MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020931	TCCT	2	8	316482	316489	0 %	50 %	0 %	50 %	478454311
7002	NC_020931	GCA	2	6	316529	316534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454311
7003	NC_020931	GGA	2	6	316554	316559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454311
7004	NC_020931	GAT	2	6	316619	316624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454311
7005	NC_020931	TCC	2	6	316631	316636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454311
7006	NC_020931	CGC	2	6	316686	316691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478454311
7007	NC_020931	TGTGT	2	10	316698	316707	0 %	60 %	40 %	0 %	478454311
7008	NC_020931	TGA	2	6	316712	316717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454311
7009	NC_020931	CAT	3	9	316820	316828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454311
7010	NC_020931	GTG	2	6	316867	316872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454311
7011	NC_020931	TGC	2	6	316931	316936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454311
7012	NC_020931	AAG	2	6	316941	316946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454311
7013	NC_020931	AAG	2	6	317008	317013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454311
7014	NC_020931	TAA	2	6	317042	317047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454311
7015	NC_020931	GGA	2	6	317180	317185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454311
7016	NC_020931	AAG	2	6	317224	317229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454311
7017	NC_020931	CG	4	8	317241	317248	0 %	0 %	50 %	50 %	478454311
7018	NC_020931	AGA	2	6	317255	317260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454311
7019	NC_020931	GTT	2	6	317265	317270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454311
7020	NC_020931	AGA	3	9	317279	317287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454311
7021	NC_020931	TGA	2	6	317339	317344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454311
7022	NC_020931	CTC	3	9	317364	317372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454312
7023	NC_020931	TAAAG	2	10	317585	317594	60 %	20 %	20 %	0 %	478454312
7024	NC_020931	GAT	2	6	317595	317600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454312
7025	NC_020931	TCC	2	6	317671	317676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454312
7026	NC_020931	TAA	2	6	317708	317713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454312
7027	NC_020931	TGT	2	6	317741	317746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454312
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7029	NC_020931	T	7	7	317845	317851	0 %	100 %	0 %	0 %	478454312
7030	NC_020931	CTT	2	6	317871	317876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454312
7031	NC_020931	CTC	2	6	318021	318026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454312
7032	NC_020931	AAT	2	6	318030	318035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454312
7033	NC_020931	A	6	6	318047	318052	100 %	0 %	0 %	0 %	478454312
7034	NC_020931	CTT	2	6	318073	318078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454312
7035	NC_020931	TAA	2	6	318082	318087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454312
7036	NC_020931	ATGGA	2	10	318210	318219	40 %	20 %	40 %	0 %	478454312
7037	NC_020931	CAA	2	6	318315	318320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454312
7038	NC_020931	CTT	2	6	318337	318342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454312
7039	NC_020931	CAA	2	6	318354	318359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454312
7040	NC_020931	CTC	2	6	318372	318377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454312
7041	NC_020931	CAA	2	6	318387	318392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454312
7042	NC_020931	CAT	2	6	318461	318466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_020931	A	7	7	318473	318479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020931	A	7	7	318487	318493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_020931	GCC	2	6	318506	318511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_020931	AATT	2	8	318540	318547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_020931	A	6	6	318557	318562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_020931	TTG	2	6	318578	318583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_020931	A	6	6	318585	318590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_020931	ATA	2	6	318607	318612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_020931	TCA	2	6	318656	318661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454313
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7053	NC_020931	TGG	2	6	318845	318850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454313
7054	NC_020931	TGC	2	6	318854	318859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454313
7055	NC_020931	CCA	2	6	318883	318888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454313
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7057	NC_020931	AAAACA	2	12	318923	318934	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	478454313
7058	NC_020931	A	8	8	319078	319085	100 %	0 %	0 %	0 %	478454313
7059	NC_020931	AAG	2	6	319093	319098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454313
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7061	NC_020931	GAG	2	6	319201	319206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454313
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7063	NC_020931	GGT	2	6	319305	319310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454313
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7065	NC_020931	TA	3	6	319357	319362	50 %	50 %	0 %	0 %	478454313
7066	NC_020931	GTC	2	6	319416	319421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454313
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7079	NC_020931	ACG	2	6	319943	319948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454313
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7088	NC_020931	CT	3	6	320286	320291	0 %	50 %	0 %	50 %	478454313
7089	NC_020931	ACA	2	6	320297	320302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454313
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7091	NC_020931	AAAAAG	2	12	320352	320363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_020931	CCT	4	12	320436	320447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454314
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7095	NC_020931	TACA	2	8	320536	320543	50 %	25 %	0 %	25 %	478454314
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7109	NC_020931	ATC	2	6	321107	321112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454314
7110	NC_020931	TTCT	2	8	321143	321150	0 %	75 %	0 %	25 %	478454314
7111	NC_020931	GTT	2	6	321159	321164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454314
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7113	NC_020931	ACT	2	6	321189	321194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454314
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7119	NC_020931	T	6	6	321353	321358	0 %	100 %	0 %	0 %	478454314
7120	NC_020931	ATA	2	6	321417	321422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454314
7121	NC_020931	T	6	6	321580	321585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_020931	T	6	6	321607	321612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7124	NC_020931	AAG	2	6	321773	321778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454315
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7481	NC_020931	AT	3	6	338204	338209	50 %	50 %	0 %	0 %	478454330
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7495	NC_020931	ATG	2	6	338682	338687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454330
7496	NC_020931	A	7	7	338693	338699	100 %	0 %	0 %	0 %	478454330
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7499	NC_020931	CTTCA	2	10	338923	338932	20 %	40 %	0 %	40 %	478454330
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