MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_019753	GTCAA	2	10	608573	608582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12502	NC_019753	GAA	2	6	608605	608610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_019753	TCC	2	6	608709	608714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_019753	GCAG	2	8	608749	608756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_019753	AAG	2	6	608765	608770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_019753	CAA	2	6	608833	608838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_019753	TTAA	2	8	608890	608897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_019753	TC	3	6	608950	608955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_019753	GAT	2	6	608998	609003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_019753	ACTT	2	8	609015	609022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_019753	ATCC	2	8	609063	609070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12512	NC_019753	CCT	2	6	609107	609112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12513	NC_019753	AGA	2	6	609219	609224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_019753	TCG	2	6	609228	609233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_019753	AGA	2	6	609270	609275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_019753	AC	3	6	609336	609341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12517	NC_019753	TGC	2	6	609393	609398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_019753	GTT	2	6	609493	609498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_019753	TAC	2	6	609532	609537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_019753	GGA	2	6	609580	609585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_019753	ACG	2	6	609638	609643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_019753	ATG	2	6	609748	609753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_019753	CGG	3	9	609757	609765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_019753	CGA	2	6	609780	609785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_019753	AGA	2	6	609786	609791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_019753	ACA	2	6	609809	609814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_019753	ACC	2	6	609817	609822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_019753	T	6	6	610012	610017	0 %	100 %	0 %	0 %	428304174
12529	NC_019753	CTAA	2	8	610050	610057	50 %	25 %	0 %	25 %	428304174
12530	NC_019753	TA	3	6	610262	610267	50 %	50 %	0 %	0 %	428304174
12531	NC_019753	TCG	2	6	610310	610315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304174
12532	NC_019753	CT	3	6	610316	610321	0 %	50 %	0 %	50 %	428304174
12533	NC_019753	CTA	2	6	610369	610374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304174
12534	NC_019753	ATA	2	6	610395	610400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304174
12535	NC_019753	T	6	6	610407	610412	0 %	100 %	0 %	0 %	428304174
12536	NC_019753	TCT	2	6	610426	610431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304174
12537	NC_019753	AAT	2	6	610438	610443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304174
12538	NC_019753	CTA	3	9	610498	610506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304174
12539	NC_019753	CTT	2	6	610525	610530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304174
12540	NC_019753	ATT	2	6	610544	610549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304174
12541	NC_019753	T	10	10	610553	610562	0 %	100 %	0 %	0 %	428304174
12542	NC_019753	CAA	2	6	610586	610591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304174
12543	NC_019753	AT	3	6	610621	610626	50 %	50 %	0 %	0 %	428304174
12544	NC_019753	TG	3	6	610627	610632	0 %	50 %	50 %	0 %	428304174
12545	NC_019753	TCAC	2	8	610641	610648	25 %	25 %	0 %	50 %	428304174
12546	NC_019753	TAG	2	6	610664	610669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304174
12547	NC_019753	TAA	2	6	610706	610711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304174
12548	NC_019753	ACC	3	9	610745	610753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304174
12549	NC_019753	T	7	7	610754	610760	0 %	100 %	0 %	0 %	428304174
12550	NC_019753	ATT	2	6	610761	610766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304174
12551	NC_019753	TTC	3	9	610778	610786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304174
12552	NC_019753	GATT	2	8	610797	610804	25 %	50 %	25 %	0 %	428304174
12553	NC_019753	GCTTCT	2	12	610812	610823	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428304174
12554	NC_019753	TTG	2	6	610841	610846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304174
12555	NC_019753	GATGT	2	10	610887	610896	20 %	40 %	40 %	0 %	428304174
12556	NC_019753	CAG	2	6	610919	610924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_019753	ATC	2	6	610942	610947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_019753	T	6	6	610968	610973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_019753	CAAG	2	8	610990	610997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12560	NC_019753	TAC	2	6	611067	611072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_019753	AG	3	6	611101	611106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_019753	A	6	6	611124	611129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_019753	T	6	6	611263	611268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_019753	AGA	3	9	611320	611328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_019753	TACT	2	8	611363	611370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12566	NC_019753	AGC	2	6	611380	611385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_019753	AGG	2	6	611389	611394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_019753	TTCT	2	8	611403	611410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12569	NC_019753	A	7	7	611438	611444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_019753	ACC	2	6	611544	611549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12571	NC_019753	TGG	2	6	611623	611628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_019753	CAG	2	6	611639	611644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_019753	TTCT	2	8	611697	611704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12574	NC_019753	CTTT	2	8	611779	611786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12575	NC_019753	AAG	2	6	611790	611795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12579	NC_019753	T	6	6	611973	611978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_019753	GCA	2	6	611979	611984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12583	NC_019753	TAG	2	6	612159	612164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_019753	T	6	6	612165	612170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_019753	GCA	2	6	612191	612196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_019753	GGGCT	2	10	612217	612226	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12587	NC_019753	GAA	2	6	612266	612271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_019753	TTG	2	6	612290	612295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_019753	TCT	2	6	612368	612373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12591	NC_019753	TAAC	2	8	612424	612431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12592	NC_019753	ATT	2	6	612536	612541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_019753	AATC	2	8	612548	612555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12594	NC_019753	TC	3	6	612577	612582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12595	NC_019753	CAAA	2	8	612728	612735	75 %	0 %	0 %	25 %	428304175
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12597	NC_019753	TGC	2	6	612875	612880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304175
12598	NC_019753	CATA	2	8	612909	612916	50 %	25 %	0 %	25 %	428304175
12599	NC_019753	CATT	2	8	612954	612961	25 %	50 %	0 %	25 %	428304175
12600	NC_019753	ACG	2	6	612973	612978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304175
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12602	NC_019753	AAATT	2	10	613060	613069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_019753	AAAT	2	8	613092	613099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_019753	GGA	2	6	613346	613351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304176
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12607	NC_019753	GTCA	2	8	613503	613510	25 %	25 %	25 %	25 %	428304176
12608	NC_019753	GGA	2	6	613520	613525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428304176
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12610	NC_019753	TGG	2	6	613609	613614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304176
12611	NC_019753	CGA	2	6	613635	613640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304176
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12617	NC_019753	TGGG	2	8	613830	613837	0 %	25 %	75 %	0 %	428304176
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12625	NC_019753	GCAG	2	8	614273	614280	25 %	0 %	50 %	25 %	428304176
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12995	NC_019753	TAT	2	6	631157	631162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12996	NC_019753	CAA	2	6	631210	631215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12997	NC_019753	TAAA	2	8	631247	631254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12998	NC_019753	ATT	2	6	631301	631306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12999	NC_019753	T	7	7	631314	631320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13000	NC_019753	CTG	2	6	631332	631337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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