MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10510	NC_020512	CTT	2	6	476644	476649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428547
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10512	NC_020512	GGT	2	6	476889	476894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428547
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10553	NC_020512	GGA	2	6	478368	478373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428547
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10600	NC_020512	CT	3	6	480664	480669	0 %	50 %	0 %	50 %	478428547
10601	NC_020512	ACTAT	2	10	480676	480685	40 %	40 %	0 %	20 %	478428547
10602	NC_020512	TCT	2	6	480739	480744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428547
10603	NC_020512	T	9	9	480856	480864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_020512	CAT	2	6	480887	480892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_020512	GTT	2	6	480898	480903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_020512	CTG	2	6	480942	480947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428548
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10616	NC_020512	ACTA	2	8	481318	481325	50 %	25 %	0 %	25 %	478428548
10617	NC_020512	CT	5	10	481342	481351	0 %	50 %	0 %	50 %	478428548
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10621	NC_020512	CTA	2	6	481487	481492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428548
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10990	NC_020512	ATT	2	6	498066	498071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428562
10991	NC_020512	ATA	2	6	498209	498214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428562
10992	NC_020512	AGC	2	6	498405	498410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428563
10993	NC_020512	TCT	2	6	498418	498423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428563
10994	NC_020512	A	7	7	498463	498469	100 %	0 %	0 %	0 %	478428563
10995	NC_020512	T	6	6	498502	498507	0 %	100 %	0 %	0 %	478428563
10996	NC_020512	CTC	2	6	498518	498523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428563
10997	NC_020512	CTA	2	6	498533	498538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428563
10998	NC_020512	AG	3	6	498540	498545	50 %	0 %	50 %	0 %	478428563
10999	NC_020512	TCTT	2	8	498546	498553	0 %	75 %	0 %	25 %	478428563
11000	NC_020512	TGC	2	6	498560	498565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428563

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