MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020512	ACA	2	6	587810	587815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428647
13003	NC_020512	GGTT	2	8	587875	587882	0 %	50 %	50 %	0 %	478428647
13004	NC_020512	TTC	2	6	587918	587923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428647
13005	NC_020512	ATA	2	6	587984	587989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428647
13006	NC_020512	A	6	6	588000	588005	100 %	0 %	0 %	0 %	478428647
13007	NC_020512	AAG	2	6	588057	588062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428647
13008	NC_020512	GAAA	2	8	588071	588078	75 %	0 %	25 %	0 %	478428647
13009	NC_020512	CCT	2	6	588173	588178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428647
13010	NC_020512	CT	3	6	588184	588189	0 %	50 %	0 %	50 %	478428647
13011	NC_020512	AAT	2	6	588196	588201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428647
13012	NC_020512	AAT	2	6	588241	588246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428647
13013	NC_020512	GGAA	2	8	588367	588374	50 %	0 %	50 %	0 %	478428647
13014	NC_020512	TGT	2	6	588472	588477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428647
13015	NC_020512	AAATA	2	10	588497	588506	80 %	20 %	0 %	0 %	478428647
13016	NC_020512	ACA	2	6	588534	588539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428647
13017	NC_020512	AAC	2	6	588562	588567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428647
13018	NC_020512	ATTC	2	8	588571	588578	25 %	50 %	0 %	25 %	478428647
13019	NC_020512	AAG	2	6	588718	588723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428647
13020	NC_020512	AAC	2	6	588754	588759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428647
13021	NC_020512	A	6	6	588801	588806	100 %	0 %	0 %	0 %	478428647
13022	NC_020512	GCAA	2	8	588920	588927	50 %	0 %	25 %	25 %	478428647
13023	NC_020512	T	6	6	588945	588950	0 %	100 %	0 %	0 %	478428647
13024	NC_020512	GCA	2	6	589062	589067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428648
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13026	NC_020512	TCTT	2	8	589145	589152	0 %	75 %	0 %	25 %	478428648
13027	NC_020512	GTTGT	2	10	589204	589213	0 %	60 %	40 %	0 %	478428648
13028	NC_020512	TTC	2	6	589217	589222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428648
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13030	NC_020512	TTC	2	6	589402	589407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428648
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13033	NC_020512	ATT	2	6	589536	589541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428649
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13036	NC_020512	T	6	6	589726	589731	0 %	100 %	0 %	0 %	478428649
13037	NC_020512	AGC	2	6	589734	589739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428649
13038	NC_020512	AAACT	2	10	589837	589846	60 %	20 %	0 %	20 %	478428649
13039	NC_020512	CCT	2	6	589852	589857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428649
13040	NC_020512	AAC	2	6	589860	589865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428649
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13044	NC_020512	CTA	2	6	589999	590004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428650
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13047	NC_020512	CAT	2	6	590182	590187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428650
13048	NC_020512	TA	3	6	590308	590313	50 %	50 %	0 %	0 %	478428650
13049	NC_020512	T	6	6	590351	590356	0 %	100 %	0 %	0 %	478428651
13050	NC_020512	GCT	2	6	590367	590372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428651
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13052	NC_020512	AACT	2	8	590474	590481	50 %	25 %	0 %	25 %	478428651
13053	NC_020512	GTCT	2	8	590716	590723	0 %	50 %	25 %	25 %	478428651
13054	NC_020512	AACA	2	8	590744	590751	75 %	0 %	0 %	25 %	478428651
13055	NC_020512	CTT	2	6	590779	590784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428651
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13057	NC_020512	ACCAA	2	10	590929	590938	60 %	0 %	0 %	40 %	478428652
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13062	NC_020512	TCT	2	6	591165	591170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428652
13063	NC_020512	TGC	2	6	591198	591203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428652
13064	NC_020512	CTT	2	6	591355	591360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428653
13065	NC_020512	ATTC	2	8	591433	591440	25 %	50 %	0 %	25 %	478428653
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13067	NC_020512	CATA	2	8	591597	591604	50 %	25 %	0 %	25 %	478428653
13068	NC_020512	TTA	2	6	591780	591785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428653
13069	NC_020512	TCT	2	6	591789	591794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428653
13070	NC_020512	TCTT	2	8	591846	591853	0 %	75 %	0 %	25 %	478428653
13071	NC_020512	TA	3	6	591864	591869	50 %	50 %	0 %	0 %	478428653
13072	NC_020512	T	7	7	591871	591877	0 %	100 %	0 %	0 %	478428653
13073	NC_020512	TC	5	10	591899	591908	0 %	50 %	0 %	50 %	478428654
13074	NC_020512	GAA	2	6	591924	591929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428654
13075	NC_020512	ACGT	2	8	592016	592023	25 %	25 %	25 %	25 %	478428654
