MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020262	CCTG	2	8	14	21	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020262	GC	3	6	34	39	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020262	GCT	2	6	69	74	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020262	CCG	2	6	117	122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020262	CGG	3	9	132	140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020262	GGC	2	6	168	173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020262	GAT	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306423
8	NC_020262	CGG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306423
9	NC_020262	GCCGG	2	10	278	287	0 %	0 %	60 %	40 %	449306423
10	NC_020262	TCT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306423
11	NC_020262	GAA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306423
12	NC_020262	GAA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306423
13	NC_020262	GCT	2	6	577	582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306423
14	NC_020262	GGC	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306423
15	NC_020262	TAC	2	6	605	610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306423
16	NC_020262	CCG	2	6	697	702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306423
17	NC_020262	AGG	2	6	741	746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449306423
18	NC_020262	CG	3	6	762	767	0 %	0 %	50 %	50 %	449306423
19	NC_020262	CTG	2	6	770	775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306423
20	NC_020262	GGT	2	6	847	852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306423
21	NC_020262	CAC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306423
22	NC_020262	AGC	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
23	NC_020262	CGAGCA	2	12	1018	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
24	NC_020262	GAG	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449306424
25	NC_020262	CGG	2	6	1124	1129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306424
26	NC_020262	GCT	2	6	1183	1188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306424
27	NC_020262	TGG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306424
28	NC_020262	GCA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
29	NC_020262	CAG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
30	NC_020262	AGC	2	6	1319	1324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
31	NC_020262	GCC	2	6	1348	1353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306424
32	NC_020262	ACG	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
33	NC_020262	GAC	2	6	1387	1392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
34	NC_020262	AGC	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306425
35	NC_020262	CAG	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306425
36	NC_020262	ACT	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306425
37	NC_020262	TG	3	6	1530	1535	0 %	50 %	50 %	0 %	449306425
38	NC_020262	AGC	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306425
39	NC_020262	CTGGAG	2	12	1684	1695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020262	GGC	2	6	1882	1887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020262	CTGG	2	8	1900	1907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020262	T	6	6	2024	2029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020262	TGTC	2	8	2035	2042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020262	GGT	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020262	T	6	6	2367	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	449306426
46	NC_020262	A	6	6	2393	2398	100 %	0 %	0 %	0 %	449306426
47	NC_020262	TTC	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306426
48	NC_020262	TGCTTT	2	12	2433	2444	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	449306426
49	NC_020262	TTG	2	6	2574	2579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020262	CGA	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020262	AAT	2	6	2607	2612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020262	ATG	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020262	TTAT	2	8	2895	2902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020262	AGAT	2	8	2951	2958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020262	GCT	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020262	ATT	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020262	TAT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306427
58	NC_020262	TCC	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306427
59	NC_020262	A	6	6	3182	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	449306427
60	NC_020262	GAT	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306427
61	NC_020262	ATG	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306427
62	NC_020262	CGA	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306427
63	NC_020262	TGG	3	9	3279	3287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306427
64	NC_020262	TCT	2	6	3377	3382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020262	ACC	2	6	3430	3435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_020262	GGT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020262	CCA	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020262	TC	3	6	3574	3579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020262	GCC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020262	CCA	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020262	G	6	6	3915	3920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020262	CGC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020262	CGC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_020262	AT	3	6	4078	4083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020262	CTG	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020262	GCC	2	6	4115	4120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020262	T	6	6	4121	4126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020262	CCCG	2	8	4295	4302	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_020262	GCA	2	6	4340	4345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020262	CCG	2	6	4380	4385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020262	CTG	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.