MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_019753	GTT	2	6	680632	680637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304221
14002	NC_019753	GCC	2	6	680666	680671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428304221
14003	NC_019753	TTG	2	6	680695	680700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304221
14004	NC_019753	CCA	2	6	680774	680779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304221
14005	NC_019753	GT	3	6	680794	680799	0 %	50 %	50 %	0 %	428304221
14006	NC_019753	AAC	2	6	680831	680836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304221
14007	NC_019753	AT	3	6	680839	680844	50 %	50 %	0 %	0 %	428304221
14008	NC_019753	CCA	2	6	680845	680850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304221
14009	NC_019753	GAT	2	6	680852	680857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304221
14010	NC_019753	CTA	2	6	680967	680972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304221
14011	NC_019753	AAAGT	2	10	680977	680986	60 %	20 %	20 %	0 %	428304221
14012	NC_019753	CAT	2	6	681049	681054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304221
14013	NC_019753	GCT	2	6	681131	681136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304221
14014	NC_019753	A	6	6	681155	681160	100 %	0 %	0 %	0 %	428304221
14015	NC_019753	AAT	2	6	681201	681206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304221
14016	NC_019753	CTT	2	6	681237	681242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304221
14017	NC_019753	GTT	2	6	681244	681249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304221
14018	NC_019753	T	7	7	681248	681254	0 %	100 %	0 %	0 %	428304221
14019	NC_019753	TG	3	6	681270	681275	0 %	50 %	50 %	0 %	428304221
14020	NC_019753	TCTA	2	8	681328	681335	25 %	50 %	0 %	25 %	428304221
14021	NC_019753	GTT	2	6	681339	681344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304221
14022	NC_019753	ATTT	2	8	681370	681377	25 %	75 %	0 %	0 %	428304222
14023	NC_019753	TAG	2	6	681386	681391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304222
14024	NC_019753	ATG	2	6	681394	681399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304222
14025	NC_019753	AGC	2	6	681408	681413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304222
14026	NC_019753	GCTTT	2	10	681493	681502	0 %	60 %	20 %	20 %	428304222
14027	NC_019753	CAT	2	6	681527	681532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304222
14028	NC_019753	CAT	2	6	681587	681592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304222
14029	NC_019753	AAAT	2	8	681603	681610	75 %	25 %	0 %	0 %	428304222
14030	NC_019753	TAT	2	6	681710	681715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304222
14031	NC_019753	TTG	3	9	681726	681734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304222
14032	NC_019753	CTG	3	9	681735	681743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304222
14033	NC_019753	TTG	3	9	681756	681764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304222
14034	NC_019753	T	8	8	681777	681784	0 %	100 %	0 %	0 %	428304222
14035	NC_019753	TTG	2	6	681826	681831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304222
14036	NC_019753	TGAT	2	8	681891	681898	25 %	50 %	25 %	0 %	428304222
14037	NC_019753	CAC	2	6	681932	681937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304222
14038	NC_019753	GAA	2	6	681956	681961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304222
14039	NC_019753	GTT	2	6	681986	681991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304222
14040	NC_019753	GTTTG	2	10	682000	682009	0 %	60 %	40 %	0 %	428304222
14041	NC_019753	CAA	3	9	682031	682039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304222
14042	NC_019753	TAGT	2	8	682220	682227	25 %	50 %	25 %	0 %	428304222
14043	NC_019753	GGA	2	6	682234	682239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_019753	GTT	2	6	682326	682331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_019753	ATC	2	6	682350	682355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_019753	CT	3	6	682472	682477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14047	NC_019753	TAA	2	6	682518	682523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_019753	TA	3	6	682547	682552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_019753	AAT	2	6	682572	682577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_019753	TCA	2	6	682588	682593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_019753	TGA	2	6	682663	682668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_019753	ATT	2	6	682708	682713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_019753	T	7	7	682718	682724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_019753	ATA	2	6	682734	682739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_019753	TTA	2	6	682772	682777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304223
14056	NC_019753	TTC	2	6	682799	682804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304223
14057	NC_019753	GTT	2	6	682889	682894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304223
14058	NC_019753	TGT	2	6	682950	682955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304223
14059	NC_019753	TCT	2	6	682992	682997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304223
14060	NC_019753	AT	3	6	683052	683057	50 %	50 %	0 %	0 %	428304223
14061	NC_019753	AAT	2	6	683084	683089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304223
14062	NC_019753	TAA	2	6	683120	683125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304223
14063	NC_019753	TGGCT	2	10	683133	683142	0 %	40 %	40 %	20 %	428304223
14064	NC_019753	AAATC	2	10	683148	683157	60 %	20 %	0 %	20 %	428304223
