MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

< Previous12...3233343536373839404142...4950Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_020248	T	6	6	850426	850431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_020248	T	6	6	850449	850454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_020248	CTT	2	6	850455	850460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_020248	TAT	2	6	850506	850511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_020248	GAA	2	6	850730	850735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071392
18006	NC_020248	ATTT	2	8	850747	850754	25 %	75 %	0 %	0 %	449071392
18007	NC_020248	ACA	2	6	850771	850776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071392
18008	NC_020248	AT	3	6	850815	850820	50 %	50 %	0 %	0 %	449071392
18009	NC_020248	GCA	2	6	850859	850864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071392
18010	NC_020248	CGA	2	6	850922	850927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071392
18011	NC_020248	A	6	6	851043	851048	100 %	0 %	0 %	0 %	449071392
18012	NC_020248	CAA	2	6	851049	851054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071392
18013	NC_020248	CCTAAC	2	12	851189	851200	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	449071392
18014	NC_020248	A	6	6	851268	851273	100 %	0 %	0 %	0 %	449071392
18015	NC_020248	AAT	2	6	851347	851352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071392
18016	NC_020248	CT	3	6	851359	851364	0 %	50 %	0 %	50 %	449071392
18017	NC_020248	AGT	2	6	851383	851388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071392
18018	NC_020248	GAAA	2	8	851431	851438	75 %	0 %	25 %	0 %	449071392
18019	NC_020248	ATA	2	6	851439	851444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071392
18020	NC_020248	AGA	2	6	851455	851460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071392
18021	NC_020248	AAT	2	6	851465	851470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071392
18022	NC_020248	AAC	2	6	851492	851497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071392
18023	NC_020248	GTT	2	6	851543	851548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071392
18024	NC_020248	A	7	7	851600	851606	100 %	0 %	0 %	0 %	449071392
18025	NC_020248	GCT	2	6	851676	851681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071392
18026	NC_020248	CT	3	6	851684	851689	0 %	50 %	0 %	50 %	449071392
18027	NC_020248	CTC	2	6	851720	851725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071392
18028	NC_020248	A	9	9	851734	851742	100 %	0 %	0 %	0 %	449071392
18029	NC_020248	GTT	2	6	851765	851770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071392
18030	NC_020248	AAG	2	6	851794	851799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071392
18031	NC_020248	TTC	2	6	851888	851893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071392
18032	NC_020248	TAAA	2	8	851939	851946	75 %	25 %	0 %	0 %	449071392
18033	NC_020248	AAT	2	6	852006	852011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_020248	TC	3	6	852017	852022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18035	NC_020248	CAGAT	2	10	852023	852032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18036	NC_020248	A	6	6	852067	852072	100 %	0 %	0 %	0 %	449071393
18037	NC_020248	GAA	2	6	852100	852105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071393
18038	NC_020248	AAT	2	6	852164	852169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071393
18039	NC_020248	TTC	2	6	852235	852240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071393
18040	NC_020248	AG	3	6	852250	852255	50 %	0 %	50 %	0 %	449071393
18041	NC_020248	CTT	2	6	852283	852288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071393
18042	NC_020248	AAT	2	6	852302	852307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071393
18043	NC_020248	AAG	2	6	852335	852340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071393
18044	NC_020248	TAA	2	6	852373	852378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071393
18045	NC_020248	GAA	2	6	852397	852402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071393
18046	NC_020248	ATA	2	6	852431	852436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071393
18047	NC_020248	AAC	2	6	852529	852534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071393
18048	NC_020248	ACC	2	6	852569	852574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449071393
18049	NC_020248	TAA	2	6	852593	852598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071393
18050	NC_020248	GGA	2	6	852615	852620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071393
18051	NC_020248	GAA	2	6	852636	852641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071393
18052	NC_020248	ATA	2	6	852751	852756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_020248	ACT	2	6	852785	852790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_020248	TTTATT	2	12	852791	852802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_020248	AGC	2	6	852827	852832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071394
18056	NC_020248	AAGAA	2	10	852884	852893	80 %	0 %	20 %	0 %	449071394
18057	NC_020248	GT	3	6	852919	852924	0 %	50 %	50 %	0 %	449071394
18058	NC_020248	AGC	2	6	852956	852961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071394
18059	NC_020248	TAC	2	6	853088	853093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071394
18060	NC_020248	CTC	2	6	853097	853102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071394
18061	NC_020248	CTAT	2	8	853104	853111	25 %	50 %	0 %	25 %	449071394
18062	NC_020248	CTT	2	6	853147	853152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071394
18063	NC_020248	AGC	2	6	853157	853162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071394
