MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020512	GAC	2	6	612046	612051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_020512	TAC	2	6	612054	612059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_020512	ATG	2	6	612071	612076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_020512	A	6	6	612106	612111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_020512	AC	3	6	612179	612184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13506	NC_020512	CCT	2	6	612231	612236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428681
13507	NC_020512	TCT	2	6	612304	612309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428681
13508	NC_020512	TTC	2	6	612333	612338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428681
13509	NC_020512	TGCCA	2	10	612365	612374	20 %	20 %	20 %	40 %	478428681
13510	NC_020512	GTA	2	6	612424	612429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428681
13511	NC_020512	CT	3	6	612430	612435	0 %	50 %	0 %	50 %	478428681
13512	NC_020512	GATT	2	8	612514	612521	25 %	50 %	25 %	0 %	478428681
13513	NC_020512	TCT	2	6	612541	612546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428681
13514	NC_020512	TC	3	6	612551	612556	0 %	50 %	0 %	50 %	478428681
13515	NC_020512	GGTT	2	8	612597	612604	0 %	50 %	50 %	0 %	478428681
13516	NC_020512	GGATGG	2	12	612609	612620	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478428681
13517	NC_020512	AG	4	8	612662	612669	50 %	0 %	50 %	0 %	478428681
13518	NC_020512	TGG	2	6	612675	612680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428681
13519	NC_020512	ATA	2	6	612700	612705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428681
13520	NC_020512	GGCGC	2	10	612760	612769	0 %	0 %	60 %	40 %	478428681
13521	NC_020512	ATT	2	6	612786	612791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428681
13522	NC_020512	TAT	2	6	612794	612799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428681
13523	NC_020512	ATCG	2	8	612816	612823	25 %	25 %	25 %	25 %	478428681
13524	NC_020512	AGA	2	6	612878	612883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428681
13525	NC_020512	GAA	2	6	612900	612905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428681
13526	NC_020512	AG	3	6	612939	612944	50 %	0 %	50 %	0 %	478428681
13527	NC_020512	CT	3	6	612945	612950	0 %	50 %	0 %	50 %	478428681
13528	NC_020512	TTAC	2	8	612967	612974	25 %	50 %	0 %	25 %	478428681
13529	NC_020512	TAA	2	6	612983	612988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428681
13530	NC_020512	CCT	2	6	613012	613017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428681
13531	NC_020512	TTTA	2	8	613020	613027	25 %	75 %	0 %	0 %	478428681
13532	NC_020512	CT	3	6	613060	613065	0 %	50 %	0 %	50 %	478428681
13533	NC_020512	ATT	2	6	613084	613089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428681
13534	NC_020512	TTTG	2	8	613118	613125	0 %	75 %	25 %	0 %	478428681
13535	NC_020512	ATT	2	6	613136	613141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428681
13536	NC_020512	GGCT	2	8	613158	613165	0 %	25 %	50 %	25 %	478428681
13537	NC_020512	TCT	2	6	613210	613215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428681
13538	NC_020512	ATT	2	6	613223	613228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428681
13539	NC_020512	TGG	2	6	613272	613277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428681
13540	NC_020512	T	6	6	613307	613312	0 %	100 %	0 %	0 %	478428681
13541	NC_020512	ATG	2	6	613329	613334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428681
13542	NC_020512	ATTGG	2	10	613335	613344	20 %	40 %	40 %	0 %	478428681
13543	NC_020512	A	6	6	613365	613370	100 %	0 %	0 %	0 %	478428681
13544	NC_020512	AGC	2	6	613418	613423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428681
13545	NC_020512	TTG	2	6	613480	613485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428681
13546	NC_020512	TCAA	2	8	613645	613652	50 %	25 %	0 %	25 %	478428682
13547	NC_020512	TTG	2	6	613658	613663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428682
13548	NC_020512	CGCT	2	8	613691	613698	0 %	25 %	25 %	50 %	478428682
13549	NC_020512	TTTG	2	8	613716	613723	0 %	75 %	25 %	0 %	478428682
13550	NC_020512	ATC	2	6	613771	613776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428682
13551	NC_020512	A	9	9	613816	613824	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13552	NC_020512	CTT	2	6	613858	613863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428682
13553	NC_020512	GAA	2	6	613873	613878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
13554	NC_020512	TTTG	2	8	613892	613899	0 %	75 %	25 %	0 %	478428682
13555	NC_020512	CTCTC	2	10	613900	613909	0 %	40 %	0 %	60 %	478428682
13556	NC_020512	ATAG	2	8	613945	613952	50 %	25 %	25 %	0 %	478428682
13557	NC_020512	GAA	2	6	614038	614043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
13558	NC_020512	AAG	2	6	614084	614089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
13559	NC_020512	AGA	2	6	614124	614129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
13560	NC_020512	GAA	2	6	614146	614151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
13561	NC_020512	AAAAC	2	10	614160	614169	80 %	0 %	0 %	20 %	478428682
13562	NC_020512	AAC	2	6	614189	614194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428682
13563	NC_020512	GCTC	2	8	614289	614296	0 %	25 %	25 %	50 %	478428682
13564	NC_020512	AG	3	6	614323	614328	50 %	0 %	50 %	0 %	478428682
