MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020930	A	6	6	248907	248912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020930	GCAG	2	8	248920	248927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_020930	AG	3	6	248995	249000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020930	TAT	2	6	249018	249023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020930	ACA	2	6	249059	249064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_020930	A	6	6	249108	249113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020930	TTG	2	6	249288	249293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478447051
5508	NC_020930	TCT	2	6	249310	249315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447051
5509	NC_020930	TC	3	6	249357	249362	0 %	50 %	0 %	50 %	478447051
5510	NC_020930	T	7	7	249393	249399	0 %	100 %	0 %	0 %	478447051
5511	NC_020930	CCA	2	6	249406	249411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478447051
5512	NC_020930	AAC	2	6	249459	249464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447051
5513	NC_020930	AATA	2	8	249513	249520	75 %	25 %	0 %	0 %	478447051
5514	NC_020930	GCT	2	6	249523	249528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447051
5515	NC_020930	ACA	2	6	249588	249593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447051
5516	NC_020930	CCA	2	6	249620	249625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478447051
5517	NC_020930	CAA	2	6	249668	249673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447051
5518	NC_020930	CCCA	2	8	249793	249800	25 %	0 %	0 %	75 %	478447052
5519	NC_020930	CTT	2	6	249922	249927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447052
5520	NC_020930	AAT	2	6	250001	250006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478447052
5521	NC_020930	CTC	2	6	250012	250017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478447052
5522	NC_020930	ACT	2	6	250020	250025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478447052
5523	NC_020930	GAA	2	6	250038	250043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447052
5524	NC_020930	CTC	2	6	250069	250074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478447052
5525	NC_020930	GCAA	2	8	250083	250090	50 %	0 %	25 %	25 %	478447052
5526	NC_020930	AAC	2	6	250100	250105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447052
5527	NC_020930	GTT	2	6	250145	250150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478447052
5528	NC_020930	AAC	2	6	250184	250189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_020930	A	6	6	250198	250203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_020930	TAA	2	6	250249	250254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_020930	TTC	2	6	250267	250272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447053
5532	NC_020930	GCT	2	6	250299	250304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447053
5533	NC_020930	T	7	7	250308	250314	0 %	100 %	0 %	0 %	478447053
5534	NC_020930	AGCA	2	8	250345	250352	50 %	0 %	25 %	25 %	478447053
5535	NC_020930	CTT	2	6	250362	250367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447053
5536	NC_020930	TCT	3	9	250373	250381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447053
5537	NC_020930	GATAA	2	10	250401	250410	60 %	20 %	20 %	0 %	478447053
5538	NC_020930	TCG	2	6	250467	250472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447053
5539	NC_020930	CATA	2	8	250488	250495	50 %	25 %	0 %	25 %	478447053
5540	NC_020930	TCC	2	6	250507	250512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478447053
5541	NC_020930	TAA	2	6	250540	250545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478447053
5542	NC_020930	AG	4	8	250565	250572	50 %	0 %	50 %	0 %	478447053
5543	NC_020930	A	6	6	250584	250589	100 %	0 %	0 %	0 %	478447053
5544	NC_020930	AGA	2	6	250595	250600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447053
5545	NC_020930	CAC	2	6	250602	250607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478447053
5546	NC_020930	CAA	2	6	250648	250653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447053
5547	NC_020930	GTA	2	6	250670	250675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478447053
5548	NC_020930	ACA	2	6	250729	250734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447053
5549	NC_020930	A	6	6	250769	250774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020930	TA	3	6	250816	250821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020930	CCAA	2	8	250851	250858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_020930	A	7	7	250875	250881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020930	TAT	2	6	250894	250899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478447054
5554	NC_020930	TTCA	2	8	250926	250933	25 %	50 %	0 %	25 %	478447054
5555	NC_020930	AGA	3	9	250962	250970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447054
5556	NC_020930	TGTT	2	8	251000	251007	0 %	75 %	25 %	0 %	478447054
5557	NC_020930	CGA	2	6	251121	251126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478447054
5558	NC_020930	GCAAA	2	10	251133	251142	60 %	0 %	20 %	20 %	478447054
5559	NC_020930	AATA	2	8	251219	251226	75 %	25 %	0 %	0 %	478447054
5560	NC_020930	A	6	6	251285	251290	100 %	0 %	0 %	0 %	478447054
5561	NC_020930	A	7	7	251316	251322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_020930	ATA	2	6	251330	251335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_020930	CCT	2	6	251385	251390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_020930	AAAC	2	8	251459	251466	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_020930	AAG	2	6	251583	251588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447055
