MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_019753	CTA	2	6	559525	559530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304133
11502	NC_019753	T	6	6	559601	559606	0 %	100 %	0 %	0 %	428304133
11503	NC_019753	TCT	2	6	559648	559653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304133
11504	NC_019753	TGC	2	6	559718	559723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304133
11505	NC_019753	TCA	2	6	559743	559748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304133
11506	NC_019753	ATTG	2	8	559768	559775	25 %	50 %	25 %	0 %	428304133
11507	NC_019753	TTG	2	6	559853	559858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304133
11508	NC_019753	GGT	2	6	559875	559880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304133
11509	NC_019753	TTTA	2	8	559982	559989	25 %	75 %	0 %	0 %	428304133
11510	NC_019753	TCA	2	6	560004	560009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304133
11511	NC_019753	CCA	2	6	560088	560093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304133
11512	NC_019753	AACT	2	8	560111	560118	50 %	25 %	0 %	25 %	428304133
11513	NC_019753	TCC	2	6	560123	560128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428304133
11514	NC_019753	GCA	2	6	560151	560156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304133
11515	NC_019753	T	6	6	560190	560195	0 %	100 %	0 %	0 %	428304133
11516	NC_019753	TAA	2	6	560201	560206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304133
11517	NC_019753	CTT	2	6	560212	560217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304133
11518	NC_019753	GCA	2	6	560310	560315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304133
11519	NC_019753	CTT	2	6	560386	560391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304133
11520	NC_019753	TAGT	2	8	560448	560455	25 %	50 %	25 %	0 %	428304133
11521	NC_019753	TGA	2	6	560464	560469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304133
11522	NC_019753	ATA	2	6	560489	560494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304133
11523	NC_019753	TAT	2	6	560497	560502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304133
11524	NC_019753	AAT	2	6	560513	560518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304133
11525	NC_019753	GTC	2	6	560540	560545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304133
11526	NC_019753	TAT	2	6	560551	560556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304133
11527	NC_019753	ATT	2	6	560624	560629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304133
11528	NC_019753	GGT	2	6	560649	560654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304133
11529	NC_019753	CTG	2	6	560752	560757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304133
11530	NC_019753	CTG	2	6	560811	560816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304133
11531	NC_019753	AATT	2	8	560831	560838	50 %	50 %	0 %	0 %	428304133
11532	NC_019753	CAC	2	6	560879	560884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304133
11533	NC_019753	GGTA	2	8	560931	560938	25 %	25 %	50 %	0 %	428304133
11534	NC_019753	AACT	2	8	560960	560967	50 %	25 %	0 %	25 %	428304133
11535	NC_019753	CATT	2	8	561007	561014	25 %	50 %	0 %	25 %	428304133
11536	NC_019753	TTA	2	6	561057	561062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304133
11537	NC_019753	TAA	2	6	561074	561079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304133
11538	NC_019753	TAT	2	6	561169	561174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304133
11539	NC_019753	CAA	2	6	561175	561180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428304133
11540	NC_019753	TGT	2	6	561210	561215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304133
11541	NC_019753	T	6	6	561215	561220	0 %	100 %	0 %	0 %	428304133
11542	NC_019753	ATT	2	6	561245	561250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304133
11543	NC_019753	T	6	6	561286	561291	0 %	100 %	0 %	0 %	428304133
11544	NC_019753	CAT	2	6	561322	561327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304133
11545	NC_019753	AGTTA	2	10	561335	561344	40 %	40 %	20 %	0 %	428304133
11546	NC_019753	GTT	2	6	561346	561351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304133
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11549	NC_019753	TAAT	2	8	561406	561413	50 %	50 %	0 %	0 %	428304133
11550	NC_019753	ATA	2	6	561432	561437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304133
11551	NC_019753	TGTT	2	8	561460	561467	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_019753	ATT	2	6	561567	561572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304134
11553	NC_019753	TCAA	2	8	561590	561597	50 %	25 %	0 %	25 %	428304134
11554	NC_019753	T	6	6	561636	561641	0 %	100 %	0 %	0 %	428304134
11555	NC_019753	CTTC	2	8	561674	561681	0 %	50 %	0 %	50 %	428304134
11556	NC_019753	TAA	2	6	561691	561696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304134
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11560	NC_019753	GTG	2	6	561971	561976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428304134
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11562	NC_019753	TCG	2	6	562113	562118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304134
11563	NC_019753	TCT	2	6	562134	562139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_019753	A	6	6	562143	562148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_019753	TC	3	6	562223	562228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_019753	TACC	2	8	562251	562258	25 %	25 %	0 %	50 %	428304135
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11573	NC_019753	CT	3	6	562437	562442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11574	NC_019753	AGT	2	6	562449	562454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11576	NC_019753	A	6	6	562489	562494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11602	NC_019753	GTGCT	2	10	563736	563745	0 %	40 %	40 %	20 %	428304136
11603	NC_019753	GTTT	2	8	563747	563754	0 %	75 %	25 %	0 %	428304136
11604	NC_019753	TTAG	2	8	563779	563786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_019753	AGT	2	6	563787	563792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11608	NC_019753	A	6	6	564114	564119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_019753	AT	3	6	564144	564149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_019753	TTAA	2	8	564166	564173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_019753	TA	3	6	564343	564348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_019753	AAC	2	6	564349	564354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_019753	TAG	2	6	564386	564391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11615	NC_019753	CAA	2	6	564406	564411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_019753	TAG	2	6	564462	564467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11621	NC_019753	TCAAT	2	10	564584	564593	40 %	40 %	0 %	20 %	428304137
11622	NC_019753	TATC	2	8	564629	564636	25 %	50 %	0 %	25 %	428304137
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11993	NC_019753	T	7	7	583272	583278	0 %	100 %	0 %	0 %	428304153
11994	NC_019753	T	7	7	583316	583322	0 %	100 %	0 %	0 %	428304153
11995	NC_019753	TAA	2	6	583338	583343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304153
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11997	NC_019753	GGTA	2	8	583436	583443	25 %	25 %	50 %	0 %	428304153
11998	NC_019753	TGGATC	2	12	583455	583466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428304153
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