MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019753	AAC	2	6	77	82	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303694
2	NC_019753	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303694
3	NC_019753	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303694
4	NC_019753	TAC	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
5	NC_019753	GTA	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303694
6	NC_019753	GGA	2	6	307	312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303694
7	NC_019753	TAC	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
8	NC_019753	T	6	6	428	433	0 %	100 %	0 %	0 %	428303694
9	NC_019753	TGT	2	6	441	446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303694
10	NC_019753	TAA	2	6	453	458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303694
11	NC_019753	TGC	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303694
12	NC_019753	TGGCAG	2	12	482	493	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428303694
13	NC_019753	GCAA	2	8	564	571	50 %	0 %	25 %	25 %	428303694
14	NC_019753	GCT	2	6	652	657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303694
15	NC_019753	AGC	2	6	699	704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303694
16	NC_019753	TAG	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303694
17	NC_019753	AAGGA	2	10	740	749	60 %	0 %	40 %	0 %	428303694
18	NC_019753	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303694
19	NC_019753	AGA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303694
20	NC_019753	GTGAT	2	10	974	983	20 %	40 %	40 %	0 %	428303694
21	NC_019753	AT	3	6	987	992	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
22	NC_019753	CTA	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
23	NC_019753	ATTA	2	8	1035	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
24	NC_019753	AT	3	6	1053	1058	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
25	NC_019753	CAA	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303694
26	NC_019753	TAC	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
27	NC_019753	AGTT	2	8	1391	1398	25 %	50 %	25 %	0 %	428303694
28	NC_019753	ACCCC	2	10	1435	1444	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_019753	TGA	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019753	TGCT	2	8	1620	1627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019753	CAG	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303695
32	NC_019753	GCG	2	6	1893	1898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303695
33	NC_019753	GA	3	6	1972	1977	50 %	0 %	50 %	0 %	428303695
34	NC_019753	GAT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
35	NC_019753	CTTCTG	2	12	2020	2031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428303695
36	NC_019753	AGA	2	6	2060	2065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
37	NC_019753	GTA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
38	NC_019753	AATT	2	8	2102	2109	50 %	50 %	0 %	0 %	428303695
39	NC_019753	GTT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303695
40	NC_019753	TGA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
41	NC_019753	TGC	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303695
42	NC_019753	GTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303695
43	NC_019753	ACT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303695
44	NC_019753	GAA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
45	NC_019753	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
46	NC_019753	AAGT	2	8	2386	2393	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
47	NC_019753	TA	3	6	2407	2412	50 %	50 %	0 %	0 %	428303695
48	NC_019753	AGT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
49	NC_019753	GAC	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303695
50	NC_019753	ATT	2	6	2546	2551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303695
51	NC_019753	AGA	2	6	2587	2592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
52	NC_019753	GATA	2	8	2612	2619	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
53	NC_019753	CAG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303695
54	NC_019753	ATA	2	6	2704	2709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303695
55	NC_019753	ATGG	2	8	2739	2746	25 %	25 %	50 %	0 %	428303695
56	NC_019753	CTG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303695
57	NC_019753	TGGG	2	8	2821	2828	0 %	25 %	75 %	0 %	428303695
58	NC_019753	TGA	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019753	TTTG	2	8	2937	2944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019753	TGC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019753	AT	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019753	TACT	2	8	2976	2983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019753	ACTT	2	8	2986	2993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019753	CAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019753	T	6	6	3037	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019753	CCA	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019753	TTAA	2	8	3062	3069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019753	TC	3	6	3077	3082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019753	TAC	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019753	TA	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019753	A	6	6	3185	3190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019753	AG	3	6	3307	3312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019753	AAT	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303696
74	NC_019753	TCAA	2	8	3698	3705	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
75	NC_019753	TTAA	2	8	3742	3749	50 %	50 %	0 %	0 %	428303696
76	NC_019753	ATA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303696
77	NC_019753	TAA	3	9	3938	3946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303696
78	NC_019753	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
79	NC_019753	GAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303696
80	NC_019753	GAACTC	2	12	4034	4045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303696
81	NC_019753	TTA	2	6	4084	4089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
82	NC_019753	AAGC	2	8	4111	4118	50 %	0 %	25 %	25 %	428303696
83	NC_019753	ATCA	2	8	4216	4223	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
84	NC_019753	TCT	2	6	4261	4266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303696
85	NC_019753	A	6	6	4268	4273	100 %	0 %	0 %	0 %	428303696
86	NC_019753	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
87	NC_019753	ATT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
88	NC_019753	CAA	2	6	4423	4428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303696
89	NC_019753	T	6	6	4502	4507	0 %	100 %	0 %	0 %	428303696
90	NC_019753	ATT	2	6	4552	4557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
91	NC_019753	A	7	7	4603	4609	100 %	0 %	0 %	0 %	428303696
92	NC_019753	TTTA	2	8	4616	4623	25 %	75 %	0 %	0 %	428303696
93	NC_019753	GTT	2	6	4628	4633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303696
94	NC_019753	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303696
95	NC_019753	GTT	2	6	4691	4696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303696
96	NC_019753	T	6	6	4755	4760	0 %	100 %	0 %	0 %	428303696
97	NC_019753	GAT	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303696
98	NC_019753	A	7	7	4786	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	428303696
99	NC_019753	TGAA	2	8	4803	4810	50 %	25 %	25 %	0 %	428303696
100	NC_019753	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019753	AT	3	6	4862	4867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019753	TTC	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019753	TAG	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019753	TAA	2	6	4922	4927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019753	AATGAT	2	12	4974	4985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019753	AGA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019753	AAT	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019753	ATC	2	6	5105	5110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019753	GCA	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019753	ATT	2	6	5343	5348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019753	TAC	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019753	T	6	6	5415	5420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019753	TGA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019753	TAG	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019753	CAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019753	AT	3	6	5659	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019753	TGA	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019753	ATA	2	6	5745	5750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019753	ATT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019753	A	7	7	5986	5992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019753	TTA	2	6	6011	6016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019753	AAG	2	6	6052	6057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019753	ACA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019753	TTC	2	6	6148	6153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019753	A	6	6	6233	6238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019753	A	7	7	6250	6256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019753	TA	4	8	6356	6363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019753	AAT	2	6	6409	6414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019753	AAG	2	6	6462	6467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019753	A	6	6	6489	6494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019753	AATT	2	8	6609	6616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019753	CAG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019753	AT	3	6	6646	6651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019753	A	7	7	6666	6672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019753	ACAA	2	8	6676	6683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019753	CTG	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019753	ATG	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019753	ATT	2	6	6878	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019753	TTA	2	6	6911	6916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019753	ATT	2	6	7047	7052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019753	AAG	2	6	7066	7071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019753	GAAAA	2	10	7082	7091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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