MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Cloacamonas acidaminovorans str. Evry provisional genome sequence from WWE1 candidate division

Total Repeats: 45571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_020449	TTA	2	6	2243728	2243733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45502	NC_020449	T	6	6	2243749	2243754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45503	NC_020449	A	7	7	2243792	2243798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45504	NC_020449	ATT	2	6	2243812	2243817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45505	NC_020449	TTTA	2	8	2243845	2243852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45506	NC_020449	GAA	2	6	2243857	2243862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45507	NC_020449	A	6	6	2243861	2243866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45508	NC_020449	ATGA	2	8	2243888	2243895	50 %	25 %	25 %	0 %	218962165
45509	NC_020449	GAA	2	6	2243930	2243935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218962165
45510	NC_020449	GAA	2	6	2243948	2243953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218962165
45511	NC_020449	TTTA	2	8	2244019	2244026	25 %	75 %	0 %	0 %	218962165
45512	NC_020449	ATT	2	6	2244038	2244043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218962165
45513	NC_020449	AAT	2	6	2244178	2244183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218962165
45514	NC_020449	TAA	2	6	2244243	2244248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218962165
45515	NC_020449	CAT	2	6	2244258	2244263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218962165
45516	NC_020449	GAAA	2	8	2244286	2244293	75 %	0 %	25 %	0 %	218962165
45517	NC_020449	T	7	7	2244306	2244312	0 %	100 %	0 %	0 %	218962165
45518	NC_020449	A	6	6	2244398	2244403	100 %	0 %	0 %	0 %	218962165
45519	NC_020449	AAAT	2	8	2244423	2244430	75 %	25 %	0 %	0 %	218962165
45520	NC_020449	GGCA	2	8	2244448	2244455	25 %	0 %	50 %	25 %	218962165
45521	NC_020449	CTGC	2	8	2244540	2244547	0 %	25 %	25 %	50 %	218962165
45522	NC_020449	CAG	2	6	2244571	2244576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218962165
45523	NC_020449	TGGA	2	8	2244615	2244622	25 %	25 %	50 %	0 %	218962165
45524	NC_020449	CGA	2	6	2244700	2244705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218962165
45525	NC_020449	ATT	3	9	2244714	2244722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218962165
45526	NC_020449	ATG	2	6	2244828	2244833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218962165
45527	NC_020449	CTA	2	6	2244867	2244872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218962165
45528	NC_020449	TTTCTC	2	12	2244889	2244900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218962165
45529	NC_020449	TTC	2	6	2244928	2244933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218962165
45530	NC_020449	GAC	2	6	2244946	2244951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218962165
45531	NC_020449	TTA	2	6	2244981	2244986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218962165
45532	NC_020449	GATT	2	8	2245035	2245042	25 %	50 %	25 %	0 %	218962165
45533	NC_020449	ATA	2	6	2245184	2245189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218962165
45534	NC_020449	TTA	2	6	2245224	2245229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218962165
45535	NC_020449	TTG	2	6	2245233	2245238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218962165
45536	NC_020449	GAT	2	6	2245331	2245336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218962165
45537	NC_020449	TCT	2	6	2245341	2245346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218962165
45538	NC_020449	T	6	6	2245346	2245351	0 %	100 %	0 %	0 %	218962165
45539	NC_020449	TGA	2	6	2245362	2245367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218962165
45540	NC_020449	AAT	3	9	2245379	2245387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218962165
45541	NC_020449	GGAA	2	8	2245414	2245421	50 %	0 %	50 %	0 %	218962165
45542	NC_020449	GAA	3	9	2245508	2245516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218962165
45543	NC_020449	GAAA	2	8	2245681	2245688	75 %	0 %	25 %	0 %	218962165
45544	NC_020449	GA	4	8	2245715	2245722	50 %	0 %	50 %	0 %	218962165
45545	NC_020449	GAA	2	6	2245769	2245774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218962165
45546	NC_020449	AAT	2	6	2245812	2245817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45547	NC_020449	AT	3	6	2245816	2245821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45548	NC_020449	TGA	2	6	2245829	2245834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45549	NC_020449	ATA	3	9	2245919	2245927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45550	NC_020449	GCC	2	6	2245948	2245953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45551	NC_020449	T	7	7	2245958	2245964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45552	NC_020449	CTT	2	6	2245972	2245977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45553	NC_020449	AGA	2	6	2246076	2246081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45554	NC_020449	A	6	6	2246117	2246122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45555	NC_020449	TTC	2	6	2246162	2246167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45556	NC_020449	TA	3	6	2246174	2246179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45557	NC_020449	A	6	6	2246191	2246196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45558	NC_020449	TCT	2	6	2246209	2246214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45559	NC_020449	A	7	7	2246345	2246351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45560	NC_020449	T	6	6	2246409	2246414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45561	NC_020449	ATA	2	6	2246422	2246427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45562	NC_020449	AT	3	6	2246430	2246435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45563	NC_020449	TTC	2	6	2246525	2246530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45564	NC_020449	ATTTTA	2	12	2246539	2246550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45565	NC_020449	AG	3	6	2246573	2246578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45566	NC_020449	T	7	7	2246584	2246590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45567	NC_020449	T	7	7	2246602	2246608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45568	NC_020449	TAAAG	2	10	2246628	2246637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45569	NC_020449	AGAA	2	8	2246641	2246648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45570	NC_020449	TTA	2	6	2246728	2246733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45571	NC_020449	ATAA	2	8	2246793	2246800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.