MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020248	GGA	2	6	659756	659761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071235
14002	NC_020248	GCT	2	6	659768	659773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071235
14003	NC_020248	TTA	2	6	659789	659794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071235
14004	NC_020248	AGT	2	6	659846	659851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071235
14005	NC_020248	CTT	2	6	659863	659868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071235
14006	NC_020248	ATG	3	9	659879	659887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071235
14007	NC_020248	TTG	2	6	659904	659909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071235
14008	NC_020248	CT	4	8	659912	659919	0 %	50 %	0 %	50 %	449071235
14009	NC_020248	GGA	2	6	659924	659929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071235
14010	NC_020248	CGT	2	6	659933	659938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071235
14011	NC_020248	GTC	2	6	659957	659962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071235
14012	NC_020248	CCA	2	6	659988	659993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449071235
14013	NC_020248	CAA	2	6	660023	660028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071235
14014	NC_020248	GTTT	2	8	660082	660089	0 %	75 %	25 %	0 %	449071235
14015	NC_020248	A	6	6	660143	660148	100 %	0 %	0 %	0 %	449071235
14016	NC_020248	TC	3	6	660167	660172	0 %	50 %	0 %	50 %	449071235
14017	NC_020248	TAC	2	6	660185	660190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071235
14018	NC_020248	GAA	2	6	660209	660214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071235
14019	NC_020248	GCAA	2	8	660243	660250	50 %	0 %	25 %	25 %	449071235
14020	NC_020248	TTTCC	2	10	660264	660273	0 %	60 %	0 %	40 %	449071235
14021	NC_020248	TCT	2	6	660280	660285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071235
14022	NC_020248	CTG	3	9	660370	660378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071235
14023	NC_020248	ATT	2	6	660383	660388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071235
14024	NC_020248	TG	3	6	660440	660445	0 %	50 %	50 %	0 %	449071235
14025	NC_020248	CAG	2	6	660453	660458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071235
14026	NC_020248	CT	3	6	660467	660472	0 %	50 %	0 %	50 %	449071235
14027	NC_020248	TTTC	2	8	660478	660485	0 %	75 %	0 %	25 %	449071235
14028	NC_020248	ATA	2	6	660563	660568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071235
14029	NC_020248	AAG	2	6	660607	660612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071236
14030	NC_020248	CTT	3	9	660628	660636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071236
14031	NC_020248	CTT	3	9	660658	660666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071236
14032	NC_020248	AGA	2	6	660764	660769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071236
14033	NC_020248	ACA	2	6	660847	660852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071236
14034	NC_020248	T	6	6	660884	660889	0 %	100 %	0 %	0 %	449071236
14035	NC_020248	GTAA	2	8	660931	660938	50 %	25 %	25 %	0 %	449071236
14036	NC_020248	CTTA	2	8	660962	660969	25 %	50 %	0 %	25 %	449071236
14037	NC_020248	ATG	2	6	660980	660985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071236
14038	NC_020248	GAA	3	9	661042	661050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071236
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14040	NC_020248	CAA	2	6	661100	661105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071236
14041	NC_020248	ACA	2	6	661137	661142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071236
14042	NC_020248	TG	4	8	661188	661195	0 %	50 %	50 %	0 %	449071236
14043	NC_020248	AG	3	6	661229	661234	50 %	0 %	50 %	0 %	449071236
14044	NC_020248	AT	3	6	661478	661483	50 %	50 %	0 %	0 %	449071237
14045	NC_020248	TCG	2	6	661500	661505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071237
14046	NC_020248	AGA	2	6	661516	661521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071237
14047	NC_020248	CT	3	6	661581	661586	0 %	50 %	0 %	50 %	449071237
14048	NC_020248	TCA	2	6	661607	661612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071237
14049	NC_020248	TAA	2	6	661624	661629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071237
14050	NC_020248	CCT	2	6	661700	661705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071237
14051	NC_020248	TGC	2	6	661766	661771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071237
14052	NC_020248	TGTT	2	8	661786	661793	0 %	75 %	25 %	0 %	449071237
14053	NC_020248	TCCCAG	2	12	661872	661883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	449071237
14054	NC_020248	AAT	2	6	661894	661899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071237
14055	NC_020248	AAG	2	6	661926	661931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071237
14056	NC_020248	AGAATA	2	12	661954	661965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449071237
14057	NC_020248	CTAAG	2	10	662160	662169	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14058	NC_020248	TTC	2	6	662180	662185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_020248	A	6	6	662199	662204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_020248	TAA	2	6	662218	662223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_020248	A	7	7	662256	662262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020248	GAC	2	6	662367	662372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071238
