MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_019753	AGC	2	6	1050960	1050965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304534
21502	NC_019753	ACT	2	6	1051021	1051026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304534
21503	NC_019753	CCT	2	6	1051045	1051050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428304534
21504	NC_019753	T	6	6	1051112	1051117	0 %	100 %	0 %	0 %	428304534
21505	NC_019753	CCA	2	6	1051123	1051128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304534
21506	NC_019753	AATAA	2	10	1051170	1051179	80 %	20 %	0 %	0 %	428304534
21507	NC_019753	CTA	2	6	1051190	1051195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304534
21508	NC_019753	CAA	2	6	1051251	1051256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304534
21509	NC_019753	GTC	2	6	1051273	1051278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304534
21510	NC_019753	TCAA	2	8	1051453	1051460	50 %	25 %	0 %	25 %	428304534
21511	NC_019753	A	6	6	1051459	1051464	100 %	0 %	0 %	0 %	428304534
21512	NC_019753	TTG	2	6	1051565	1051570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304534
21513	NC_019753	ATCA	2	8	1051596	1051603	50 %	25 %	0 %	25 %	428304534
21514	NC_019753	CTG	2	6	1051797	1051802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304534
21515	NC_019753	ATC	2	6	1051818	1051823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304534
21516	NC_019753	AAC	2	6	1051878	1051883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304534
21517	NC_019753	TTG	2	6	1051888	1051893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304534
21518	NC_019753	CCA	2	6	1051922	1051927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304534
21519	NC_019753	ATCGAG	2	12	1051980	1051991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428304534
21520	NC_019753	ATA	2	6	1051993	1051998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304534
21521	NC_019753	TTA	2	6	1052091	1052096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21522	NC_019753	CTG	2	6	1052134	1052139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304535
21523	NC_019753	GCC	2	6	1052154	1052159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428304535
21524	NC_019753	ATC	2	6	1052181	1052186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304535
21525	NC_019753	CAAA	2	8	1052190	1052197	75 %	0 %	0 %	25 %	428304535
21526	NC_019753	CAAC	2	8	1052204	1052211	50 %	0 %	0 %	50 %	428304535
21527	NC_019753	T	6	6	1052278	1052283	0 %	100 %	0 %	0 %	428304535
21528	NC_019753	AAT	2	6	1052316	1052321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304535
21529	NC_019753	CAA	2	6	1052341	1052346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304535
21530	NC_019753	AATC	2	8	1052390	1052397	50 %	25 %	0 %	25 %	428304535
21531	NC_019753	ATT	2	6	1052472	1052477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304535
21532	NC_019753	T	6	6	1052476	1052481	0 %	100 %	0 %	0 %	428304535
21533	NC_019753	CAAT	2	8	1052557	1052564	50 %	25 %	0 %	25 %	428304535
21534	NC_019753	TCC	2	6	1052596	1052601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21535	NC_019753	CAGG	2	8	1052611	1052618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21536	NC_019753	TTA	2	6	1052619	1052624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21537	NC_019753	TAG	2	6	1052681	1052686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21538	NC_019753	TGA	2	6	1052767	1052772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21539	NC_019753	TCT	2	6	1052787	1052792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21540	NC_019753	GCC	2	6	1052844	1052849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428304536
21541	NC_019753	ACA	2	6	1052897	1052902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304536
21542	NC_019753	ACA	2	6	1052935	1052940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304536
21543	NC_019753	AGA	2	6	1052946	1052951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304536
21544	NC_019753	GGT	4	12	1052971	1052982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304536
21545	NC_019753	CCT	2	6	1053061	1053066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428304536
21546	NC_019753	GCT	2	6	1053091	1053096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304536
21547	NC_019753	TGG	2	6	1053202	1053207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304536
21548	NC_019753	TGG	3	9	1053210	1053218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304536
21549	NC_019753	CAAG	2	8	1053279	1053286	50 %	0 %	25 %	25 %	428304536
21550	NC_019753	AC	3	6	1053293	1053298	50 %	0 %	0 %	50 %	428304536
21551	NC_019753	ACT	2	6	1053308	1053313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304536
21552	NC_019753	GTGG	2	8	1053379	1053386	0 %	25 %	75 %	0 %	428304536
21553	NC_019753	T	6	6	1053391	1053396	0 %	100 %	0 %	0 %	428304536
21554	NC_019753	ATT	2	6	1053504	1053509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304536