13076	NC_020512	GAG	2	6	592036	592041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428654
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13084	NC_020512	ATCAC	2	10	592491	592500	40 %	20 %	0 %	40 %	478428655
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13088	NC_020512	CTT	2	6	592700	592705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428656
13089	NC_020512	ATA	2	6	592728	592733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428656
13090	NC_020512	ACC	2	6	592750	592755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428656
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13092	NC_020512	T	6	6	592805	592810	0 %	100 %	0 %	0 %	478428656
13093	NC_020512	TGA	2	6	592818	592823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428656
13094	NC_020512	ACT	2	6	592825	592830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428656
13095	NC_020512	T	7	7	592886	592892	0 %	100 %	0 %	0 %	478428657
13096	NC_020512	TGA	2	6	592943	592948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428657
13097	NC_020512	AGC	2	6	592972	592977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428657
13098	NC_020512	CGCA	2	8	592981	592988	25 %	0 %	25 %	50 %	478428657
13099	NC_020512	AG	3	6	592995	593000	50 %	0 %	50 %	0 %	478428657
13100	NC_020512	T	6	6	593002	593007	0 %	100 %	0 %	0 %	478428657
13101	NC_020512	TC	3	6	593046	593051	0 %	50 %	0 %	50 %	478428657
13102	NC_020512	TAA	2	6	593062	593067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428657
13103	NC_020512	T	6	6	593072	593077	0 %	100 %	0 %	0 %	478428657
13104	NC_020512	GCA	2	6	593136	593141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428658
13105	NC_020512	TCT	2	6	593166	593171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428658
13106	NC_020512	ACA	2	6	593214	593219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428658
13107	NC_020512	CAG	2	6	593266	593271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428658
13108	NC_020512	T	6	6	593273	593278	0 %	100 %	0 %	0 %	478428658
13109	NC_020512	GGC	2	6	593368	593373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428658
13110	NC_020512	ATCC	2	8	593379	593386	25 %	25 %	0 %	50 %	478428658
13111	NC_020512	CAA	2	6	593422	593427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428658
13112	NC_020512	CTG	2	6	593465	593470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428658
13113	NC_020512	ATA	2	6	593502	593507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428658
13114	NC_020512	CA	3	6	593511	593516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13115	NC_020512	GCA	2	6	593540	593545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428659
13116	NC_020512	CTT	2	6	593572	593577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428659
13117	NC_020512	AGT	2	6	593620	593625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428659
13118	NC_020512	CCGA	2	8	593700	593707	25 %	0 %	25 %	50 %	478428659
13119	NC_020512	GAAA	2	8	593806	593813	75 %	0 %	25 %	0 %	478428659
13120	NC_020512	CGA	2	6	593847	593852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428659
13121	NC_020512	TTC	2	6	593957	593962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428659
13122	NC_020512	AAC	2	6	594025	594030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428659
13123	NC_020512	GCA	2	6	594038	594043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428659
13124	NC_020512	AAG	2	6	594051	594056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428659
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13128	NC_020512	CAA	2	6	594222	594227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428660
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13130	NC_020512	CAA	2	6	594453	594458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428660
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13159	NC_020512	CAA	2	6	595729	595734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428663
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13204	NC_020512	A	6	6	597827	597832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13226	NC_020512	ACA	2	6	598486	598491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428666
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13231	NC_020512	ACCT	2	8	598738	598745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13232	NC_020512	TACA	2	8	598760	598767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13233	NC_020512	AG	3	6	598774	598779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13234	NC_020512	GCA	2	6	598821	598826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13235	NC_020512	A	6	6	598860	598865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13236	NC_020512	T	6	6	598894	598899	0 %	100 %	0 %	0 %	478428667
13237	NC_020512	AACC	2	8	598913	598920	50 %	0 %	0 %	50 %	478428667
13238	NC_020512	A	7	7	598934	598940	100 %	0 %	0 %	0 %	478428667
13239	NC_020512	AG	3	6	599090	599095	50 %	0 %	50 %	0 %	478428667
13240	NC_020512	GATA	2	8	599127	599134	50 %	25 %	25 %	0 %	478428667
13241	NC_020512	TCCC	2	8	599212	599219	0 %	25 %	0 %	75 %	478428667
13242	NC_020512	CCA	2	6	599325	599330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428667
