MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020512	TTGC	2	8	520763	520770	0 %	50 %	25 %	25 %	478428585
11502	NC_020512	AATC	2	8	520772	520779	50 %	25 %	0 %	25 %	478428585
11503	NC_020512	AGCAC	2	10	520813	520822	40 %	0 %	20 %	40 %	478428585
11504	NC_020512	TAA	2	6	520830	520835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
11505	NC_020512	AAT	2	6	520924	520929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
11506	NC_020512	AGT	2	6	521016	521021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
11507	NC_020512	GAA	2	6	521048	521053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
11508	NC_020512	GAT	2	6	521063	521068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
11509	NC_020512	TTCTG	2	10	521080	521089	0 %	60 %	20 %	20 %	478428585
11510	NC_020512	AT	3	6	521139	521144	50 %	50 %	0 %	0 %	478428585
11511	NC_020512	TTG	2	6	521205	521210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
11512	NC_020512	CA	4	8	521255	521262	50 %	0 %	0 %	50 %	478428585
11513	NC_020512	ATCC	2	8	521298	521305	25 %	25 %	0 %	50 %	478428585
11514	NC_020512	ACT	2	6	521359	521364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
11515	NC_020512	AAG	2	6	521398	521403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
11516	NC_020512	TCA	2	6	521429	521434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
11517	NC_020512	TC	4	8	521447	521454	0 %	50 %	0 %	50 %	478428585
11518	NC_020512	GAT	2	6	521526	521531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
11519	NC_020512	CAG	2	6	521574	521579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428585
11520	NC_020512	TAG	2	6	521597	521602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
11521	NC_020512	ATA	2	6	521746	521751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
11522	NC_020512	CAG	2	6	521820	521825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428585
11523	NC_020512	GTA	2	6	521859	521864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
11524	NC_020512	CAACA	2	10	521898	521907	60 %	0 %	0 %	40 %	478428585
11525	NC_020512	GA	3	6	521908	521913	50 %	0 %	50 %	0 %	478428585
11526	NC_020512	CTT	2	6	521957	521962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
11527	NC_020512	ACA	2	6	522115	522120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428585
11528	NC_020512	CTCC	2	8	522136	522143	0 %	25 %	0 %	75 %	478428585
11529	NC_020512	T	6	6	522157	522162	0 %	100 %	0 %	0 %	478428585
11530	NC_020512	CTT	2	6	522176	522181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
11531	NC_020512	TTG	2	6	522210	522215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
11532	NC_020512	CT	3	6	522372	522377	0 %	50 %	0 %	50 %	478428585
11533	NC_020512	AAG	2	6	522419	522424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
11534	NC_020512	GAG	2	6	522557	522562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428585
11535	NC_020512	CTT	2	6	522634	522639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
11536	NC_020512	AGA	2	6	522699	522704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
11537	NC_020512	CTG	2	6	522710	522715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428585
11538	NC_020512	TCA	2	6	522802	522807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
11539	NC_020512	TAA	2	6	522837	522842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
11540	NC_020512	CCT	2	6	522883	522888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428585
11541	NC_020512	TCT	2	6	523070	523075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
11542	NC_020512	TAC	2	6	523086	523091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
11543	NC_020512	TGT	2	6	523276	523281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
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11547	NC_020512	AACT	2	8	523695	523702	50 %	25 %	0 %	25 %	478428585
11548	NC_020512	AGC	2	6	523713	523718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428585
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11555	NC_020512	TGT	2	6	523912	523917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
11556	NC_020512	ATAA	2	8	524116	524123	75 %	25 %	0 %	0 %	478428585
11557	NC_020512	TTG	2	6	524126	524131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
11558	NC_020512	AAAG	2	8	524185	524192	75 %	0 %	25 %	0 %	478428585
11559	NC_020512	AAG	2	6	524207	524212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
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11564	NC_020512	TCT	2	6	524344	524349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
11565	NC_020512	TGC	2	6	524392	524397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428585
11566	NC_020512	GTAG	2	8	524557	524564	25 %	25 %	50 %	0 %	478428585
11567	NC_020512	CAAAGC	2	12	524574	524585	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478428585
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11571	NC_020512	AT	3	6	524726	524731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020512	AAAG	2	8	524739	524746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_020512	T	6	6	524787	524792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_020512	TTGGA	2	10	524810	524819	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020512	T	6	6	524833	524838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_020512	ACA	2	6	524841	524846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_020512	A	7	7	524944	524950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_020512	T	6	6	524966	524971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020512	A	7	7	525017	525023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11582	NC_020512	CAA	2	6	525139	525144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428586
