MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 1466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019777	TAA	2	6	70	75	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771775
3	NC_019777	TTGTT	2	10	77	86	0 %	80 %	20 %	0 %	428771775
4	NC_019777	TGA	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771775
5	NC_019777	A	6	6	209	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019777	TAT	2	6	237	242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019777	AAT	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771776
8	NC_019777	CGG	2	6	326	331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428771776
9	NC_019777	AAT	2	6	355	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771776
10	NC_019777	TC	4	8	405	412	0 %	50 %	0 %	50 %	428771776
11	NC_019777	ATTG	2	8	436	443	25 %	50 %	25 %	0 %	428771776
12	NC_019777	ATC	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771776
13	NC_019777	ATC	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771776
14	NC_019777	A	6	6	593	598	100 %	0 %	0 %	0 %	428771776
15	NC_019777	A	6	6	610	615	100 %	0 %	0 %	0 %	428771776
16	NC_019777	GTT	2	6	616	621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771776
17	NC_019777	CAG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771776
18	NC_019777	GGT	3	9	742	750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771776
19	NC_019777	ACG	2	6	753	758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771776
20	NC_019777	AATT	3	12	764	775	50 %	50 %	0 %	0 %	428771776
21	NC_019777	ATTA	2	8	810	817	50 %	50 %	0 %	0 %	428771776
22	NC_019777	ACT	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771776
23	NC_019777	TGA	3	9	1155	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771776
24	NC_019777	T	6	6	1208	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019777	T	7	7	1229	1235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019777	ATTA	2	8	1249	1256	50 %	50 %	0 %	0 %	428771777
27	NC_019777	ACT	2	6	1262	1267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771777
28	NC_019777	T	7	7	1267	1273	0 %	100 %	0 %	0 %	428771777
29	NC_019777	AGG	2	6	1319	1324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771777
30	NC_019777	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771777
31	NC_019777	ATT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771777
32	NC_019777	AAT	2	6	1412	1417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771777
33	NC_019777	TTC	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771777
34	NC_019777	AAT	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771777
35	NC_019777	ATT	2	6	1575	1580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019777	AAAT	2	8	1616	1623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019777	T	6	6	1645	1650	0 %	100 %	0 %	0 %	428771778
38	NC_019777	ATA	2	6	1666	1671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771778
39	NC_019777	AC	3	6	1678	1683	50 %	0 %	0 %	50 %	428771778
40	NC_019777	TAA	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771778
41	NC_019777	T	7	7	1826	1832	0 %	100 %	0 %	0 %	428771778
42	NC_019777	CT	3	6	1838	1843	0 %	50 %	0 %	50 %	428771778
43	NC_019777	TAAA	2	8	1888	1895	75 %	25 %	0 %	0 %	428771778
44	NC_019777	TC	3	6	1935	1940	0 %	50 %	0 %	50 %	428771778
45	NC_019777	A	8	8	1945	1952	100 %	0 %	0 %	0 %	428771778
46	NC_019777	TAAA	2	8	2013	2020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019777	TTA	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019777	AT	3	6	2059	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019777	A	7	7	2086	2092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019777	GCG	2	6	2103	2108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019777	A	6	6	2112	2117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019777	A	9	9	2120	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019777	T	6	6	2132	2137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019777	TTTTA	2	10	2141	2150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019777	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019777	AAT	2	6	2208	2213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771779
57	NC_019777	A	6	6	2228	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	428771779
58	NC_019777	C	6	6	2236	2241	0 %	0 %	0 %	100 %	428771779
59	NC_019777	AAGA	2	8	2315	2322	75 %	0 %	25 %	0 %	428771779
60	NC_019777	AACT	2	8	2418	2425	50 %	25 %	0 %	25 %	428771779
61	NC_019777	TCC	2	6	2436	2441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771779
62	NC_019777	TTAT	2	8	2503	2510	25 %	75 %	0 %	0 %	428771779
63	NC_019777	TTC	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771779
64	NC_019777	TAA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019777	TAA	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019777	AAG	2	6	2636	2641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771780
67	NC_019777	TGGT	2	8	2739	2746	0 %	50 %	50 %	0 %	428771780
68	NC_019777	TAT	2	6	2782	2787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771780
69	NC_019777	AAC	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771780
70	NC_019777	AAAT	2	8	2865	2872	75 %	25 %	0 %	0 %	428771780
71	NC_019777	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	428771780
72	NC_019777	ATT	2	6	3027	3032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771780