5566	NC_020930	AGC	2	6	251617	251622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478447055
5567	NC_020930	CAAT	2	8	251723	251730	50 %	25 %	0 %	25 %	478447055
5568	NC_020930	TTA	2	6	251795	251800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478447055
5569	NC_020930	CTTCT	2	10	251827	251836	0 %	60 %	0 %	40 %	478447055
5570	NC_020930	T	6	6	251870	251875	0 %	100 %	0 %	0 %	478447055
5571	NC_020930	CA	3	6	251929	251934	50 %	0 %	0 %	50 %	478447055
5572	NC_020930	AAT	2	6	251944	251949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478447055
5573	NC_020930	ACA	2	6	252020	252025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447055
5574	NC_020930	TTG	2	6	252084	252089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478447055
5575	NC_020930	AGA	2	6	252139	252144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447055
5576	NC_020930	TAG	2	6	252159	252164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478447055
5577	NC_020930	TTTTTA	2	12	252181	252192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020930	GAG	2	6	252308	252313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020930	ATT	2	6	252320	252325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478447056
5580	NC_020930	T	6	6	252324	252329	0 %	100 %	0 %	0 %	478447056
5581	NC_020930	ACG	2	6	252330	252335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478447056
5582	NC_020930	CCTGCA	2	12	252341	252352	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478447056
5583	NC_020930	CTG	2	6	252398	252403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447056
5584	NC_020930	TTG	2	6	252429	252434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478447056
5585	NC_020930	TCTG	2	8	252454	252461	0 %	50 %	25 %	25 %	478447056
5586	NC_020930	TCC	2	6	252484	252489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478447056
5587	NC_020930	TTG	2	6	252503	252508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478447056
5588	NC_020930	T	6	6	252536	252541	0 %	100 %	0 %	0 %	478447056
5589	NC_020930	TACT	2	8	252559	252566	25 %	50 %	0 %	25 %	478447056
5590	NC_020930	CGA	2	6	252574	252579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478447056
5591	NC_020930	TTC	2	6	252621	252626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447056
5592	NC_020930	CTC	2	6	252633	252638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478447056
5593	NC_020930	ACG	2	6	252681	252686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478447056
5594	NC_020930	AACC	2	8	252725	252732	50 %	0 %	0 %	50 %	478447056
5595	NC_020930	CAG	2	6	252749	252754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478447056
5596	NC_020930	AAG	2	6	252758	252763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447056
5597	NC_020930	CTG	2	6	252782	252787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447056
5598	NC_020930	TAA	2	6	252824	252829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478447056
5599	NC_020930	GCT	2	6	252910	252915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447056
5600	NC_020930	ATTT	2	8	252967	252974	25 %	75 %	0 %	0 %	478447056
5601	NC_020930	ATA	2	6	253021	253026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_020930	AAT	2	6	253045	253050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_020930	AG	3	6	253107	253112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_020930	A	8	8	253125	253132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020930	TC	3	6	253133	253138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_020930	TC	3	6	253219	253224	0 %	50 %	0 %	50 %	478447057
5607	NC_020930	A	6	6	253228	253233	100 %	0 %	0 %	0 %	478447057
5608	NC_020930	ATG	2	6	253239	253244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478447057
5609	NC_020930	ATCT	2	8	253288	253295	25 %	50 %	0 %	25 %	478447057
5610	NC_020930	T	7	7	253330	253336	0 %	100 %	0 %	0 %	478447057
5611	NC_020930	GCT	2	6	253340	253345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447057
5612	NC_020930	CTT	2	6	253350	253355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447057
5613	NC_020930	T	6	6	253371	253376	0 %	100 %	0 %	0 %	478447057
5614	NC_020930	CT	4	8	253439	253446	0 %	50 %	0 %	50 %	478447057
5615	NC_020930	TTA	2	6	253504	253509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478447057
5616	NC_020930	GCC	2	6	253638	253643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478447057
5617	NC_020930	TTCG	2	8	253701	253708	0 %	50 %	25 %	25 %	478447057
5618	NC_020930	CTT	2	6	253737	253742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447057
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5620	NC_020930	TTC	2	6	253900	253905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447057
5621	NC_020930	CTT	2	6	253908	253913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447057
5622	NC_020930	TC	3	6	253930	253935	0 %	50 %	0 %	50 %	478447057
5623	NC_020930	TCT	2	6	253992	253997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478447057
5624	NC_020930	CAA	2	6	254053	254058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478447057
5625	NC_020930	GTTTT	2	10	254065	254074	0 %	80 %	20 %	0 %	478447057
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5627	NC_020930	CATT	2	8	254113	254120	25 %	50 %	0 %	25 %	478447057
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