13565	NC_020512	TAG	2	6	614388	614393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428682
13566	NC_020512	ATTTT	2	10	614397	614406	20 %	80 %	0 %	0 %	478428682
13567	NC_020512	GCA	2	6	614437	614442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428682
13568	NC_020512	CTATC	2	10	614517	614526	20 %	40 %	0 %	40 %	478428682
13569	NC_020512	A	8	8	614546	614553	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13570	NC_020512	AGA	2	6	614565	614570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
13571	NC_020512	CTT	2	6	614595	614600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428682
13572	NC_020512	AGA	2	6	614601	614606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
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13574	NC_020512	TAT	3	9	614727	614735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428682
13575	NC_020512	ATT	2	6	614776	614781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428682
13576	NC_020512	TTC	2	6	614896	614901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428682
13577	NC_020512	TCA	2	6	614909	614914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428682
13578	NC_020512	CGATAT	3	18	614937	614954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478428682
13579	NC_020512	AG	3	6	614968	614973	50 %	0 %	50 %	0 %	478428682
13580	NC_020512	TTA	2	6	614978	614983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428682
13581	NC_020512	ATT	2	6	615025	615030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428682
13582	NC_020512	TGTA	2	8	615185	615192	25 %	50 %	25 %	0 %	478428682
13583	NC_020512	A	6	6	615229	615234	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13584	NC_020512	TGC	2	6	615267	615272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428682
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13586	NC_020512	CA	3	6	615438	615443	50 %	0 %	0 %	50 %	478428682
13587	NC_020512	A	7	7	615454	615460	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13588	NC_020512	TC	3	6	615512	615517	0 %	50 %	0 %	50 %	478428682
13589	NC_020512	TTC	2	6	615518	615523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428682
13590	NC_020512	GAA	2	6	615607	615612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
13591	NC_020512	CAT	2	6	615662	615667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428682
13592	NC_020512	CGC	2	6	615826	615831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478428682
13593	NC_020512	GA	3	6	615872	615877	50 %	0 %	50 %	0 %	478428682
13594	NC_020512	TAA	2	6	615969	615974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428682
13595	NC_020512	ACA	2	6	616009	616014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428682
13596	NC_020512	GCC	2	6	616051	616056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478428682
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13598	NC_020512	CCT	2	6	616138	616143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428682
13599	NC_020512	TTG	2	6	616244	616249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428682
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13601	NC_020512	A	7	7	616259	616265	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13602	NC_020512	A	6	6	616312	616317	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13603	NC_020512	TGG	2	6	616343	616348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428682
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13605	NC_020512	A	8	8	616433	616440	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13606	NC_020512	GCT	2	6	616444	616449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428682
13607	NC_020512	T	7	7	616465	616471	0 %	100 %	0 %	0 %	478428682
13608	NC_020512	TC	3	6	616511	616516	0 %	50 %	0 %	50 %	478428682
13609	NC_020512	GTT	2	6	616548	616553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428682
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13611	NC_020512	ACT	2	6	616711	616716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428682
13612	NC_020512	GCAGA	2	10	616729	616738	40 %	0 %	40 %	20 %	478428682
13613	NC_020512	A	6	6	616738	616743	100 %	0 %	0 %	0 %	478428682
13614	NC_020512	GAA	2	6	616831	616836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428682
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13622	NC_020512	TTAT	2	8	617107	617114	25 %	75 %	0 %	0 %	478428682
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13990	NC_020512	TCCC	2	8	633677	633684	0 %	25 %	0 %	75 %	478428697
13991	NC_020512	ATT	2	6	633699	633704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428697
13992	NC_020512	ACT	2	6	633735	633740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428697
13993	NC_020512	GCT	2	6	633779	633784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428697
13994	NC_020512	CTAC	2	8	633801	633808	25 %	25 %	0 %	50 %	478428697
13995	NC_020512	TCC	2	6	633834	633839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428697
13996	NC_020512	AGA	2	6	633849	633854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428697
13997	NC_020512	ATGCT	2	10	633881	633890	20 %	40 %	20 %	20 %	478428697
13998	NC_020512	ACGGA	2	10	634015	634024	40 %	0 %	40 %	20 %	478428697
13999	NC_020512	ATT	2	6	634034	634039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428697
14000	NC_020512	GGA	2	6	634092	634097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428697

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