MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_019753	AT	3	6	631399	631404	50 %	50 %	0 %	0 %	428304184
13002	NC_019753	GCCAT	2	10	631410	631419	20 %	20 %	20 %	40 %	428304184
13003	NC_019753	A	6	6	631482	631487	100 %	0 %	0 %	0 %	428304184
13004	NC_019753	TCT	2	6	631605	631610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304184
13005	NC_019753	A	6	6	631614	631619	100 %	0 %	0 %	0 %	428304184
13006	NC_019753	AGA	2	6	631652	631657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304184
13007	NC_019753	CCATC	2	10	631703	631712	20 %	20 %	0 %	60 %	428304184
13008	NC_019753	ACA	2	6	631754	631759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_019753	TGA	2	6	631812	631817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_019753	AGA	2	6	631822	631827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_019753	CCA	2	6	631864	631869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13012	NC_019753	GTT	2	6	631926	631931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304185
13013	NC_019753	CTT	2	6	631983	631988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304185
13014	NC_019753	AT	3	6	632051	632056	50 %	50 %	0 %	0 %	428304185
13015	NC_019753	GTA	2	6	632079	632084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_019753	TAAT	2	8	632123	632130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_019753	TTTAC	2	10	632152	632161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13018	NC_019753	TCA	2	6	632211	632216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304186
13019	NC_019753	TTA	2	6	632258	632263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304186
13020	NC_019753	GTT	3	9	632409	632417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_019753	T	6	6	632416	632421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_019753	ATT	2	6	632440	632445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_019753	ATT	2	6	632458	632463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_019753	AGCAA	2	10	632563	632572	60 %	0 %	20 %	20 %	428304187
13025	NC_019753	TAT	2	6	632583	632588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304187
13026	NC_019753	TTA	2	6	632633	632638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304187
13027	NC_019753	GTC	2	6	632726	632731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304187
13028	NC_019753	CAA	2	6	632736	632741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304187
13029	NC_019753	CTG	2	6	632834	632839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_019753	ACG	2	6	632855	632860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_019753	TA	3	6	632866	632871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_019753	GTA	2	6	632945	632950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_019753	TA	4	8	632972	632979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_019753	CCA	2	6	633015	633020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304188
13035	NC_019753	AGTA	2	8	633023	633030	50 %	25 %	25 %	0 %	428304188
13036	NC_019753	ACG	3	9	633062	633070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304188
13037	NC_019753	GGA	2	6	633159	633164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304188
13038	NC_019753	AATT	2	8	633178	633185	50 %	50 %	0 %	0 %	428304188
13039	NC_019753	TTC	2	6	633206	633211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304188
13040	NC_019753	ATTG	2	8	633239	633246	25 %	50 %	25 %	0 %	428304188
13041	NC_019753	GAT	2	6	633261	633266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304188
13042	NC_019753	ATA	2	6	633272	633277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304188
13043	NC_019753	TAAA	2	8	633320	633327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_019753	AG	3	6	633342	633347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_019753	AAG	2	6	633362	633367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304189
13046	NC_019753	GCA	2	6	633392	633397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304189
13047	NC_019753	CAG	2	6	633574	633579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304189
13048	NC_019753	GGA	2	6	633625	633630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304189
13049	NC_019753	ATT	2	6	633645	633650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304189
13050	NC_019753	AACA	2	8	633674	633681	75 %	0 %	0 %	25 %	428304189
13051	NC_019753	TG	3	6	633722	633727	0 %	50 %	50 %	0 %	428304189
13052	NC_019753	TGA	2	6	633734	633739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304189
13053	NC_019753	GGA	2	6	633751	633756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304189
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13055	NC_019753	AGC	2	6	633867	633872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304189
13056	NC_019753	ATA	2	6	633875	633880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304189
13057	NC_019753	GGT	2	6	633925	633930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304189
13058	NC_019753	TTTTA	2	10	634038	634047	20 %	80 %	0 %	0 %	428304189
13059	NC_019753	GTTG	2	8	634130	634137	0 %	50 %	50 %	0 %	428304190
13060	NC_019753	ACC	2	6	634168	634173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304190
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13062	NC_019753	TTG	2	6	634282	634287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304190
13063	NC_019753	GAG	2	6	634320	634325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304190
13064	NC_019753	CAT	2	6	634332	634337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304190
13065	NC_019753	TGG	2	6	634360	634365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304190
13066	NC_019753	TAA	2	6	634393	634398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304190
13067	NC_019753	CAG	2	6	634428	634433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304190
13068	NC_019753	TTC	2	6	634489	634494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304190
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13070	NC_019753	ATC	2	6	634525	634530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304190
13071	NC_019753	ATTA	2	8	634531	634538	50 %	50 %	0 %	0 %	428304190
13072	NC_019753	CAA	2	6	634584	634589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304190
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13074	NC_019753	CTTC	2	8	634628	634635	0 %	50 %	0 %	50 %	428304190
13075	NC_019753	CAA	2	6	634697	634702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304190
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13077	NC_019753	CTA	2	6	634776	634781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304190
