MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_020512	AGA	2	6	634164	634169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428697
14003	NC_020512	GATA	2	8	634248	634255	50 %	25 %	25 %	0 %	478428697
14004	NC_020512	TCT	2	6	634328	634333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_020512	AT	3	6	634352	634357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_020512	A	11	11	634360	634370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_020512	T	6	6	634394	634399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_020512	A	6	6	634461	634466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_020512	CCTG	2	8	634552	634559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14010	NC_020512	GTC	2	6	634632	634637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428698
14011	NC_020512	TAA	2	6	634640	634645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428698
14012	NC_020512	A	6	6	634644	634649	100 %	0 %	0 %	0 %	478428698
14013	NC_020512	TC	3	6	634652	634657	0 %	50 %	0 %	50 %	478428698
14014	NC_020512	AAG	2	6	634711	634716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428698
14015	NC_020512	GAA	2	6	634746	634751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428698
14016	NC_020512	AGGA	2	8	634792	634799	50 %	0 %	50 %	0 %	478428698
14017	NC_020512	TTA	2	6	634831	634836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428698
14018	NC_020512	CCTC	2	8	634870	634877	0 %	25 %	0 %	75 %	478428698
14019	NC_020512	ATC	2	6	634908	634913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428698
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14021	NC_020512	A	7	7	635054	635060	100 %	0 %	0 %	0 %	478428698
14022	NC_020512	CT	3	6	635088	635093	0 %	50 %	0 %	50 %	478428698
14023	NC_020512	A	6	6	635214	635219	100 %	0 %	0 %	0 %	478428698
14024	NC_020512	ACA	2	6	635235	635240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428698
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14026	NC_020512	TCT	2	6	635302	635307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428699
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14030	NC_020512	A	6	6	635425	635430	100 %	0 %	0 %	0 %	478428699
14031	NC_020512	CCT	2	6	635490	635495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428699
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14038	NC_020512	A	6	6	635757	635762	100 %	0 %	0 %	0 %	478428699
14039	NC_020512	TCGAG	2	10	635767	635776	20 %	20 %	40 %	20 %	478428699
14040	NC_020512	T	6	6	635794	635799	0 %	100 %	0 %	0 %	478428699
14041	NC_020512	TTG	2	6	635824	635829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428699
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14044	NC_020512	ATC	2	6	635970	635975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428699
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14047	NC_020512	ATG	3	9	636090	636098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428699
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14049	NC_020512	CTA	2	6	636168	636173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428699
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14052	NC_020512	TTTG	2	8	636244	636251	0 %	75 %	25 %	0 %	478428700
14053	NC_020512	TTA	2	6	636272	636277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428700
14054	NC_020512	CTC	2	6	636294	636299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428700
14055	NC_020512	TAT	2	6	636301	636306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428700
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14059	NC_020512	TGC	2	6	636457	636462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428700
14060	NC_020512	GGCTC	2	10	636531	636540	0 %	20 %	40 %	40 %	478428701
14061	NC_020512	TA	3	6	636554	636559	50 %	50 %	0 %	0 %	478428701
14062	NC_020512	AGCC	2	8	636567	636574	25 %	0 %	25 %	50 %	478428701
14063	NC_020512	TCTT	2	8	636591	636598	0 %	75 %	0 %	25 %	478428701
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14069	NC_020512	CT	3	6	636901	636906	0 %	50 %	0 %	50 %	478428701
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14087	NC_020512	TGC	2	6	637478	637483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428702
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14092	NC_020512	TG	3	6	637801	637806	0 %	50 %	50 %	0 %	478428702
14093	NC_020512	GAG	2	6	637862	637867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428702
14094	NC_020512	CT	3	6	637868	637873	0 %	50 %	0 %	50 %	478428702
14095	NC_020512	T	7	7	637907	637913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_020512	ATTAA	2	10	637920	637929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_020512	A	6	6	637974	637979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14102	NC_020512	GCA	2	6	638195	638200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428703
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14104	NC_020512	CG	3	6	638237	638242	0 %	0 %	50 %	50 %	478428703
14105	NC_020512	GAA	2	6	638310	638315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428703
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14109	NC_020512	AGCA	2	8	638518	638525	50 %	0 %	25 %	25 %	478428703
14110	NC_020512	GAA	2	6	638618	638623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428703
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14123	NC_020512	TCCAT	2	10	639101	639110	20 %	40 %	0 %	40 %	478428704
14124	NC_020512	AGAA	2	8	639111	639118	75 %	0 %	25 %	0 %	478428704
14125	NC_020512	CCT	2	6	639152	639157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428704
