MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020248	AAAG	2	8	543846	543853	75 %	0 %	25 %	0 %	449071136
11502	NC_020248	GCA	2	6	543861	543866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11503	NC_020248	GCT	2	6	543900	543905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11504	NC_020248	CTAA	2	8	543930	543937	50 %	25 %	0 %	25 %	449071136
11505	NC_020248	TAT	2	6	543953	543958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071136
11506	NC_020248	T	6	6	543958	543963	0 %	100 %	0 %	0 %	449071136
11507	NC_020248	GCT	2	6	544056	544061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11508	NC_020248	TTAT	2	8	544070	544077	25 %	75 %	0 %	0 %	449071136
11509	NC_020248	TAA	2	6	544121	544126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071136
11510	NC_020248	CGC	2	6	544139	544144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449071136
11511	NC_020248	CT	3	6	544152	544157	0 %	50 %	0 %	50 %	449071136
11512	NC_020248	TGC	2	6	544211	544216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11513	NC_020248	ATT	2	6	544221	544226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071136
11514	NC_020248	GA	3	6	544228	544233	50 %	0 %	50 %	0 %	449071136
11515	NC_020248	GTC	2	6	544234	544239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11516	NC_020248	CTG	2	6	544309	544314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11517	NC_020248	AAG	2	6	544384	544389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071136
11518	NC_020248	GCT	2	6	544422	544427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11519	NC_020248	AG	3	6	544457	544462	50 %	0 %	50 %	0 %	449071136
11520	NC_020248	TGGT	2	8	544473	544480	0 %	50 %	50 %	0 %	449071136
11521	NC_020248	ATT	2	6	544503	544508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071136
11522	NC_020248	GCT	2	6	544581	544586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071136
11523	NC_020248	TCT	2	6	544587	544592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071136
11524	NC_020248	TGA	2	6	544607	544612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071136
11525	NC_020248	TTA	2	6	544614	544619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071136
11526	NC_020248	G	6	6	544671	544676	0 %	0 %	100 %	0 %	449071136
11527	NC_020248	GTT	2	6	544692	544697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071136
11528	NC_020248	ACA	2	6	544700	544705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071136
11529	NC_020248	A	6	6	544725	544730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020248	T	6	6	544736	544741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020248	TAG	2	6	544786	544791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071137
11532	NC_020248	AGC	2	6	544805	544810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071137
11533	NC_020248	TGA	2	6	544829	544834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071137
11534	NC_020248	TCC	2	6	544854	544859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449071137
11535	NC_020248	TTC	2	6	545036	545041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071137
11536	NC_020248	ATT	2	6	545058	545063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071137
11537	NC_020248	CAA	2	6	545097	545102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449071137
11538	NC_020248	GCA	2	6	545118	545123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071137
11539	NC_020248	A	6	6	545236	545241	100 %	0 %	0 %	0 %	449071137
11540	NC_020248	AGA	2	6	545243	545248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071137
11541	NC_020248	CTTA	2	8	545356	545363	25 %	50 %	0 %	25 %	449071137
11542	NC_020248	TGAATA	2	12	545371	545382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449071137
11543	NC_020248	AAT	2	6	545430	545435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071137
11544	NC_020248	TTC	2	6	545443	545448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071137
11545	NC_020248	GTT	2	6	545494	545499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071137
11546	NC_020248	TGA	2	6	545519	545524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071137
11547	NC_020248	TAAA	2	8	545581	545588	75 %	25 %	0 %	0 %	449071137
11548	NC_020248	AAT	2	6	545622	545627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071137
11549	NC_020248	T	6	6	545627	545632	0 %	100 %	0 %	0 %	449071137
11550	NC_020248	AT	3	6	545646	545651	50 %	50 %	0 %	0 %	449071138
11551	NC_020248	TTG	2	6	545662	545667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071138
11552	NC_020248	GAAA	2	8	545669	545676	75 %	0 %	25 %	0 %	449071138
11553	NC_020248	GGT	2	6	545776	545781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449071138
11554	NC_020248	GCT	2	6	545788	545793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071138
11555	NC_020248	TTA	2	6	545882	545887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071138
11556	NC_020248	AAT	2	6	545917	545922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071138
11557	NC_020248	GAA	2	6	545962	545967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071138
11558	NC_020248	TCT	2	6	545974	545979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071138
11559	NC_020248	TATG	2	8	546010	546017	25 %	50 %	25 %	0 %	449071138
11560	NC_020248	GTT	2	6	546079	546084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071138
11561	NC_020248	TAT	2	6	546135	546140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071138
11562	NC_020248	TGC	2	6	546171	546176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071138
11563	NC_020248	A	6	6	546267	546272	100 %	0 %	0 %	0 %	449071138
11564	NC_020248	GAA	2	6	546301	546306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071138
11565	NC_020248	TCT	2	6	546343	546348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071138
11566	NC_020248	TA	3	6	546349	546354	50 %	50 %	0 %	0 %	449071138