21555	NC_019753	T	6	6	1053537	1053542	0 %	100 %	0 %	0 %	428304536
21556	NC_019753	CGG	2	6	1053571	1053576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428304536
21557	NC_019753	TCG	2	6	1053618	1053623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304536
21558	NC_019753	TGA	2	6	1053829	1053834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21559	NC_019753	ATT	2	6	1053855	1053860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21560	NC_019753	ATTTA	2	10	1053883	1053892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21561	NC_019753	ACTT	2	8	1053908	1053915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21562	NC_019753	GTAAG	2	10	1053917	1053926	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21563	NC_019753	ACT	2	6	1053931	1053936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21564	NC_019753	AGT	2	6	1053945	1053950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21565	NC_019753	ATG	2	6	1053991	1053996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21566	NC_019753	TC	3	6	1054010	1054015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21567	NC_019753	AGG	2	6	1054044	1054049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21568	NC_019753	AGA	2	6	1054050	1054055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21569	NC_019753	ACA	2	6	1054083	1054088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304537
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21571	NC_019753	ATG	2	6	1054347	1054352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304537
21572	NC_019753	ATTG	2	8	1054424	1054431	25 %	50 %	25 %	0 %	428304537
21573	NC_019753	CG	3	6	1054433	1054438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21574	NC_019753	CAA	2	6	1054459	1054464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21575	NC_019753	GCA	2	6	1054482	1054487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304538
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21578	NC_019753	TGGT	2	8	1054660	1054667	0 %	50 %	50 %	0 %	428304538
21579	NC_019753	GTT	2	6	1054692	1054697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304538
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21581	NC_019753	GTA	2	6	1054732	1054737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304538
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21585	NC_019753	TAAT	2	8	1055056	1055063	50 %	50 %	0 %	0 %	428304538
21586	NC_019753	TAA	2	6	1055096	1055101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21587	NC_019753	AAC	2	6	1055121	1055126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21588	NC_019753	TAT	2	6	1055132	1055137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21589	NC_019753	TAG	2	6	1055158	1055163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21590	NC_019753	TAC	2	6	1055176	1055181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21591	NC_019753	TAA	2	6	1055283	1055288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304539
21592	NC_019753	GTG	2	6	1055323	1055328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304539
21593	NC_019753	GAA	2	6	1055329	1055334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304539
21594	NC_019753	ATC	2	6	1055381	1055386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304539
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21597	NC_019753	AATT	2	8	1055564	1055571	50 %	50 %	0 %	0 %	428304539
21598	NC_019753	GATTG	2	10	1055572	1055581	20 %	40 %	40 %	0 %	428304539
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21602	NC_019753	A	6	6	1055828	1055833	100 %	0 %	0 %	0 %	428304539
21603	NC_019753	A	6	6	1055881	1055886	100 %	0 %	0 %	0 %	428304539
21604	NC_019753	A	6	6	1055906	1055911	100 %	0 %	0 %	0 %	428304539
21605	NC_019753	CAA	2	6	1055926	1055931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304539
21606	NC_019753	ATTAA	2	10	1055983	1055992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21607	NC_019753	GTT	2	6	1056015	1056020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21608	NC_019753	CTC	2	6	1056022	1056027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21609	NC_019753	ATTAA	2	10	1056097	1056106	60 %	40 %	0 %	0 %	428304540
21610	NC_019753	CGG	3	9	1056130	1056138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428304540
21611	NC_019753	CAT	2	6	1056308	1056313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304540
21612	NC_019753	AG	3	6	1056371	1056376	50 %	0 %	50 %	0 %	428304540
21613	NC_019753	T	6	6	1056401	1056406	0 %	100 %	0 %	0 %	428304540
21614	NC_019753	ACA	2	6	1056419	1056424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21615	NC_019753	GTA	2	6	1056452	1056457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21616	NC_019753	TCCG	2	8	1056473	1056480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21617	NC_019753	T	6	6	1056533	1056538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21618	NC_019753	TAGTG	2	10	1056678	1056687	20 %	40 %	40 %	0 %	428304541
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