MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

< Previous12...3031323334353637383940...4950Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_020248	TAA	2	6	803972	803977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071351
17003	NC_020248	TAC	2	6	804035	804040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071351
17004	NC_020248	CT	3	6	804086	804091	0 %	50 %	0 %	50 %	449071351
17005	NC_020248	ATC	2	6	804175	804180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_020248	A	9	9	804219	804227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_020248	T	6	6	804244	804249	0 %	100 %	0 %	0 %	449071352
17008	NC_020248	TGC	2	6	804262	804267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071352
17009	NC_020248	CCA	2	6	804277	804282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449071352
17010	NC_020248	ATAA	2	8	804318	804325	75 %	25 %	0 %	0 %	449071352
17011	NC_020248	AAG	2	6	804373	804378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071352
17012	NC_020248	TGT	2	6	804422	804427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071352
17013	NC_020248	CTT	2	6	804432	804437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071352
17014	NC_020248	ACTAT	2	10	804462	804471	40 %	40 %	0 %	20 %	449071352
17015	NC_020248	CAG	2	6	804484	804489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071352
17016	NC_020248	GAG	2	6	804583	804588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071352
17017	NC_020248	TAG	2	6	804610	804615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071352
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17019	NC_020248	ACA	2	6	804696	804701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071352
17020	NC_020248	CTT	2	6	804738	804743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071352
17021	NC_020248	TAA	2	6	804812	804817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071352
17022	NC_020248	CAA	3	9	804851	804859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071352
17023	NC_020248	ATG	2	6	804942	804947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071352
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17026	NC_020248	TGA	2	6	805128	805133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071352
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17030	NC_020248	TCA	2	6	805425	805430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071352
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17032	NC_020248	TG	3	6	805463	805468	0 %	50 %	50 %	0 %	449071352
17033	NC_020248	GTT	2	6	805481	805486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071352
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17037	NC_020248	C	13	13	805583	805595	0 %	0 %	0 %	100 %	449071352
17038	NC_020248	A	6	6	805611	805616	100 %	0 %	0 %	0 %	449071352
17039	NC_020248	C	6	6	805625	805630	0 %	0 %	0 %	100 %	449071352
17040	NC_020248	CTA	2	6	805669	805674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071352
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17042	NC_020248	TGAA	2	8	805806	805813	50 %	25 %	25 %	0 %	449071352
17043	NC_020248	ATG	2	6	805846	805851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071352
17044	NC_020248	GGTG	2	8	805869	805876	0 %	25 %	75 %	0 %	449071352
17045	NC_020248	A	7	7	805994	806000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_020248	CTATGT	2	12	806073	806084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17047	NC_020248	TCT	2	6	806090	806095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17048	NC_020248	A	7	7	806177	806183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_020248	T	6	6	806216	806221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17053	NC_020248	GTA	2	6	806517	806522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071353
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17057	NC_020248	TTA	2	6	806631	806636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071353
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17059	NC_020248	CT	3	6	806801	806806	0 %	50 %	0 %	50 %	449071353
17060	NC_020248	CAA	2	6	806841	806846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071353
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17062	NC_020248	TACT	2	8	806934	806941	25 %	50 %	0 %	25 %	449071353
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17065	NC_020248	TTA	2	6	807024	807029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17070	NC_020248	AT	4	8	807202	807209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_020248	AAC	2	6	807279	807284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17072	NC_020248	AGCA	2	8	807458	807465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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17075	NC_020248	TA	3	6	807522	807527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17108	NC_020248	C	6	6	809196	809201	0 %	0 %	0 %	100 %	449071355
17109	NC_020248	GTT	2	6	809215	809220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071355
17110	NC_020248	AACA	2	8	809261	809268	75 %	0 %	0 %	25 %	449071355
17111	NC_020248	TAC	2	6	809393	809398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071355
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17113	NC_020248	AT	3	6	809426	809431	50 %	50 %	0 %	0 %	449071355
17114	NC_020248	T	6	6	809474	809479	0 %	100 %	0 %	0 %	449071355
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17124	NC_020248	GCA	2	6	809820	809825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071356
17125	NC_020248	TCC	2	6	809876	809881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071356
17126	NC_020248	ATC	3	9	809912	809920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071356
17127	NC_020248	GAA	2	6	810010	810015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071356
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17129	NC_020248	GAT	2	6	810034	810039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071356
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17131	NC_020248	TTC	2	6	810122	810127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071356
17132	NC_020248	TCCT	2	8	810130	810137	0 %	50 %	0 %	50 %	449071356
17133	NC_020248	GCTAAG	2	12	810300	810311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449071356
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17142	NC_020248	CCT	2	6	810758	810763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17143	NC_020248	ATC	2	6	810777	810782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17144	NC_020248	A	6	6	810796	810801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17145	NC_020248	CTT	2	6	810855	810860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17146	NC_020248	TAA	2	6	810895	810900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17147	NC_020248	GTTTT	2	10	810903	810912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17148	NC_020248	T	6	6	810909	810914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17149	NC_020248	GTTC	2	8	810926	810933	0 %	50 %	25 %	25 %	449071357
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17371	NC_020248	TGCA	2	8	821578	821585	25 %	25 %	25 %	25 %	449071367
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17374	NC_020248	TCTT	2	8	821680	821687	0 %	75 %	0 %	25 %	449071368
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17485	NC_020248	A	6	6	826664	826669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17486	NC_020248	TCTTT	2	10	826680	826689	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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17492	NC_020248	A	6	6	826823	826828	100 %	0 %	0 %	0 %	449071373
17493	NC_020248	TTCCTC	2	12	826851	826862	0 %	50 %	0 %	50 %	449071373
17494	NC_020248	TCG	2	6	826899	826904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071373
17495	NC_020248	CGA	2	6	826950	826955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071373
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17497	NC_020248	A	6	6	827053	827058	100 %	0 %	0 %	0 %	449071373
17498	NC_020248	TGA	2	6	827076	827081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071373
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