13243	NC_020512	GGC	2	6	599333	599338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428667
13244	NC_020512	C	6	6	599354	599359	0 %	0 %	0 %	100 %	478428667
13245	NC_020512	ATCC	2	8	599414	599421	25 %	25 %	0 %	50 %	478428667
13246	NC_020512	CAGA	2	8	599449	599456	50 %	0 %	25 %	25 %	478428667
13247	NC_020512	CCAT	2	8	599463	599470	25 %	25 %	0 %	50 %	478428667
13248	NC_020512	GCT	2	6	599490	599495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428667
13249	NC_020512	GTA	2	6	599509	599514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428667
13250	NC_020512	AAC	2	6	599533	599538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428667
13251	NC_020512	CGA	2	6	599587	599592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428667
13252	NC_020512	AAC	2	6	599753	599758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428667
13253	NC_020512	CTT	2	6	599858	599863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428668
13254	NC_020512	T	6	6	599862	599867	0 %	100 %	0 %	0 %	478428668
13255	NC_020512	CT	4	8	599906	599913	0 %	50 %	0 %	50 %	478428668
13256	NC_020512	TCT	2	6	599980	599985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428668
13257	NC_020512	GCC	2	6	600080	600085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478428668
13258	NC_020512	ACG	2	6	600159	600164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428668
13259	NC_020512	CACC	2	8	600221	600228	25 %	0 %	0 %	75 %	478428668
13260	NC_020512	ACA	2	6	600295	600300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428668
13261	NC_020512	TG	3	6	600320	600325	0 %	50 %	50 %	0 %	478428668
13262	NC_020512	ATT	2	6	600354	600359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428668
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13264	NC_020512	CAA	2	6	600440	600445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428668
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13266	NC_020512	TGT	2	6	600510	600515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428668
13267	NC_020512	AT	3	6	600544	600549	50 %	50 %	0 %	0 %	478428668
13268	NC_020512	CAT	2	6	600569	600574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428668
13269	NC_020512	T	6	6	600592	600597	0 %	100 %	0 %	0 %	478428668
13270	NC_020512	ATT	2	6	600624	600629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428668
13271	NC_020512	T	6	6	600704	600709	0 %	100 %	0 %	0 %	478428669
13272	NC_020512	AAC	2	6	600921	600926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428669
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13275	NC_020512	AAGA	2	8	601063	601070	75 %	0 %	25 %	0 %	478428669
13276	NC_020512	CCA	2	6	601078	601083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428669
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13278	NC_020512	TGC	2	6	601172	601177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428670
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13280	NC_020512	A	6	6	601250	601255	100 %	0 %	0 %	0 %	478428670
13281	NC_020512	TCA	2	6	601313	601318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428670
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13283	NC_020512	CCT	2	6	601388	601393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428670
13284	NC_020512	TTC	2	6	601474	601479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428670
13285	NC_020512	TGC	2	6	601570	601575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428670
13286	NC_020512	CTGATA	2	12	601588	601599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478428670
13287	NC_020512	CTGCTC	2	12	601636	601647	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	478428670
13288	NC_020512	CCTG	2	8	601655	601662	0 %	25 %	25 %	50 %	478428670
13289	NC_020512	ATT	2	6	601738	601743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428670
13290	NC_020512	CAA	2	6	601768	601773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428670
13291	NC_020512	GA	3	6	601884	601889	50 %	0 %	50 %	0 %	478428670
13292	NC_020512	TAT	2	6	602038	602043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13293	NC_020512	T	12	12	602046	602057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13294	NC_020512	AGCA	2	8	602058	602065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13295	NC_020512	A	6	6	602075	602080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13296	NC_020512	TAC	2	6	602082	602087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13297	NC_020512	A	7	7	602113	602119	100 %	0 %	0 %	0 %	478428671
13298	NC_020512	TGG	2	6	602126	602131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428671
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13300	NC_020512	GCA	2	6	602337	602342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428671
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13302	NC_020512	TTG	2	6	602480	602485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428671
13303	NC_020512	CAG	2	6	602734	602739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428671
13304	NC_020512	ATCCA	2	10	602829	602838	40 %	20 %	0 %	40 %	478428671
13305	NC_020512	ACTT	2	8	602942	602949	25 %	50 %	0 %	25 %	478428671
13306	NC_020512	AAACC	2	10	602998	603007	60 %	0 %	0 %	40 %	478428671
