MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 41893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_019791	T	6	6	421371	421376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_019791	ATT	2	6	421383	421388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_019791	TAT	2	6	421395	421400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_019791	TTA	2	6	421401	421406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_019791	AAAT	2	8	421428	421435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_019791	ATAG	2	8	421474	421481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_019791	ATG	2	6	421485	421490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_019791	TAA	2	6	421493	421498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_019791	TA	3	6	421502	421507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_019791	A	6	6	421537	421542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_019791	TATCT	2	10	421643	421652	20 %	60 %	0 %	20 %	429216642
11512	NC_019791	GTG	2	6	421684	421689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429216642
11513	NC_019791	CAC	2	6	421729	421734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429216642
11514	NC_019791	TTC	3	9	421741	421749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216642
11515	NC_019791	TAA	2	6	421756	421761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216642
11516	NC_019791	CCAA	2	8	421787	421794	50 %	0 %	0 %	50 %	429216642
11517	NC_019791	TGT	2	6	421805	421810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216642
11518	NC_019791	T	6	6	421961	421966	0 %	100 %	0 %	0 %	429216642
11519	NC_019791	TCA	2	6	421995	422000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216642
11520	NC_019791	GAT	2	6	422054	422059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216642
11521	NC_019791	TCA	2	6	422085	422090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216642
11522	NC_019791	TTA	2	6	422119	422124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216642
11523	NC_019791	AGT	2	6	422144	422149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216642
11524	NC_019791	ATT	2	6	422157	422162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216642
11525	NC_019791	ACA	2	6	422235	422240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216642
11526	NC_019791	A	6	6	422246	422251	100 %	0 %	0 %	0 %	429216642
11527	NC_019791	CCT	2	6	422265	422270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216642
11528	NC_019791	AT	3	6	422350	422355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_019791	ATT	2	6	422378	422383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_019791	AT	3	6	422403	422408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_019791	AT	3	6	422437	422442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_019791	ATT	2	6	422451	422456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_019791	CT	3	6	422460	422465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_019791	ATC	2	6	422478	422483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_019791	TAA	2	6	422565	422570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_019791	AT	3	6	422583	422588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_019791	TA	3	6	422629	422634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_019791	CTAG	2	8	422652	422659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11539	NC_019791	AATAA	2	10	422673	422682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_019791	TAGA	2	8	422744	422751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_019791	TA	3	6	422852	422857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_019791	AAG	2	6	422913	422918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_019791	ATT	2	6	422931	422936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_019791	TGT	2	6	422979	422984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216643
11545	NC_019791	ATC	2	6	422999	423004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216643
11546	NC_019791	TCT	2	6	423009	423014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216643
11547	NC_019791	TAAT	2	8	423031	423038	50 %	50 %	0 %	0 %	429216643
11548	NC_019791	T	6	6	423059	423064	0 %	100 %	0 %	0 %	429216643
11549	NC_019791	TCA	2	6	423072	423077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216643
11550	NC_019791	AT	3	6	423078	423083	50 %	50 %	0 %	0 %	429216643
11551	NC_019791	ATT	2	6	423150	423155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216643
11552	NC_019791	TAT	2	6	423259	423264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216643
11553	NC_019791	ATA	2	6	423289	423294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216643
11554	NC_019791	TAT	2	6	423310	423315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216643
11555	NC_019791	TTG	2	6	423353	423358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216643
11556	NC_019791	GTT	2	6	423415	423420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216643
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11561	NC_019791	TAT	2	6	423592	423597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216643
11562	NC_019791	T	6	6	423620	423625	0 %	100 %	0 %	0 %	429216643
11563	NC_019791	AAT	2	6	423626	423631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216643
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11575	NC_019791	TA	3	6	424025	424030	50 %	50 %	0 %	0 %	429216643
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11579	NC_019791	T	6	6	424182	424187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_019791	TAA	2	6	424204	424209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11582	NC_019791	A	6	6	424257	424262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_019791	AT	3	6	424266	424271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11589	NC_019791	AAGA	2	8	424528	424535	75 %	0 %	25 %	0 %	429216644
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11598	NC_019791	TGT	2	6	424883	424888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216644
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11605	NC_019791	ATTT	2	8	425125	425132	25 %	75 %	0 %	0 %	429216645
11606	NC_019791	ATTT	2	8	425179	425186	25 %	75 %	0 %	0 %	429216645
11607	NC_019791	T	7	7	425184	425190	0 %	100 %	0 %	0 %	429216645
11608	NC_019791	TA	3	6	425201	425206	50 %	50 %	0 %	0 %	429216645
11609	NC_019791	CTTAT	2	10	425211	425220	20 %	60 %	0 %	20 %	429216645
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11612	NC_019791	ATTAT	2	10	425292	425301	40 %	60 %	0 %	0 %	429216645
11613	NC_019791	TTAAG	2	10	425389	425398	40 %	40 %	20 %	0 %	429216645
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11615	NC_019791	TTTTC	2	10	425450	425459	0 %	80 %	0 %	20 %	429216645
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11624	NC_019791	TCT	2	6	426039	426044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216645
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11999	NC_019791	TGC	2	6	439812	439817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216665
12000	NC_019791	GAA	2	6	439828	439833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216665

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