MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020248	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020248	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020248	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020248	A	6	6	145	150	100 %	0 %	0 %	0 %	449070642
5	NC_020248	CGA	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
6	NC_020248	AGA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070642
7	NC_020248	CTT	2	6	226	231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
8	NC_020248	T	7	7	257	263	0 %	100 %	0 %	0 %	449070642
9	NC_020248	AAGG	2	8	267	274	50 %	0 %	50 %	0 %	449070642
10	NC_020248	A	6	6	275	280	100 %	0 %	0 %	0 %	449070642
11	NC_020248	GT	3	6	310	315	0 %	50 %	50 %	0 %	449070642
12	NC_020248	TCT	2	6	332	337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
13	NC_020248	A	7	7	479	485	100 %	0 %	0 %	0 %	449070642
14	NC_020248	TG	3	6	499	504	0 %	50 %	50 %	0 %	449070642
15	NC_020248	TAT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070642
16	NC_020248	ATG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070642
17	NC_020248	GCGT	2	8	589	596	0 %	25 %	50 %	25 %	449070642
18	NC_020248	TGT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070642
19	NC_020248	ATG	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070642
20	NC_020248	TC	3	6	728	733	0 %	50 %	0 %	50 %	449070642
21	NC_020248	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070642
22	NC_020248	AGC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
23	NC_020248	GTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070642
24	NC_020248	AGC	3	9	1001	1009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
25	NC_020248	CTA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070642
26	NC_020248	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070642
27	NC_020248	CTT	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
28	NC_020248	TTC	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020248	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020248	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
31	NC_020248	AC	3	6	1296	1301	50 %	0 %	0 %	50 %	449070643
32	NC_020248	TTAA	2	8	1354	1361	50 %	50 %	0 %	0 %	449070643
33	NC_020248	ACA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070643
34	NC_020248	ATG	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
35	NC_020248	GT	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	449070643
36	NC_020248	TTA	2	6	1513	1518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070643
37	NC_020248	TAG	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
38	NC_020248	TC	3	6	1585	1590	0 %	50 %	0 %	50 %	449070643
39	NC_020248	TAG	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
40	NC_020248	CTA	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070643
41	NC_020248	TTC	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
42	NC_020248	TG	3	6	1889	1894	0 %	50 %	50 %	0 %	449070643
43	NC_020248	ATA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070643
44	NC_020248	CTT	2	6	2057	2062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
45	NC_020248	GAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070643
46	NC_020248	TGA	2	6	2129	2134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
47	NC_020248	GAT	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
48	NC_020248	GTT	2	6	2183	2188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070643
49	NC_020248	CTT	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
50	NC_020248	T	6	6	2211	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	449070643
51	NC_020248	T	8	8	2290	2297	0 %	100 %	0 %	0 %	449070643
52	NC_020248	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070643
53	NC_020248	GAA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070643
54	NC_020248	AGAT	2	8	2544	2551	50 %	25 %	25 %	0 %	449070643
55	NC_020248	T	8	8	2617	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020248	T	8	8	2630	2637	0 %	100 %	0 %	0 %	449070644
57	NC_020248	AGT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070644
58	NC_020248	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
59	NC_020248	TCC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070644
60	NC_020248	T	6	6	2732	2737	0 %	100 %	0 %	0 %	449070644
61	NC_020248	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070644
62	NC_020248	GA	3	6	2788	2793	50 %	0 %	50 %	0 %	449070644
63	NC_020248	TTA	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
64	NC_020248	TGTT	2	8	2843	2850	0 %	75 %	25 %	0 %	449070644
65	NC_020248	T	6	6	2887	2892	0 %	100 %	0 %	0 %	449070644
66	NC_020248	T	6	6	2899	2904	0 %	100 %	0 %	0 %	449070644
67	NC_020248	AGA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070644
68	NC_020248	GAAG	2	8	2954	2961	50 %	0 %	50 %	0 %	449070644
69	NC_020248	TAT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
70	NC_020248	AGTA	2	8	2984	2991	50 %	25 %	25 %	0 %	449070644
71	NC_020248	TAT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
72	NC_020248	T	6	6	3013	3018	0 %	100 %	0 %	0 %	449070644
73	NC_020248	TAT	2	6	3060	3065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020248	ATT	3	9	3075	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020248	TTG	3	9	3084	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020248	T	6	6	3104	3109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020248	GAA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
