MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12504	NC_020512	GAT	2	6	565967	565972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428625
12505	NC_020512	AAC	2	6	565985	565990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428625
12506	NC_020512	CAG	2	6	566061	566066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428625
12507	NC_020512	TCA	2	6	566070	566075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428625
12508	NC_020512	CAT	2	6	566150	566155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428625
12509	NC_020512	CA	3	6	566248	566253	50 %	0 %	0 %	50 %	478428625
12510	NC_020512	AAT	2	6	566282	566287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428625
12511	NC_020512	GAT	2	6	566299	566304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428625
12512	NC_020512	C	6	6	566324	566329	0 %	0 %	0 %	100 %	478428625
12513	NC_020512	TCA	2	6	566331	566336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428625
12514	NC_020512	TGT	2	6	566356	566361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428625
12515	NC_020512	TAA	2	6	566397	566402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428625
12516	NC_020512	CGT	2	6	566434	566439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428625
12517	NC_020512	ATC	2	6	566498	566503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428625
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12519	NC_020512	T	6	6	566603	566608	0 %	100 %	0 %	0 %	478428625
12520	NC_020512	ATCA	2	8	566672	566679	50 %	25 %	0 %	25 %	478428625
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12529	NC_020512	CCA	2	6	567260	567265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12532	NC_020512	A	6	6	567294	567299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_020512	ACAA	2	8	567305	567312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12534	NC_020512	ATT	2	6	567320	567325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020512	A	6	6	567334	567339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020512	ATTTT	2	10	567343	567352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_020512	AAAAAT	2	12	567363	567374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_020512	A	6	6	567389	567394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_020512	TTG	2	6	567458	567463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428626
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12542	NC_020512	CTA	2	6	567607	567612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428626
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12554	NC_020512	GAG	2	6	568419	568424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428627
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12559	NC_020512	TCA	2	6	568811	568816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428627
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12565	NC_020512	CGA	2	6	569137	569142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428628
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12607	NC_020512	AAGCA	2	10	571238	571247	60 %	0 %	20 %	20 %	478428629
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12994	NC_020512	TTTGTT	2	12	587248	587259	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	478428646
12995	NC_020512	AAAG	2	8	587278	587285	75 %	0 %	25 %	0 %	478428646
12996	NC_020512	ACG	2	6	587346	587351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428646
12997	NC_020512	CAA	2	6	587366	587371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428646
12998	NC_020512	AT	3	6	587500	587505	50 %	50 %	0 %	0 %	478428646
12999	NC_020512	ATG	2	6	587551	587556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428646
13000	NC_020512	AGT	2	6	587583	587588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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