18064	NC_020248	TTG	2	6	853163	853168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071394
18065	NC_020248	TTCT	2	8	853219	853226	0 %	75 %	0 %	25 %	449071394
18066	NC_020248	ACT	2	6	853245	853250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071394
18067	NC_020248	GGA	2	6	853275	853280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071394
18068	NC_020248	ACT	2	6	853352	853357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071394
18069	NC_020248	CTT	2	6	853379	853384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071394
18070	NC_020248	TTA	2	6	853424	853429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071395
18071	NC_020248	CAA	2	6	853505	853510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071395
18072	NC_020248	ATC	2	6	853514	853519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071395
18073	NC_020248	CTA	2	6	853550	853555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071395
18074	NC_020248	GAA	2	6	853572	853577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071395
18075	NC_020248	TTC	2	6	853580	853585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071395
18076	NC_020248	ATG	2	6	853658	853663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071395
18077	NC_020248	CCA	2	6	853673	853678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449071395
18078	NC_020248	TCT	2	6	853716	853721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071395
18079	NC_020248	CTG	2	6	853752	853757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071395
18080	NC_020248	GAA	2	6	853784	853789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071395
18081	NC_020248	ATT	2	6	853808	853813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071395
18082	NC_020248	TTTAC	2	10	853850	853859	20 %	60 %	0 %	20 %	449071395
18083	NC_020248	T	6	6	853871	853876	0 %	100 %	0 %	0 %	449071395
18084	NC_020248	TAG	2	6	853902	853907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071395
18085	NC_020248	ATT	2	6	853918	853923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071395
18086	NC_020248	TTA	3	9	853934	853942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071395
18087	NC_020248	AGT	2	6	854004	854009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071395
18088	NC_020248	CTG	2	6	854035	854040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071396
18089	NC_020248	AAC	2	6	854100	854105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071396
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18091	NC_020248	A	6	6	854163	854168	100 %	0 %	0 %	0 %	449071396
18092	NC_020248	AAG	2	6	854226	854231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071396
18093	NC_020248	AGA	2	6	854242	854247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071396
18094	NC_020248	CTC	2	6	854316	854321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071396
18095	NC_020248	CACTT	2	10	854341	854350	20 %	40 %	0 %	40 %	449071396
18096	NC_020248	TAA	2	6	854377	854382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071396
18097	NC_020248	A	6	6	854392	854397	100 %	0 %	0 %	0 %	449071396
18098	NC_020248	TTG	2	6	854430	854435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071396
18099	NC_020248	A	7	7	854491	854497	100 %	0 %	0 %	0 %	449071396
18100	NC_020248	GCA	2	6	854531	854536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071396
18101	NC_020248	A	6	6	854756	854761	100 %	0 %	0 %	0 %	449071396
18102	NC_020248	AC	3	6	854833	854838	50 %	0 %	0 %	50 %	449071396
18103	NC_020248	TCT	2	6	854893	854898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071397
18104	NC_020248	AGA	2	6	854920	854925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071397
18105	NC_020248	TC	3	6	854944	854949	0 %	50 %	0 %	50 %	449071397
18106	NC_020248	T	6	6	855050	855055	0 %	100 %	0 %	0 %	449071397
18107	NC_020248	TTC	2	6	855174	855179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071397
18108	NC_020248	CTT	2	6	855206	855211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071397
18109	NC_020248	TCT	2	6	855271	855276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071397
18110	NC_020248	TTC	2	6	855297	855302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071397
18111	NC_020248	T	6	6	855329	855334	0 %	100 %	0 %	0 %	449071397
18112	NC_020248	CT	3	6	855381	855386	0 %	50 %	0 %	50 %	449071397
18113	NC_020248	AGT	2	6	855429	855434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071397
18114	NC_020248	TCT	2	6	855484	855489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071397
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18117	NC_020248	CAAAAA	2	12	855749	855760	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	449071397
18118	NC_020248	ATA	2	6	855770	855775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071397
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18120	NC_020248	GAA	2	6	855811	855816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071397
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18490	NC_020248	TCA	2	6	872801	872806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071415
18491	NC_020248	CTT	2	6	872826	872831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071415
18492	NC_020248	T	6	6	872854	872859	0 %	100 %	0 %	0 %	449071415
18493	NC_020248	TCTTTC	2	12	872864	872875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071415
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18498	NC_020248	AAAAG	2	10	873218	873227	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18499	NC_020248	T	6	6	873363	873368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18500	NC_020248	TAA	2	6	873472	873477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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