14065	NC_019753	TTC	2	6	683186	683191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304223
14066	NC_019753	GCT	2	6	683200	683205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304223
14067	NC_019753	TCA	2	6	683244	683249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304223
14068	NC_019753	GC	4	8	683353	683360	0 %	0 %	50 %	50 %	428304223
14069	NC_019753	TAA	2	6	683367	683372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304223
14070	NC_019753	ATAA	2	8	683384	683391	75 %	25 %	0 %	0 %	428304223
14071	NC_019753	TCTA	2	8	683498	683505	25 %	50 %	0 %	25 %	428304223
14072	NC_019753	CTT	2	6	683509	683514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304223
14073	NC_019753	AGT	2	6	683572	683577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304223
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14076	NC_019753	T	6	6	683660	683665	0 %	100 %	0 %	0 %	428304223
14077	NC_019753	ATTA	2	8	683684	683691	50 %	50 %	0 %	0 %	428304223
14078	NC_019753	T	8	8	683697	683704	0 %	100 %	0 %	0 %	428304223
14079	NC_019753	AACC	2	8	683721	683728	50 %	0 %	0 %	50 %	428304223
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14082	NC_019753	CTT	2	6	683887	683892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304223
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14086	NC_019753	AT	3	6	684089	684094	50 %	50 %	0 %	0 %	428304223
14087	NC_019753	GAA	2	6	684129	684134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304223
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14089	NC_019753	TCA	2	6	684156	684161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304223
14090	NC_019753	TAACT	2	10	684185	684194	40 %	40 %	0 %	20 %	428304223
14091	NC_019753	TCA	2	6	684195	684200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304223
14092	NC_019753	GTTTT	2	10	684257	684266	0 %	80 %	20 %	0 %	428304223
14093	NC_019753	GAA	2	6	684267	684272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304223
14094	NC_019753	AAG	2	6	684291	684296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304223
14095	NC_019753	AT	3	6	684330	684335	50 %	50 %	0 %	0 %	428304223
14096	NC_019753	AT	3	6	684337	684342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_019753	AGT	2	6	684349	684354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_019753	TG	3	6	684399	684404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_019753	CTT	2	6	684445	684450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304224
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14103	NC_019753	G	6	6	684593	684598	0 %	0 %	100 %	0 %	428304224
14104	NC_019753	TGG	2	6	684715	684720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304224
14105	NC_019753	TCA	2	6	684721	684726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304224
14106	NC_019753	TGA	2	6	684734	684739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304224
14107	NC_019753	GATT	2	8	684758	684765	25 %	50 %	25 %	0 %	428304224
14108	NC_019753	CTT	2	6	684814	684819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304224
14109	NC_019753	T	6	6	684818	684823	0 %	100 %	0 %	0 %	428304224
14110	NC_019753	GAT	2	6	684837	684842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304224
14111	NC_019753	TAA	2	6	684860	684865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304224
14112	NC_019753	TTAA	2	8	684924	684931	50 %	50 %	0 %	0 %	428304224
14113	NC_019753	T	6	6	684998	685003	0 %	100 %	0 %	0 %	428304224
14114	NC_019753	GCTGTC	2	12	685035	685046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304224
14115	NC_019753	AT	3	6	685082	685087	50 %	50 %	0 %	0 %	428304224
14116	NC_019753	GTT	2	6	685167	685172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304224
14117	NC_019753	TG	3	6	685174	685179	0 %	50 %	50 %	0 %	428304224
14118	NC_019753	AGC	2	6	685223	685228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304224
14119	NC_019753	GAT	2	6	685254	685259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304224
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14121	NC_019753	TGGG	2	8	685441	685448	0 %	25 %	75 %	0 %	428304224
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14123	NC_019753	AGA	2	6	685517	685522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304224
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14357	NC_019753	ACT	2	6	696469	696474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14360	NC_019753	CTACCT	2	12	696638	696649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428304233
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14365	NC_019753	CAC	2	6	696801	696806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304233
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14491	NC_019753	ACA	2	6	702825	702830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304241
14492	NC_019753	ATC	2	6	702854	702859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304241
14493	NC_019753	TGT	2	6	702876	702881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304241
14494	NC_019753	AGGTCA	2	12	702900	702911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428304241
14495	NC_019753	GAC	2	6	702931	702936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304241
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14497	NC_019753	A	6	6	702982	702987	100 %	0 %	0 %	0 %	428304241
14498	NC_019753	TGA	2	6	703011	703016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304241
14499	NC_019753	A	6	6	703070	703075	100 %	0 %	0 %	0 %	428304241
14500	NC_019753	CAA	2	6	703153	703158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304241

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