73	NC_019777	AGA	2	6	3045	3050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771780
74	NC_019777	CTA	3	9	3176	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771780
75	NC_019777	A	6	6	3199	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	428771780
76	NC_019777	TTC	2	6	3210	3215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771780
77	NC_019777	AG	3	6	3244	3249	50 %	0 %	50 %	0 %	428771780
78	NC_019777	GA	3	6	3313	3318	50 %	0 %	50 %	0 %	428771780
79	NC_019777	TGA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771780
80	NC_019777	ATTT	2	8	3530	3537	25 %	75 %	0 %	0 %	428771780
81	NC_019777	AATC	2	8	3538	3545	50 %	25 %	0 %	25 %	428771780
82	NC_019777	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771780
83	NC_019777	GGTA	2	8	3591	3598	25 %	25 %	50 %	0 %	428771780
84	NC_019777	CAA	2	6	3609	3614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771780
85	NC_019777	CAA	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771780
86	NC_019777	TCA	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771780
87	NC_019777	CAA	2	6	3652	3657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771780
88	NC_019777	ATGA	2	8	3658	3665	50 %	25 %	25 %	0 %	428771780
89	NC_019777	CCA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771780
90	NC_019777	TTC	2	6	3736	3741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771780
91	NC_019777	GTT	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771780
92	NC_019777	ATT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771780
93	NC_019777	ATT	2	6	3978	3983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771780
94	NC_019777	TGT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771780
95	NC_019777	AGT	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771780
96	NC_019777	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	428771780
97	NC_019777	CGG	2	6	4070	4075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428771780
98	NC_019777	AT	3	6	4140	4145	50 %	50 %	0 %	0 %	428771780
99	NC_019777	ATA	2	6	4220	4225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771780
100	NC_019777	TAT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771780
101	NC_019777	TTAA	2	8	4348	4355	50 %	50 %	0 %	0 %	428771780
102	NC_019777	AAT	2	6	4360	4365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771780
103	NC_019777	A	6	6	4397	4402	100 %	0 %	0 %	0 %	428771780
104	NC_019777	ATA	2	6	4463	4468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771780
105	NC_019777	TTC	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771780
106	NC_019777	ATA	2	6	4742	4747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771780
107	NC_019777	TC	3	6	4831	4836	0 %	50 %	0 %	50 %	428771780
108	NC_019777	GAT	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771780
109	NC_019777	AAT	2	6	4867	4872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771780
110	NC_019777	GGTT	2	8	5032	5039	0 %	50 %	50 %	0 %	428771780
111	NC_019777	TCA	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771780
112	NC_019777	GGCAA	2	10	5155	5164	40 %	0 %	40 %	20 %	428771780
113	NC_019777	AAAG	2	8	5211	5218	75 %	0 %	25 %	0 %	428771780
114	NC_019777	TAA	2	6	5253	5258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771780
115	NC_019777	ACCA	2	8	5282	5289	50 %	0 %	0 %	50 %	428771780
116	NC_019777	TTG	2	6	5369	5374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771780
117	NC_019777	ATA	2	6	5405	5410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771780
118	NC_019777	ATT	2	6	5453	5458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771780
119	NC_019777	ATC	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771780
120	NC_019777	TTC	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771780
121	NC_019777	TTC	2	6	5736	5741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771780
122	NC_019777	TCA	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771780
123	NC_019777	ATCT	2	8	5768	5775	25 %	50 %	0 %	25 %	428771780
124	NC_019777	TCT	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771780
125	NC_019777	A	6	6	5891	5896	100 %	0 %	0 %	0 %	428771780
126	NC_019777	ATAA	2	8	5982	5989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019777	TCAC	2	8	5991	5998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019777	ATT	2	6	6000	6005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019777	ATC	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019777	A	7	7	6068	6074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019777	TATT	2	8	6088	6095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019777	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019777	ATAA	2	8	6168	6175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019777	AT	3	6	6176	6181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019777	TAA	2	6	6182	6187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019777	TAA	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019777	ATA	2	6	6254	6259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019777	AATAA	2	10	6260	6269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019777	TTCT	2	8	6296	6303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019777	AAATG	2	10	6343	6352	60 %	20 %	20 %	0 %	428771781
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142	NC_019777	A	6	6	6367	6372	100 %	0 %	0 %	0 %	428771781
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