11583	NC_020512	GAACT	2	10	525296	525305	40 %	20 %	20 %	20 %	478428586
11584	NC_020512	TTG	2	6	525327	525332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428586
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11586	NC_020512	A	7	7	525410	525416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_020512	CTAA	2	8	525431	525438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11588	NC_020512	AAT	2	6	525455	525460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_020512	ACTT	2	8	525465	525472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11590	NC_020512	GCT	2	6	525566	525571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_020512	CAAAA	2	10	525585	525594	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11592	NC_020512	AGA	2	6	525643	525648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020512	ATA	2	6	525677	525682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020512	CTA	2	6	525751	525756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_020512	TCCC	2	8	525914	525921	0 %	25 %	0 %	75 %	478428587
11596	NC_020512	CAT	3	9	525934	525942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428587
11597	NC_020512	TCG	2	6	525952	525957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428587
11598	NC_020512	TTG	2	6	526038	526043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428587
11599	NC_020512	ATT	2	6	526132	526137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428587
11600	NC_020512	GCA	2	6	526161	526166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428587
11601	NC_020512	CT	3	6	526169	526174	0 %	50 %	0 %	50 %	478428587
11602	NC_020512	ACA	2	6	526245	526250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428587
11603	NC_020512	CCT	2	6	526260	526265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428587
11604	NC_020512	ATTA	2	8	526307	526314	50 %	50 %	0 %	0 %	478428587
11605	NC_020512	A	7	7	526373	526379	100 %	0 %	0 %	0 %	478428587
11606	NC_020512	CAA	2	6	526589	526594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428587
11607	NC_020512	TAAA	2	8	526612	526619	75 %	25 %	0 %	0 %	478428587
11608	NC_020512	GTC	2	6	526678	526683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428588
11609	NC_020512	TTC	2	6	526691	526696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428588
11610	NC_020512	TTC	2	6	526712	526717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428588
11611	NC_020512	CTT	2	6	526759	526764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428588
11612	NC_020512	TCC	2	6	526765	526770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428588
11613	NC_020512	TTTC	2	8	526829	526836	0 %	75 %	0 %	25 %	478428588
11614	NC_020512	TTCT	2	8	526939	526946	0 %	75 %	0 %	25 %	478428588
11615	NC_020512	CTT	2	6	526947	526952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428588
11616	NC_020512	GTT	2	6	527022	527027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428588
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11618	NC_020512	TGG	2	6	527116	527121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428588
11619	NC_020512	ACA	2	6	527140	527145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428588
11620	NC_020512	CTT	2	6	527169	527174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428588
11621	NC_020512	A	6	6	527191	527196	100 %	0 %	0 %	0 %	478428588
11622	NC_020512	AGT	2	6	527229	527234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428588
11623	NC_020512	ATCT	2	8	527259	527266	25 %	50 %	0 %	25 %	478428588
11624	NC_020512	CTT	2	6	527275	527280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428588
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11723	NC_020512	A	6	6	532062	532067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11724	NC_020512	TGT	2	6	532102	532107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11725	NC_020512	TTTA	2	8	532109	532116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11989	NC_020512	CCA	2	6	543159	543164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428604
11990	NC_020512	TCA	2	6	543179	543184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428604
11991	NC_020512	TCT	2	6	543217	543222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428604
11992	NC_020512	TTTCT	2	10	543279	543288	0 %	80 %	0 %	20 %	478428604
11993	NC_020512	TC	3	6	543289	543294	0 %	50 %	0 %	50 %	478428604
11994	NC_020512	CT	3	6	543304	543309	0 %	50 %	0 %	50 %	478428604
11995	NC_020512	CTT	2	6	543320	543325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428604
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11998	NC_020512	A	6	6	543408	543413	100 %	0 %	0 %	0 %	478428604
11999	NC_020512	GAA	2	6	543433	543438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428604
12000	NC_020512	TCC	2	6	543492	543497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428604

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