11567	NC_020248	GTT	2	6	546445	546450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020248	AGA	2	6	546514	546519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071139
11569	NC_020248	ATT	2	6	546533	546538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071139
11570	NC_020248	TTC	2	6	546580	546585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071139
11571	NC_020248	AGA	2	6	546643	546648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071139
11572	NC_020248	AT	3	6	546715	546720	50 %	50 %	0 %	0 %	449071139
11573	NC_020248	AGT	2	6	546738	546743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071139
11574	NC_020248	ACT	2	6	546747	546752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_020248	CAT	2	6	546782	546787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_020248	TTC	2	6	546947	546952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071140
11577	NC_020248	CTTA	2	8	546974	546981	25 %	50 %	0 %	25 %	449071140
11578	NC_020248	TTG	2	6	547032	547037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449071140
11579	NC_020248	TCT	2	6	547050	547055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071140
11580	NC_020248	TGA	2	6	547070	547075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071140
11581	NC_020248	CTA	2	6	547126	547131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071140
11582	NC_020248	AAGCTG	2	12	547140	547151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449071140
11583	NC_020248	TTC	2	6	547154	547159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071140
11584	NC_020248	AGG	2	6	547221	547226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071140
11585	NC_020248	GAAG	2	8	547267	547274	50 %	0 %	50 %	0 %	449071140
11586	NC_020248	TCA	2	6	547291	547296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071140
11587	NC_020248	AAAG	2	8	547318	547325	75 %	0 %	25 %	0 %	449071141
11588	NC_020248	CGG	2	6	547387	547392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449071141
11589	NC_020248	TTC	2	6	547426	547431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071141
11590	NC_020248	CAT	2	6	547480	547485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071141
11591	NC_020248	TTA	2	6	547559	547564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071141
11592	NC_020248	AAAT	2	8	547585	547592	75 %	25 %	0 %	0 %	449071141
11593	NC_020248	T	7	7	547604	547610	0 %	100 %	0 %	0 %	449071141
11594	NC_020248	GTGCTT	2	12	547623	547634	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	449071141
11595	NC_020248	T	6	6	547639	547644	0 %	100 %	0 %	0 %	449071141
11596	NC_020248	T	6	6	547646	547651	0 %	100 %	0 %	0 %	449071141
11597	NC_020248	TAGGA	2	10	547782	547791	40 %	20 %	40 %	0 %	449071141
11598	NC_020248	GCA	2	6	547907	547912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071141
11599	NC_020248	TTA	2	6	547937	547942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071141
11600	NC_020248	AGAA	2	8	547945	547952	75 %	0 %	25 %	0 %	449071141
11601	NC_020248	TAA	2	6	547992	547997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071141
11602	NC_020248	TAA	2	6	548029	548034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071141
11603	NC_020248	GGT	2	6	548038	548043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449071141
11604	NC_020248	ATAG	2	8	548097	548104	50 %	25 %	25 %	0 %	449071141
11605	NC_020248	CTT	2	6	548112	548117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449071141
11606	NC_020248	GTA	2	6	548145	548150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071141
11607	NC_020248	T	7	7	548273	548279	0 %	100 %	0 %	0 %	449071141
11608	NC_020248	TAC	2	6	548308	548313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071141
11609	NC_020248	GAG	2	6	548332	548337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449071141
11610	NC_020248	GCG	2	6	548408	548413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449071141
11611	NC_020248	TCA	2	6	548432	548437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071141
11612	NC_020248	TAA	2	6	548467	548472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071141
11613	NC_020248	GCA	2	6	548504	548509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071141
11614	NC_020248	GTG	2	6	548520	548525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449071141
11615	NC_020248	TAA	2	6	548644	548649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071141
11616	NC_020248	AGGA	2	8	548653	548660	50 %	0 %	50 %	0 %	449071141
11617	NC_020248	TGAG	2	8	548732	548739	25 %	25 %	50 %	0 %	449071141
11618	NC_020248	TCTCT	2	10	548758	548767	0 %	60 %	0 %	40 %	449071141
11619	NC_020248	T	7	7	548802	548808	0 %	100 %	0 %	0 %	449071141
11620	NC_020248	GTA	2	6	548854	548859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071141
11621	NC_020248	TAA	2	6	548866	548871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449071141
11622	NC_020248	GAC	2	6	548881	548886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449071141
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11646	NC_020248	T	6	6	550183	550188	0 %	100 %	0 %	0 %	449071142
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11987	NC_020248	CT	4	8	564831	564838	0 %	50 %	0 %	50 %	449071152
11988	NC_020248	AAG	2	6	564844	564849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449071152
11989	NC_020248	ATT	2	6	564888	564893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449071152
11990	NC_020248	ATG	2	6	564955	564960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449071152
11991	NC_020248	GCT	2	6	564996	565001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449071152
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11995	NC_020248	TCA	2	6	565209	565214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449071152
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