14126	NC_020512	CT	3	6	639156	639161	0 %	50 %	0 %	50 %	478428704
14127	NC_020512	CTA	2	6	639170	639175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428704
14128	NC_020512	GAAA	2	8	639264	639271	75 %	0 %	25 %	0 %	478428704
14129	NC_020512	A	6	6	639269	639274	100 %	0 %	0 %	0 %	478428704
14130	NC_020512	CTCTTT	2	12	639372	639383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428704
14131	NC_020512	ATATCC	2	12	639389	639400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428704
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14150	NC_020512	AAG	2	6	640002	640007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428706
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14154	NC_020512	CAC	2	6	640051	640056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428706
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14161	NC_020512	TTC	2	6	640297	640302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14162	NC_020512	CCT	2	6	640311	640316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14190	NC_020512	CCT	2	6	641501	641506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14191	NC_020512	CGGAA	2	10	641717	641726	40 %	0 %	40 %	20 %	478428708
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14236	NC_020512	T	7	7	643872	643878	0 %	100 %	0 %	0 %	478428709
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14238	NC_020512	ATCTTG	2	12	643904	643915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478428709
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14244	NC_020512	AGCG	2	8	644285	644292	25 %	0 %	50 %	25 %	478428709
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14247	NC_020512	TCT	2	6	644360	644365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
14248	NC_020512	GCT	2	6	644372	644377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428709
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14293	NC_020512	A	8	8	646575	646582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14296	NC_020512	A	7	7	646612	646618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14311	NC_020512	TCA	2	6	647564	647569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428711
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14356	NC_020512	CCT	2	6	649546	649551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14357	NC_020512	A	7	7	649556	649562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14358	NC_020512	AC	3	6	649576	649581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14362	NC_020512	TAG	2	6	649700	649705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14363	NC_020512	TTATTT	2	12	649713	649724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14365	NC_020512	TCT	2	6	649754	649759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428713
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14368	NC_020512	TAA	2	6	649789	649794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428713
14369	NC_020512	A	6	6	649793	649798	100 %	0 %	0 %	0 %	478428713
14370	NC_020512	TGC	2	6	649822	649827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428713
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14372	NC_020512	TC	3	6	649957	649962	0 %	50 %	0 %	50 %	478428713
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14375	NC_020512	TAC	2	6	650189	650194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428713
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14384	NC_020512	A	6	6	650463	650468	100 %	0 %	0 %	0 %	478428714
14385	NC_020512	CAAG	2	8	650477	650484	50 %	0 %	25 %	25 %	478428714
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14476	NC_020512	TTG	2	6	654778	654783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14478	NC_020512	A	7	7	654831	654837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_020512	A	6	6	654847	654852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14480	NC_020512	TA	3	6	654870	654875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14481	NC_020512	CTC	2	6	654891	654896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14482	NC_020512	T	6	6	655014	655019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14483	NC_020512	AAG	2	6	655057	655062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428718
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14488	NC_020512	CTA	2	6	655331	655336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428718
14489	NC_020512	GAA	2	6	655362	655367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428718
14490	NC_020512	AGA	2	6	655406	655411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428718
14491	NC_020512	GCT	2	6	655452	655457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428718
14492	NC_020512	GAA	2	6	655512	655517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428718
14493	NC_020512	CCTT	2	8	655574	655581	0 %	50 %	0 %	50 %	478428718
14494	NC_020512	TCT	2	6	655620	655625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428718
14495	NC_020512	AT	3	6	655668	655673	50 %	50 %	0 %	0 %	478428718
14496	NC_020512	TCA	2	6	655715	655720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428718
14497	NC_020512	AGA	2	6	655724	655729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428718
14498	NC_020512	A	7	7	655733	655739	100 %	0 %	0 %	0 %	478428718
14499	NC_020512	TC	3	6	655777	655782	0 %	50 %	0 %	50 %	478428718
14500	NC_020512	CTG	2	6	655795	655800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428718

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