MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019753	TGCT	2	8	97299	97306	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_019753	GTG	2	6	97466	97471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303758
2003	NC_019753	ATTG	2	8	97508	97515	25 %	50 %	25 %	0 %	428303758
2004	NC_019753	AATT	2	8	97594	97601	50 %	50 %	0 %	0 %	428303758
2005	NC_019753	ATC	2	6	97642	97647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303758
2006	NC_019753	TGT	2	6	97689	97694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303758
2007	NC_019753	AGA	2	6	98012	98017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303758
2008	NC_019753	TCAC	2	8	98150	98157	25 %	25 %	0 %	50 %	428303758
2009	NC_019753	ACT	2	6	98256	98261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303758
2010	NC_019753	ACT	2	6	98279	98284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303758
2011	NC_019753	AAC	2	6	98432	98437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
2012	NC_019753	CAA	3	9	98481	98489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
2013	NC_019753	TACT	2	8	98575	98582	25 %	50 %	0 %	25 %	428303758
2014	NC_019753	CAG	2	6	98614	98619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303758
2015	NC_019753	CTG	2	6	98647	98652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303758
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2017	NC_019753	CAA	2	6	98710	98715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
2018	NC_019753	AATT	2	8	98731	98738	50 %	50 %	0 %	0 %	428303758
2019	NC_019753	ATT	2	6	98744	98749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303758
2020	NC_019753	CCAG	2	8	98756	98763	25 %	0 %	25 %	50 %	428303758
2021	NC_019753	AGTTTG	2	12	98772	98783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303758
2022	NC_019753	ATTT	2	8	98803	98810	25 %	75 %	0 %	0 %	428303758
2023	NC_019753	CAA	2	6	98850	98855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
2024	NC_019753	GCA	2	6	98919	98924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_019753	TAT	2	6	98951	98956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303759
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2031	NC_019753	TAAGT	2	10	99234	99243	40 %	40 %	20 %	0 %	428303759
2032	NC_019753	TCTA	2	8	99255	99262	25 %	50 %	0 %	25 %	428303759
2033	NC_019753	CCA	2	6	99291	99296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303759
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2035	NC_019753	TCC	2	6	99421	99426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303759
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2037	NC_019753	GTATT	2	10	99733	99742	20 %	60 %	20 %	0 %	428303759
2038	NC_019753	T	6	6	99765	99770	0 %	100 %	0 %	0 %	428303759
2039	NC_019753	T	6	6	99778	99783	0 %	100 %	0 %	0 %	428303759
2040	NC_019753	CTT	2	6	99790	99795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303759
2041	NC_019753	TTG	2	6	99845	99850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303759
2042	NC_019753	TTC	2	6	99855	99860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303759
2043	NC_019753	CTG	2	6	99909	99914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303759
2044	NC_019753	CTG	2	6	99921	99926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303759
2045	NC_019753	TAC	2	6	99966	99971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303759
2046	NC_019753	TGA	2	6	100004	100009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303759
2047	NC_019753	CAT	2	6	100040	100045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303759
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2049	NC_019753	TAATAG	2	12	100064	100075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428303759
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2051	NC_019753	T	6	6	100220	100225	0 %	100 %	0 %	0 %	428303759
2052	NC_019753	AT	3	6	100253	100258	50 %	50 %	0 %	0 %	428303759
2053	NC_019753	ATT	2	6	100263	100268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303759
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2055	NC_019753	ATCCA	2	10	100372	100381	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2056	NC_019753	ACT	2	6	100481	100486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_019753	TAAA	2	8	100532	100539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_019753	TAAAA	2	10	100556	100565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_019753	TCC	2	6	100569	100574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2060	NC_019753	CAT	2	6	100584	100589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303760
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2063	NC_019753	AAC	2	6	100687	100692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303760
2064	NC_019753	CCCA	2	8	100694	100701	25 %	0 %	0 %	75 %	428303760
2065	NC_019753	CAAG	2	8	100705	100712	50 %	0 %	25 %	25 %	428303760
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2072	NC_019753	CTTAC	2	10	101020	101029	20 %	40 %	0 %	40 %	428303761
2073	NC_019753	TCC	3	9	101047	101055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303761
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2097	NC_019753	CTGCCA	2	12	102267	102278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428303761
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2101	NC_019753	TTTG	2	8	102434	102441	0 %	75 %	25 %	0 %	428303761
2102	NC_019753	CCCG	2	8	102506	102513	0 %	0 %	25 %	75 %	428303761
2103	NC_019753	GCT	2	6	102592	102597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
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2107	NC_019753	GCAC	2	8	102640	102647	25 %	0 %	25 %	50 %	428303761
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2110	NC_019753	TCT	2	6	102814	102819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303761
2111	NC_019753	CTTG	2	8	102991	102998	0 %	50 %	25 %	25 %	428303761
2112	NC_019753	CTC	2	6	103176	103181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303761
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2114	NC_019753	ATG	2	6	103325	103330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303761
2115	NC_019753	TGCCG	2	10	103335	103344	0 %	20 %	40 %	40 %	428303761
2116	NC_019753	T	6	6	103470	103475	0 %	100 %	0 %	0 %	428303761
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2119	NC_019753	T	8	8	103564	103571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_019753	TAA	2	6	103660	103665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_019753	TAGT	2	8	103717	103724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_019753	AT	3	6	103727	103732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_019753	TTA	2	6	103756	103761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2499	NC_019753	CT	3	6	122012	122017	0 %	50 %	0 %	50 %	428303777
2500	NC_019753	TGC	2	6	122056	122061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303777

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