MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020932	CTC	2	6	271990	271995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453379
6003	NC_020932	A	7	7	272005	272011	100 %	0 %	0 %	0 %	478453379
6004	NC_020932	TTGTC	2	10	272019	272028	0 %	60 %	20 %	20 %	478453379
6005	NC_020932	GAA	2	6	272032	272037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453379
6006	NC_020932	ATT	2	6	272042	272047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453379
6007	NC_020932	ACG	2	6	272074	272079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453379
6008	NC_020932	ATC	2	6	272108	272113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453379
6009	NC_020932	CTC	2	6	272114	272119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453379
6010	NC_020932	ATA	2	6	272153	272158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453379
6011	NC_020932	A	6	6	272213	272218	100 %	0 %	0 %	0 %	478453379
6012	NC_020932	A	6	6	272303	272308	100 %	0 %	0 %	0 %	478453380
6013	NC_020932	TGGT	2	8	272392	272399	0 %	50 %	50 %	0 %	478453380
6014	NC_020932	AAG	2	6	272418	272423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453380
6015	NC_020932	GAA	2	6	272510	272515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453380
6016	NC_020932	TGT	2	6	272518	272523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453380
6017	NC_020932	ATG	2	6	272603	272608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453380
6018	NC_020932	TCCG	2	8	272613	272620	0 %	25 %	25 %	50 %	478453380
6019	NC_020932	ACC	2	6	272623	272628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453380
6020	NC_020932	CTC	2	6	272637	272642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453380
6021	NC_020932	A	7	7	272689	272695	100 %	0 %	0 %	0 %	478453380
6022	NC_020932	CT	3	6	272720	272725	0 %	50 %	0 %	50 %	478453380
6023	NC_020932	GGA	2	6	272747	272752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453380
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6033	NC_020932	AATT	2	8	273055	273062	50 %	50 %	0 %	0 %	478453380
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6039	NC_020932	TTCT	2	8	273265	273272	0 %	75 %	0 %	25 %	478453380
6040	NC_020932	TCC	2	6	273325	273330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453380
6041	NC_020932	GCT	2	6	273335	273340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453380
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6043	NC_020932	AGCT	2	8	273390	273397	25 %	25 %	25 %	25 %	478453380
6044	NC_020932	TGAT	2	8	273441	273448	25 %	50 %	25 %	0 %	478453380
6045	NC_020932	CTC	2	6	273488	273493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453380
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6047	NC_020932	CTT	2	6	273540	273545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_020932	TCT	2	6	273546	273551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453381
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6051	NC_020932	CTT	2	6	273649	273654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453381
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6053	NC_020932	TCT	2	6	273791	273796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453381
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6094	NC_020932	ATATTA	2	12	276038	276049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_020932	AAAG	2	8	276050	276057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_020932	TGCC	2	8	276538	276545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_020932	TCT	2	6	276558	276563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453383
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6110	NC_020932	CT	3	6	276635	276640	0 %	50 %	0 %	50 %	478453383
6111	NC_020932	ATC	2	6	276641	276646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453383
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6114	NC_020932	GA	3	6	276703	276708	50 %	0 %	50 %	0 %	478453383
6115	NC_020932	AAAG	2	8	276735	276742	75 %	0 %	25 %	0 %	478453383
6116	NC_020932	ATA	2	6	276833	276838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453383
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6123	NC_020932	TAAT	2	8	277156	277163	50 %	50 %	0 %	0 %	478453383
6124	NC_020932	TTC	2	6	277166	277171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453383
6125	NC_020932	AGA	2	6	277202	277207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453383
6126	NC_020932	TG	3	6	277247	277252	0 %	50 %	50 %	0 %	478453383
6127	NC_020932	GAA	2	6	277253	277258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453383
6128	NC_020932	CTT	2	6	277261	277266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453383
6129	NC_020932	TCC	2	6	277436	277441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453383
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6132	NC_020932	CACGCG	2	12	277703	277714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478453383
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6136	NC_020932	TAC	2	6	277977	277982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6141	NC_020932	TTG	2	6	278070	278075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453384
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6214	NC_020932	T	6	6	281553	281558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6215	NC_020932	A	6	6	281573	281578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6216	NC_020932	TC	4	8	281595	281602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6217	NC_020932	T	6	6	281723	281728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6223	NC_020932	ACT	2	6	281922	281927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453386
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6240	NC_020932	T	7	7	282617	282623	0 %	100 %	0 %	0 %	478453387
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