13307	NC_020512	TCC	2	6	603028	603033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428671
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13309	NC_020512	CTT	2	6	603104	603109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428671
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13312	NC_020512	AT	3	6	603214	603219	50 %	50 %	0 %	0 %	478428671
13313	NC_020512	GCA	2	6	603222	603227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428671
13314	NC_020512	A	6	6	603257	603262	100 %	0 %	0 %	0 %	478428671
13315	NC_020512	GCCA	2	8	603301	603308	25 %	0 %	25 %	50 %	478428671
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13317	NC_020512	TTGC	2	8	603404	603411	0 %	50 %	25 %	25 %	478428671
13318	NC_020512	ACA	2	6	603413	603418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428671
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13320	NC_020512	CAAA	2	8	603480	603487	75 %	0 %	0 %	25 %	478428671
13321	NC_020512	AGTCCA	2	12	603548	603559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478428671
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13325	NC_020512	AAC	2	6	603653	603658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428671
13326	NC_020512	ACA	2	6	603666	603671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428671
13327	NC_020512	GAT	2	6	603713	603718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428671
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13329	NC_020512	TTC	2	6	603857	603862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428672
13330	NC_020512	AAAGT	2	10	603924	603933	60 %	20 %	20 %	0 %	478428672
13331	NC_020512	GCA	2	6	604034	604039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428672
13332	NC_020512	TCA	2	6	604159	604164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428672
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13334	NC_020512	T	6	6	604250	604255	0 %	100 %	0 %	0 %	478428672
13335	NC_020512	TCT	2	6	604263	604268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428672
13336	NC_020512	TTA	2	6	604269	604274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428672
13337	NC_020512	TCCT	2	8	604275	604282	0 %	50 %	0 %	50 %	478428672
13338	NC_020512	TAG	2	6	604377	604382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13339	NC_020512	AGA	2	6	604392	604397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13340	NC_020512	GGA	2	6	604415	604420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13341	NC_020512	GTT	2	6	604439	604444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428673
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13343	NC_020512	AAC	2	6	604566	604571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428673
13344	NC_020512	TG	3	6	604627	604632	0 %	50 %	50 %	0 %	478428673
13345	NC_020512	CATT	2	8	604684	604691	25 %	50 %	0 %	25 %	478428673
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13349	NC_020512	TATC	2	8	604804	604811	25 %	50 %	0 %	25 %	478428673
13350	NC_020512	ATG	2	6	604817	604822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428673
13351	NC_020512	CGA	2	6	604897	604902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428673
13352	NC_020512	CTG	2	6	605008	605013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428673
13353	NC_020512	GCTC	2	8	605019	605026	0 %	25 %	25 %	50 %	478428673
13354	NC_020512	AAT	2	6	605054	605059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428673
13355	NC_020512	TCA	2	6	605061	605066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428673
13356	NC_020512	GCA	2	6	605082	605087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428673
13357	NC_020512	T	6	6	605106	605111	0 %	100 %	0 %	0 %	478428673
13358	NC_020512	GTT	2	6	605124	605129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428673
13359	NC_020512	AAAC	2	8	605139	605146	75 %	0 %	0 %	25 %	478428673
13360	NC_020512	A	6	6	605192	605197	100 %	0 %	0 %	0 %	478428674
13361	NC_020512	TACT	2	8	605227	605234	25 %	50 %	0 %	25 %	478428674
13362	NC_020512	AGCG	2	8	605253	605260	25 %	0 %	50 %	25 %	478428674
13363	NC_020512	CA	3	6	605267	605272	50 %	0 %	0 %	50 %	478428674
13364	NC_020512	TCT	2	6	605334	605339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428674
13365	NC_020512	ATA	2	6	605551	605556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428674
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13492	NC_020512	ACC	2	6	611850	611855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13493	NC_020512	ACT	2	6	611881	611886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13494	NC_020512	TC	3	6	611904	611909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13495	NC_020512	ATT	2	6	611911	611916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_020512	AC	3	6	611928	611933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13497	NC_020512	ATCC	2	8	611948	611955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13498	NC_020512	CGC	2	6	611961	611966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13499	NC_020512	CT	3	6	611984	611989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13500	NC_020512	TCT	2	6	612009	612014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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