MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020929	TGA	2	6	316142	316147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451606
7002	NC_020929	AGA	2	6	316150	316155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451606
7003	NC_020929	ACA	2	6	316184	316189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451606
7004	NC_020929	GAA	2	6	316206	316211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451606
7005	NC_020929	TGA	2	6	316226	316231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451606
7006	NC_020929	AGT	2	6	316247	316252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451606
7007	NC_020929	AAAG	2	8	316334	316341	75 %	0 %	25 %	0 %	478451606
7008	NC_020929	CGT	2	6	316386	316391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451606
7009	NC_020929	TCCT	2	8	316431	316438	0 %	50 %	0 %	50 %	478451606
7010	NC_020929	GCA	2	6	316478	316483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451606
7011	NC_020929	GGA	2	6	316503	316508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451606
7012	NC_020929	GAT	2	6	316568	316573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451606
7013	NC_020929	TCC	2	6	316580	316585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451606
7014	NC_020929	CGC	2	6	316635	316640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478451606
7015	NC_020929	TGTGT	2	10	316647	316656	0 %	60 %	40 %	0 %	478451606
7016	NC_020929	TGA	2	6	316661	316666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451606
7017	NC_020929	CAT	3	9	316769	316777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451606
7018	NC_020929	GTG	2	6	316816	316821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451606
7019	NC_020929	TGC	2	6	316880	316885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451606
7020	NC_020929	AAG	2	6	316890	316895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451606
7021	NC_020929	AAG	2	6	316957	316962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451606
7022	NC_020929	TAA	2	6	316991	316996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451606
7023	NC_020929	GGA	2	6	317129	317134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451606
7024	NC_020929	AAG	2	6	317173	317178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451606
7025	NC_020929	CG	4	8	317190	317197	0 %	0 %	50 %	50 %	478451606
7026	NC_020929	AGA	2	6	317204	317209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451606
7027	NC_020929	GTT	2	6	317214	317219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451606
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7029	NC_020929	TGA	2	6	317288	317293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451606
7030	NC_020929	CTC	3	9	317313	317321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451607
7031	NC_020929	TAAAG	2	10	317534	317543	60 %	20 %	20 %	0 %	478451607
7032	NC_020929	GAT	2	6	317544	317549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451607
7033	NC_020929	TCC	2	6	317620	317625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451607
7034	NC_020929	TAA	2	6	317657	317662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451607
7035	NC_020929	TGT	2	6	317690	317695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451607
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7037	NC_020929	T	7	7	317794	317800	0 %	100 %	0 %	0 %	478451607
7038	NC_020929	CTT	2	6	317820	317825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451607
7039	NC_020929	CTC	2	6	317970	317975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451607
7040	NC_020929	AAT	2	6	317979	317984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451607
7041	NC_020929	A	6	6	317996	318001	100 %	0 %	0 %	0 %	478451607
7042	NC_020929	CTT	2	6	318022	318027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451607
7043	NC_020929	TAA	2	6	318031	318036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451607
7044	NC_020929	ATGGA	2	10	318159	318168	40 %	20 %	40 %	0 %	478451607
7045	NC_020929	CAA	2	6	318264	318269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451607
7046	NC_020929	CTT	2	6	318286	318291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451607
7047	NC_020929	CAA	2	6	318303	318308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451607
7048	NC_020929	CTC	2	6	318321	318326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451607
7049	NC_020929	CAA	2	6	318336	318341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451607
7050	NC_020929	CAT	2	6	318410	318415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_020929	A	7	7	318422	318428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_020929	A	7	7	318436	318442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_020929	GCC	2	6	318455	318460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_020929	AATT	2	8	318489	318496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_020929	A	6	6	318506	318511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_020929	TTG	2	6	318527	318532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_020929	A	7	7	318534	318540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_020929	ATA	2	6	318557	318562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_020929	TCA	2	6	318606	318611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451608
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7061	NC_020929	TGG	2	6	318795	318800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451608
7062	NC_020929	TGC	2	6	318804	318809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451608
7063	NC_020929	CCA	2	6	318833	318838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451608
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7067	NC_020929	AAG	2	6	319043	319048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451608
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7069	NC_020929	GAG	2	6	319151	319156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451608
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7073	NC_020929	TA	3	6	319307	319312	50 %	50 %	0 %	0 %	478451608
7074	NC_020929	GTC	2	6	319366	319371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451608
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7084	NC_020929	TAA	2	6	319782	319787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451608
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7087	NC_020929	ACG	2	6	319893	319898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451608
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7093	NC_020929	GGC	2	6	320115	320120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478451608
7094	NC_020929	ATG	2	6	320185	320190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451608
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7096	NC_020929	CT	3	6	320236	320241	0 %	50 %	0 %	50 %	478451608
7097	NC_020929	ACA	2	6	320247	320252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451608
7098	NC_020929	TTC	2	6	320287	320292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_020929	AAAAAG	2	12	320302	320313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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7103	NC_020929	TACA	2	8	320486	320493	50 %	25 %	0 %	25 %	478451609
7104	NC_020929	AAG	2	6	320528	320533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451609
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7106	NC_020929	TGA	2	6	320572	320577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451609
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7109	NC_020929	TCA	2	6	320695	320700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451609
7110	NC_020929	CAT	2	6	320816	320821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451609
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7112	NC_020929	TCT	2	6	320944	320949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451609
7113	NC_020929	AGC	3	9	320967	320975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451609
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7117	NC_020929	ATC	2	6	321057	321062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451609
7118	NC_020929	TTCT	2	8	321093	321100	0 %	75 %	0 %	25 %	478451609
7119	NC_020929	GTT	2	6	321109	321114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451609
7120	NC_020929	T	6	6	321120	321125	0 %	100 %	0 %	0 %	478451609
7121	NC_020929	ACT	2	6	321139	321144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451609
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7123	NC_020929	GCT	2	6	321191	321196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451609
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7375	NC_020929	TCT	2	6	332091	332096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451621
7376	NC_020929	CTC	2	6	332213	332218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451621
7377	NC_020929	TAA	2	6	332228	332233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451621
7378	NC_020929	CTTT	2	8	332265	332272	0 %	75 %	0 %	25 %	478451621
7379	NC_020929	AAT	2	6	332429	332434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451621
7380	NC_020929	ATAA	2	8	332481	332488	75 %	25 %	0 %	0 %	478451621
7381	NC_020929	CAA	2	6	332497	332502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451621
7382	NC_020929	TGT	2	6	332515	332520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451621
7383	NC_020929	ATC	2	6	332562	332567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451621
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7386	NC_020929	CTC	2	6	332668	332673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451621
7387	NC_020929	CCT	2	6	332680	332685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451621
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7395	NC_020929	T	6	6	333160	333165	0 %	100 %	0 %	0 %	478451621
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7403	NC_020929	GAAT	2	8	333417	333424	50 %	25 %	25 %	0 %	478451621
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7482	NC_020929	A	6	6	337666	337671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7489	NC_020929	AT	3	6	338155	338160	50 %	50 %	0 %	0 %	478451625
7490	NC_020929	AGA	2	6	338190	338195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451625
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7494	NC_020929	CTA	2	6	338323	338328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451625
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7499	NC_020929	A	6	6	338508	338513	100 %	0 %	0 %	0 %	478451625
7500	NC_020929	TGT	2	6	338517	338522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451625

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