AAGA	2	8	321544	321551	75 %	0 %	25 %	0 %	478453423
7120	NC_020932	AAG	2	6	321629	321634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453423
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7122	NC_020932	AAG	2	6	321728	321733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453423
7123	NC_020932	TTA	2	6	321836	321841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453423
7124	NC_020932	TA	3	6	321844	321849	50 %	50 %	0 %	0 %	478453423
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7376	NC_020932	ATA	2	6	332757	332762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453434
7377	NC_020932	AGA	2	6	332862	332867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453434
7378	NC_020932	AAG	2	6	332918	332923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453434
7379	NC_020932	AGG	2	6	332955	332960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453434
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7382	NC_020932	AT	4	8	333054	333061	50 %	50 %	0 %	0 %	478453434
7383	NC_020932	T	6	6	333065	333070	0 %	100 %	0 %	0 %	478453434
7384	NC_020932	CAA	2	6	333087	333092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453434
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7392	NC_020932	GAA	2	6	333365	333370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453434
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7441	NC_020932	TTC	2	6	336206	336211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453435
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7453	NC_020932	GCT	2	6	336958	336963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453436
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7469	NC_020932	T	7	7	337563	337569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7471	NC_020932	T	6	6	337627	337632	0 %	100 %	0 %	0 %	478453438
7472	NC_020932	CCA	3	9	337652	337660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453438
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7477	NC_020932	AT	3	6	338060	338065	50 %	50 %	0 %	0 %	478453438
7478	NC_020932	AGA	2	6	338095	338100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453438
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7482	NC_020932	CTA	2	6	338228	338233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453438
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7490	NC_020932	AC	4	8	338440	338447	50 %	0 %	0 %	50 %	478453438
7491	NC_020932	ATG	2	6	338538	338543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453438
7492	NC_020932	A	7	7	338549	338555	100 %	0 %	0 %	0 %	478453438
7493	NC_020932	TAA	2	6	338577	338582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453438
7494	NC_020932	A	7	7	338591	338597	100 %	0 %	0 %	0 %	478453438
7495	NC_020932	CTTCA	2	10	338779	338788	20 %	40 %	0 %	40 %	478453438
7496	NC_020932	ATC	2	6	338833	338838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453438
7497	NC_020932	TCT	2	6	338846	338851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453438
7498	NC_020932	CATTG	2	10	338883	338892	20 %	40 %	20 %	20 %	478453438
7499	NC_020932	CTT	2	6	338950	338955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453438
7500	NC_020932	CCT	2	6	338985	338990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453438

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