MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020931	ATC	2	6	362784	362789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_020931	TCT	2	6	362838	362843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454351
8003	NC_020931	TA	3	6	362845	362850	50 %	50 %	0 %	0 %	478454351
8004	NC_020931	CAA	2	6	362881	362886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
8005	NC_020931	AGGC	2	8	362899	362906	25 %	0 %	50 %	25 %	478454351
8006	NC_020931	TCCA	2	8	362955	362962	25 %	25 %	0 %	50 %	478454351
8007	NC_020931	A	7	7	362962	362968	100 %	0 %	0 %	0 %	478454351
8008	NC_020931	AGC	2	6	363006	363011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454351
8009	NC_020931	ACCA	2	8	363057	363064	50 %	0 %	0 %	50 %	478454351
8010	NC_020931	CTT	2	6	363120	363125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454351
8011	NC_020931	CTC	2	6	363163	363168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454351
8012	NC_020931	AAG	2	6	363175	363180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454351
8013	NC_020931	AGT	2	6	363275	363280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454351
8014	NC_020931	CAA	2	6	363281	363286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
8015	NC_020931	AGGGA	2	10	363311	363320	40 %	0 %	60 %	0 %	478454351
8016	NC_020931	GCT	2	6	363324	363329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454351
8017	NC_020931	AGA	2	6	363335	363340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454351
8018	NC_020931	TCT	2	6	363390	363395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454351
8019	NC_020931	TAC	2	6	363401	363406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454351
8020	NC_020931	TAG	2	6	363445	363450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454351
8021	NC_020931	GCAT	2	8	363521	363528	25 %	25 %	25 %	25 %	478454351
8022	NC_020931	TGAG	2	8	363554	363561	25 %	25 %	50 %	0 %	478454351
8023	NC_020931	AC	3	6	363582	363587	50 %	0 %	0 %	50 %	478454351
8024	NC_020931	A	6	6	363683	363688	100 %	0 %	0 %	0 %	478454351
8025	NC_020931	CAA	2	6	363703	363708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
8026	NC_020931	CT	4	8	363754	363761	0 %	50 %	0 %	50 %	478454351
8027	NC_020931	CAA	2	6	363842	363847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
8028	NC_020931	TGA	2	6	363864	363869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454351
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8030	NC_020931	TGA	2	6	363960	363965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454351
8031	NC_020931	CT	3	6	363987	363992	0 %	50 %	0 %	50 %	478454351
8032	NC_020931	CA	3	6	363996	364001	50 %	0 %	0 %	50 %	478454351
8033	NC_020931	CAA	2	6	364042	364047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
8034	NC_020931	GTC	3	9	364061	364069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454351
8035	NC_020931	ATC	3	9	364070	364078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454351
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8037	NC_020931	C	10	10	364165	364174	0 %	0 %	0 %	100 %	478454351
8038	NC_020931	TCT	2	6	364239	364244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454351
8039	NC_020931	GAA	2	6	364248	364253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454351
8040	NC_020931	TCG	2	6	364284	364289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454351
8041	NC_020931	TATG	2	8	364291	364298	25 %	50 %	25 %	0 %	478454351
8042	NC_020931	GT	3	6	364309	364314	0 %	50 %	50 %	0 %	478454351
8043	NC_020931	TAT	2	6	364321	364326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454351
8044	NC_020931	TCT	2	6	364347	364352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_020931	C	6	6	364364	364369	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8046	NC_020931	AAC	2	6	364386	364391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_020931	A	6	6	364436	364441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_020931	A	8	8	364456	364463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_020931	ATC	2	6	364501	364506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_020931	TCTCT	2	10	364523	364532	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8051	NC_020931	CCT	2	6	364539	364544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454352
8052	NC_020931	CAT	2	6	364592	364597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454352
8053	NC_020931	GA	3	6	364600	364605	50 %	0 %	50 %	0 %	478454352
8054	NC_020931	AAC	2	6	364607	364612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454352
8055	NC_020931	AACA	2	8	364636	364643	75 %	0 %	0 %	25 %	478454352
8056	NC_020931	CTG	3	9	364655	364663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454352
8057	NC_020931	GT	3	6	364708	364713	0 %	50 %	50 %	0 %	478454352
8058	NC_020931	AT	3	6	364716	364721	50 %	50 %	0 %	0 %	478454352
8059	NC_020931	AAT	2	6	364725	364730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_020931	TTC	2	6	364755	364760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_020931	CAA	2	6	364823	364828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_020931	AAG	2	6	364880	364885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_020931	AACAA	2	10	364906	364915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8064	NC_020931	GAA	2	6	364916	364921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_020931	GCTT	2	8	364965	364972	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8067	NC_020931	TGA	2	6	365111	365116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_020931	TCA	2	6	365165	365170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8070	NC_020931	A	6	6	365179	365184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_020931	AAAAC	2	10	365230	365239	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8072	NC_020931	TAAA	2	8	365245	365252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_020931	CTT	2	6	365314	365319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_020931	A	7	7	365492	365498	100 %	0 %	0 %	0 %	478454353
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8083	NC_020931	GAATA	2	10	365800	365809	60 %	20 %	20 %	0 %	478454353
8084	NC_020931	TCT	2	6	365867	365872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454353
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8088	NC_020931	A	6	6	366109	366114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_020931	AAG	2	6	366122	366127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_020931	AAAT	2	8	366164	366171	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_020931	ATCT	2	8	366219	366226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_020931	CT	3	6	366406	366411	0 %	50 %	0 %	50 %	478454354
8093	NC_020931	TCC	2	6	366453	366458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454354
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8097	NC_020931	GCT	2	6	366667	366672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454354
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8099	NC_020931	TC	3	6	366910	366915	0 %	50 %	0 %	50 %	478454354
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8102	NC_020931	GGA	2	6	367024	367029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454354
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8105	NC_020931	A	7	7	367164	367170	100 %	0 %	0 %	0 %	478454355
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8108	NC_020931	T	7	7	367276	367282	0 %	100 %	0 %	0 %	478454355
8109	NC_020931	TTC	2	6	367335	367340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454355
8110	NC_020931	TGC	2	6	367422	367427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454355
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8113	NC_020931	GCT	2	6	367457	367462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454355
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8115	NC_020931	TTCT	2	8	367569	367576	0 %	75 %	0 %	25 %	478454355
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8500	NC_020931	ACT	2	6	385348	385353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454368

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