78	NC_020248	TTTG	2	8	3302	3309	0 %	75 %	25 %	0 %	449070645
79	NC_020248	TCCT	2	8	3328	3335	0 %	50 %	0 %	50 %	449070645
80	NC_020248	GA	3	6	3342	3347	50 %	0 %	50 %	0 %	449070645
81	NC_020248	GAAAA	2	10	3358	3367	80 %	0 %	20 %	0 %	449070645
82	NC_020248	ATG	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
83	NC_020248	AGT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
84	NC_020248	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070645
85	NC_020248	CAA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070645
86	NC_020248	ATG	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
87	NC_020248	ATC	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070645
88	NC_020248	TGG	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070645
89	NC_020248	AGA	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
90	NC_020248	T	6	6	4193	4198	0 %	100 %	0 %	0 %	449070645
91	NC_020248	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070645
92	NC_020248	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	449070645
93	NC_020248	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
94	NC_020248	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070645
95	NC_020248	TAA	2	6	4315	4320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070645
96	NC_020248	AGGAG	2	10	4415	4424	40 %	0 %	60 %	0 %	449070645
97	NC_020248	AGA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
98	NC_020248	CTT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070645
99	NC_020248	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
100	NC_020248	GAT	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
101	NC_020248	GCT	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070645
102	NC_020248	CT	3	6	4731	4736	0 %	50 %	0 %	50 %	449070645
103	NC_020248	GAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
104	NC_020248	CTGTGG	2	12	4822	4833	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	449070645
105	NC_020248	AAG	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
106	NC_020248	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070645
107	NC_020248	AAG	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
108	NC_020248	AGA	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
109	NC_020248	TTA	2	6	5134	5139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070645
110	NC_020248	CAA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070645
111	NC_020248	GAAA	2	8	5257	5264	75 %	0 %	25 %	0 %	449070645
112	NC_020248	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020248	TTG	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020248	AATC	2	8	5416	5423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020248	T	7	7	5459	5465	0 %	100 %	0 %	0 %	449070646
116	NC_020248	AGA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070646
117	NC_020248	CGAG	2	8	5528	5535	25 %	0 %	50 %	25 %	449070646
118	NC_020248	TGG	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070646
119	NC_020248	TAT	2	6	5623	5628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070646
120	NC_020248	GTT	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
121	NC_020248	CAA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070646
122	NC_020248	GAT	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
123	NC_020248	TGT	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
124	NC_020248	GGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070646
125	NC_020248	T	6	6	5788	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	449070646
126	NC_020248	CAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070646
127	NC_020248	TGA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
128	NC_020248	GAT	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
129	NC_020248	TGT	3	9	5985	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
130	NC_020248	TGA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
131	NC_020248	GCT	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070646
132	NC_020248	T	7	7	6074	6080	0 %	100 %	0 %	0 %	449070646
133	NC_020248	TGC	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070646
134	NC_020248	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
135	NC_020248	GAA	2	6	6276	6281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070646
136	NC_020248	A	6	6	6280	6285	100 %	0 %	0 %	0 %	449070646
137	NC_020248	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070646
138	NC_020248	TTC	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070646
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140	NC_020248	CTT	2	6	6352	6357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070646
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398	NC_020248	TAA	2	6	18577	18582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070653
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400	NC_020248	T	6	6	18740	18745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_020248	GGA	2	6	18863	18868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070654
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403	NC_020248	ATTA	2	8	18991	18998	50 %	50 %	0 %	0 %	449070654
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