14063	NC_020248	CTC	2	6	662446	662451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071238
14064	NC_020248	GAAT	2	8	662478	662485	50 %	25 %	25 %	0 %	449071238
14065	NC_020248	TTG	2	6	662486	662491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071238
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14067	NC_020248	TGT	2	6	662573	662578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071238
14068	NC_020248	GATG	2	8	662701	662708	25 %	25 %	50 %	0 %	449071238
14069	NC_020248	AAGAT	2	10	662832	662841	60 %	20 %	20 %	0 %	449071238
14070	NC_020248	TAA	2	6	662872	662877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071238
14071	NC_020248	CAG	3	9	662878	662886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071238
14072	NC_020248	AGA	2	6	662906	662911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071238
14073	NC_020248	AAT	2	6	662932	662937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071238
14074	NC_020248	TCC	2	6	662956	662961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071238
14075	NC_020248	TCT	2	6	662971	662976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071238
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14077	NC_020248	A	6	6	663127	663132	100 %	0 %	0 %	0 %	449071238
14078	NC_020248	AAC	2	6	663143	663148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071238
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14081	NC_020248	TCT	2	6	663288	663293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_020248	TCA	2	6	663306	663311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_020248	CTTT	2	8	663343	663350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14084	NC_020248	T	6	6	663348	663353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_020248	AAAT	2	8	663503	663510	75 %	25 %	0 %	0 %	449071239
14086	NC_020248	CTT	2	6	663618	663623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071239
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14088	NC_020248	GTAT	2	8	663718	663725	25 %	50 %	25 %	0 %	449071239
14089	NC_020248	AG	3	6	663919	663924	50 %	0 %	50 %	0 %	449071239
14090	NC_020248	TAA	2	6	663994	663999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071239
14091	NC_020248	ATA	2	6	664022	664027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071239
14092	NC_020248	AAAT	2	8	664028	664035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020248	TTAAT	2	10	664043	664052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_020248	TAA	2	6	664076	664081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_020248	A	6	6	664090	664095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_020248	ATC	2	6	664101	664106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_020248	ATA	2	6	664135	664140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_020248	A	6	6	664152	664157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_020248	TGC	2	6	664176	664181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_020248	AAG	2	6	664211	664216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071240
14101	NC_020248	AGT	2	6	664342	664347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071240
14102	NC_020248	TGA	2	6	664357	664362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071240
14103	NC_020248	TGG	2	6	664393	664398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449071240
14104	NC_020248	GT	3	6	664402	664407	0 %	50 %	50 %	0 %	449071240
14105	NC_020248	CAG	2	6	664675	664680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071240
14106	NC_020248	CA	3	6	664692	664697	50 %	0 %	0 %	50 %	449071240
14107	NC_020248	A	7	7	664702	664708	100 %	0 %	0 %	0 %	449071240
14108	NC_020248	AGA	2	6	664748	664753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071240
14109	NC_020248	ATGT	2	8	664851	664858	25 %	50 %	25 %	0 %	449071240
14110	NC_020248	AGA	2	6	664894	664899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071240
14111	NC_020248	GAA	2	6	664913	664918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071240
14112	NC_020248	AGG	2	6	664953	664958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071241
14113	NC_020248	TCC	2	6	664966	664971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071241
14114	NC_020248	CTG	2	6	664988	664993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071241
14115	NC_020248	CTA	3	9	665005	665013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071241
14116	NC_020248	ATG	2	6	665117	665122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071241
14117	NC_020248	ATC	2	6	665153	665158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071241
14118	NC_020248	TTC	2	6	665163	665168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071241
14119	NC_020248	A	6	6	665227	665232	100 %	0 %	0 %	0 %	449071241
14120	NC_020248	ATC	2	6	665293	665298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071241
14121	NC_020248	ATC	2	6	665327	665332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071241
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14496	NC_020248	TAAAA	2	10	683912	683921	80 %	20 %	0 %	0 %	449071255
14497	NC_020248	AAC	2	6	683943	683948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071255
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14499	NC_020248	CACAA	2	10	683987	683996	60 %	0 %	0 %	40 %	449071255
14500	NC_020248	TAA	2	6	684029	684034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071255

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