MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 41893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_019791	TAT	2	6	1251623	1251628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34002	NC_019791	TA	3	6	1251650	1251655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34003	NC_019791	TTA	2	6	1251698	1251703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34004	NC_019791	TCA	2	6	1251748	1251753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34005	NC_019791	TTA	2	6	1251758	1251763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_019791	CTTT	2	8	1251796	1251803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34007	NC_019791	TATC	2	8	1251829	1251836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34008	NC_019791	TCA	2	6	1251895	1251900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34009	NC_019791	TCC	2	6	1251927	1251932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34010	NC_019791	TAA	2	6	1251953	1251958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_019791	GGA	2	6	1251985	1251990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34012	NC_019791	TTAA	2	8	1252018	1252025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34013	NC_019791	CAG	2	6	1252031	1252036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34014	NC_019791	GTT	2	6	1252051	1252056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34015	NC_019791	CT	3	6	1252101	1252106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34016	NC_019791	TAT	2	6	1252125	1252130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34017	NC_019791	ATC	2	6	1252131	1252136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34018	NC_019791	GAT	2	6	1252201	1252206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34019	NC_019791	TCA	2	6	1252214	1252219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34020	NC_019791	TAAA	2	8	1252245	1252252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34021	NC_019791	TAA	2	6	1252296	1252301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34022	NC_019791	GCA	2	6	1252396	1252401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34023	NC_019791	GTTCT	2	10	1252451	1252460	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34024	NC_019791	TAT	2	6	1252551	1252556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34025	NC_019791	CTT	2	6	1252585	1252590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34026	NC_019791	CTC	2	6	1252620	1252625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34027	NC_019791	TGT	2	6	1252647	1252652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34028	NC_019791	AT	3	6	1252709	1252714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34029	NC_019791	AT	3	6	1252720	1252725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34030	NC_019791	TTA	2	6	1252733	1252738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34031	NC_019791	ATA	2	6	1252779	1252784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34032	NC_019791	GAT	2	6	1252786	1252791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34033	NC_019791	ATCT	2	8	1252806	1252813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34034	NC_019791	TAT	2	6	1252863	1252868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34035	NC_019791	T	7	7	1252883	1252889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34036	NC_019791	TAA	2	6	1252898	1252903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34037	NC_019791	CTT	2	6	1252915	1252920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34038	NC_019791	AG	3	6	1252937	1252942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34039	NC_019791	GAA	2	6	1253001	1253006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34040	NC_019791	ATC	2	6	1253009	1253014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34041	NC_019791	AGG	2	6	1253018	1253023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34042	NC_019791	TCT	2	6	1253042	1253047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34043	NC_019791	T	6	6	1253047	1253052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34044	NC_019791	TTA	2	6	1253071	1253076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34045	NC_019791	CTA	2	6	1253092	1253097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34046	NC_019791	TCT	2	6	1253125	1253130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34047	NC_019791	CTT	2	6	1253131	1253136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34048	NC_019791	ATC	2	6	1253144	1253149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34049	NC_019791	ATC	2	6	1253156	1253161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34050	NC_019791	TAT	2	6	1253193	1253198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34051	NC_019791	A	6	6	1253200	1253205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34052	NC_019791	AAT	2	6	1253234	1253239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34053	NC_019791	AAT	2	6	1253259	1253264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34054	NC_019791	ATA	2	6	1253272	1253277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34055	NC_019791	T	6	6	1253314	1253319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34056	NC_019791	TAA	2	6	1253325	1253330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_019791	TTA	2	6	1253412	1253417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34058	NC_019791	ATT	2	6	1253433	1253438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34059	NC_019791	TTA	2	6	1253444	1253449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429217430
34060	NC_019791	CTATTG	2	12	1253458	1253469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429217430
34061	NC_019791	CCT	2	6	1253478	1253483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217430
34062	NC_019791	TCC	2	6	1253516	1253521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217430
34063	NC_019791	TTAA	2	8	1253538	1253545	50 %	50 %	0 %	0 %	429217430
34064	NC_019791	CTATAG	2	12	1253587	1253598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429217430
34065	NC_019791	CAC	2	6	1253599	1253604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217430
34066	NC_019791	ATT	2	6	1253678	1253683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429217430
34067	NC_019791	AAT	2	6	1253689	1253694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429217430
34068	NC_019791	CAT	2	6	1253698	1253703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217430
34069	NC_019791	TGC	2	6	1253753	1253758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217430
34070	NC_019791	TGAAA	2	10	1253784	1253793	60 %	20 %	20 %	0 %	429217430
34071	NC_019791	CTA	2	6	1253797	1253802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217430
34072	NC_019791	TAA	2	6	1253855	1253860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429217430
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34075	NC_019791	CTG	2	6	1253896	1253901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217430
34076	NC_019791	CCT	2	6	1253960	1253965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217430
34077	NC_019791	CTT	2	6	1254133	1254138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429217430
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34079	NC_019791	CAT	2	6	1254175	1254180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217430
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34082	NC_019791	GCA	2	6	1254330	1254335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217430
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34090	NC_019791	CTA	2	6	1254604	1254609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217430
34091	NC_019791	CCA	2	6	1254642	1254647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34092	NC_019791	AAT	2	6	1254685	1254690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34093	NC_019791	TAA	2	6	1254695	1254700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34094	NC_019791	TAT	2	6	1254725	1254730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34095	NC_019791	T	6	6	1254730	1254735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34096	NC_019791	G	6	6	1254776	1254781	0 %	0 %	100 %	0 %	429217431
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34100	NC_019791	T	6	6	1254975	1254980	0 %	100 %	0 %	0 %	429217431
34101	NC_019791	ATT	2	6	1255134	1255139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429217431
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34106	NC_019791	ATTT	2	8	1255399	1255406	25 %	75 %	0 %	0 %	429217431
34107	NC_019791	A	6	6	1255433	1255438	100 %	0 %	0 %	0 %	429217431
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34109	NC_019791	A	6	6	1255531	1255536	100 %	0 %	0 %	0 %	429217431
34110	NC_019791	AAG	2	6	1255560	1255565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217431
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34112	NC_019791	ATAAA	2	10	1255586	1255595	80 %	20 %	0 %	0 %	429217431
34113	NC_019791	AGA	2	6	1255629	1255634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217431
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34476	NC_019791	ATTT	2	8	1269112	1269119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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