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13079	NC_019753	GA	3	6	634807	634812	50 %	0 %	50 %	0 %	428304190
13080	NC_019753	CTA	2	6	634832	634837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304190
13081	NC_019753	TGA	2	6	634859	634864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304190
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13083	NC_019753	TTAG	2	8	634958	634965	25 %	50 %	25 %	0 %	428304190
13084	NC_019753	TTCA	2	8	634978	634985	25 %	50 %	0 %	25 %	428304190
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13087	NC_019753	AAT	3	9	635096	635104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304191
13088	NC_019753	TAG	2	6	635180	635185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304191
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13090	NC_019753	GA	3	6	635264	635269	50 %	0 %	50 %	0 %	428304191
13091	NC_019753	TAATC	2	10	635373	635382	40 %	40 %	0 %	20 %	428304191
13092	NC_019753	TAA	2	6	635406	635411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304191
13093	NC_019753	TTCG	2	8	635442	635449	0 %	50 %	25 %	25 %	428304191
13094	NC_019753	GTA	2	6	635455	635460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304191
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13097	NC_019753	GAC	2	6	635597	635602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304191
13098	NC_019753	GCA	2	6	635696	635701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304191
13099	NC_019753	ATC	2	6	635709	635714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304191
13100	NC_019753	GTCT	2	8	635780	635787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13101	NC_019753	A	7	7	635813	635819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_019753	A	6	6	636013	636018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_019753	CGA	2	6	636066	636071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304192
13104	NC_019753	ATT	2	6	636121	636126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304192
13105	NC_019753	CAT	2	6	636138	636143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304192
13106	NC_019753	A	6	6	636159	636164	100 %	0 %	0 %	0 %	428304192
13107	NC_019753	CGA	2	6	636218	636223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304192
13108	NC_019753	CTA	2	6	636230	636235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304192
13109	NC_019753	CGAA	2	8	636278	636285	50 %	0 %	25 %	25 %	428304192
13110	NC_019753	AGG	2	6	636349	636354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304192
13111	NC_019753	ACA	2	6	636482	636487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_019753	CAT	2	6	636525	636530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304193
13113	NC_019753	AAC	2	6	636536	636541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304193
13114	NC_019753	CCA	2	6	636649	636654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304193
13115	NC_019753	TG	3	6	636677	636682	0 %	50 %	50 %	0 %	428304193
13116	NC_019753	GCT	2	6	636715	636720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304193
13117	NC_019753	CCG	2	6	636822	636827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428304193
13118	NC_019753	AGG	2	6	636836	636841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304193
13119	NC_019753	AGAA	2	8	636932	636939	75 %	0 %	25 %	0 %	428304193
13120	NC_019753	CTG	2	6	636965	636970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304193
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13122	NC_019753	TTG	2	6	637055	637060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304193
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13124	NC_019753	CAA	2	6	637091	637096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304193
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13228	NC_019753	GAACGA	2	12	641619	641630	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13229	NC_019753	ATT	2	6	641685	641690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13230	NC_019753	TCAAAT	2	12	641714	641725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13231	NC_019753	T	7	7	641761	641767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13232	NC_019753	A	6	6	641784	641789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_019753	C	6	6	641797	641802	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13234	NC_019753	G	6	6	641807	641812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13235	NC_019753	AAG	2	6	641849	641854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13236	NC_019753	CAAT	2	8	641876	641883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13237	NC_019753	CAG	2	6	641884	641889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13238	NC_019753	CAAT	2	8	641898	641905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13239	NC_019753	AG	3	6	641930	641935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13240	NC_019753	TAG	2	6	642029	642034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13241	NC_019753	TGAT	2	8	642048	642055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_019753	CCA	2	6	642069	642074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13243	NC_019753	ACTG	2	8	642094	642101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13244	NC_019753	CAAG	2	8	642109	642116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13245	NC_019753	CAAT	2	8	642120	642127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13357	NC_019753	GA	3	6	647408	647413	50 %	0 %	50 %	0 %	428304204
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13359	NC_019753	TCCC	2	8	647468	647475	0 %	25 %	0 %	75 %	428304204
13360	NC_019753	TTAA	2	8	647481	647488	50 %	50 %	0 %	0 %	428304204
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13491	NC_019753	CAG	2	6	652709	652714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13492	NC_019753	TGA	2	6	652734	652739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13494	NC_019753	CAT	2	6	652936	652941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13495	NC_019753	ATA	2	6	652946	652951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_019753	TTC	2	6	653011	653016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13497	NC_019753	ACTA	2	8	653023	653030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13498	NC_019753	TTA	2	6	653170	653175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_019753	GAA	2	6	653202	653207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_019753	ATT	2	6	653223	653228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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