MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019753	AATT	2	8	532515	532522	50 %	50 %	0 %	0 %	428304113
11002	NC_019753	AT	3	6	532582	532587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_019753	ATG	2	6	532596	532601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_019753	AAAT	2	8	532684	532691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_019753	TAG	2	6	532713	532718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_019753	ATA	2	6	532812	532817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_019753	TTA	2	6	532828	532833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_019753	CAA	2	6	532877	532882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_019753	TTG	2	6	532923	532928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_019753	ATT	2	6	532954	532959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_019753	ATT	2	6	532974	532979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_019753	ATT	2	6	533088	533093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_019753	TCA	2	6	533165	533170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304114
11014	NC_019753	CATT	2	8	533175	533182	25 %	50 %	0 %	25 %	428304114
11015	NC_019753	ACC	2	6	533197	533202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304114
11016	NC_019753	AGC	2	6	533247	533252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304114
11017	NC_019753	CTA	2	6	533283	533288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304114
11018	NC_019753	CCAT	2	8	533303	533310	25 %	25 %	0 %	50 %	428304114
11019	NC_019753	TTA	2	6	533432	533437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304114
11020	NC_019753	ACC	2	6	533542	533547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304114
11021	NC_019753	CAAG	2	8	533669	533676	50 %	0 %	25 %	25 %	428304114
11022	NC_019753	TA	3	6	533731	533736	50 %	50 %	0 %	0 %	428304114
11023	NC_019753	TGC	2	6	533772	533777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304114
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11025	NC_019753	TAT	2	6	534141	534146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304114
11026	NC_019753	CAT	2	6	534174	534179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304114
11027	NC_019753	TA	3	6	534192	534197	50 %	50 %	0 %	0 %	428304114
11028	NC_019753	AG	3	6	534203	534208	50 %	0 %	50 %	0 %	428304114
11029	NC_019753	AAAT	2	8	534217	534224	75 %	25 %	0 %	0 %	428304114
11030	NC_019753	TAAA	2	8	534241	534248	75 %	25 %	0 %	0 %	428304114
11031	NC_019753	GCT	2	6	534260	534265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304114
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11033	NC_019753	CAC	2	6	534481	534486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304115
11034	NC_019753	TCG	2	6	534594	534599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304115
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11038	NC_019753	GTT	2	6	534767	534772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304115
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11040	NC_019753	AACC	2	8	534849	534856	50 %	0 %	0 %	50 %	428304115
11041	NC_019753	TGCG	2	8	534918	534925	0 %	25 %	50 %	25 %	428304115
11042	NC_019753	GCATCA	2	12	534966	534977	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428304115
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11046	NC_019753	A	6	6	535487	535492	100 %	0 %	0 %	0 %	428304115
11047	NC_019753	GAATT	2	10	535829	535838	40 %	40 %	20 %	0 %	428304116
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11052	NC_019753	GT	3	6	536102	536107	0 %	50 %	50 %	0 %	428304116
11053	NC_019753	GA	4	8	536136	536143	50 %	0 %	50 %	0 %	428304116
11054	NC_019753	TTG	2	6	536167	536172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304116
11055	NC_019753	GTC	2	6	536214	536219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304116
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11057	NC_019753	CGA	2	6	536423	536428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304116
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11059	NC_019753	TGA	2	6	536680	536685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304116
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11063	NC_019753	ACC	2	6	537033	537038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304116
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11095	NC_019753	TTGG	2	8	538582	538589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_019753	A	6	6	538598	538603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11107	NC_019753	TGC	2	6	539202	539207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304118
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11112	NC_019753	AT	3	6	539531	539536	50 %	50 %	0 %	0 %	428304118
11113	NC_019753	TG	3	6	539538	539543	0 %	50 %	50 %	0 %	428304118
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11117	NC_019753	ATT	2	6	539694	539699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_019753	CCA	2	6	539862	539867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304119
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11122	NC_019753	TCTT	2	8	540109	540116	0 %	75 %	0 %	25 %	428304119
11123	NC_019753	ATC	2	6	540181	540186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304119
11124	NC_019753	GCT	2	6	540217	540222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428304119
11125	NC_019753	TCA	2	6	540313	540318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304119
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11128	NC_019753	GTT	2	6	540513	540518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304119
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11131	NC_019753	GTT	2	6	540624	540629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304119
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11136	NC_019753	CCG	2	6	540837	540842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428304119
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11147	NC_019753	TCAT	2	8	541607	541614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11154	NC_019753	GAT	2	6	542192	542197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304121
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11161	NC_019753	TGTA	2	8	542587	542594	25 %	50 %	25 %	0 %	428304121
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11165	NC_019753	AAGC	2	8	542904	542911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11166	NC_019753	CT	3	6	542982	542987	0 %	50 %	0 %	50 %	428304122
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11222	NC_019753	A	6	6	545886	545891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11223	NC_019753	ATT	2	6	545935	545940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304124
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11226	NC_019753	TC	3	6	546015	546020	0 %	50 %	0 %	50 %	428304124
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11230	NC_019753	GTTT	2	8	546190	546197	0 %	75 %	25 %	0 %	428304124
11231	NC_019753	GTT	2	6	546216	546221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304124
11232	NC_019753	CAAC	2	8	546231	546238	50 %	0 %	0 %	50 %	428304124
11233	NC_019753	A	6	6	546277	546282	100 %	0 %	0 %	0 %	428304124
11234	NC_019753	GAA	2	6	546306	546311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428304124
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11237	NC_019753	CAATT	2	10	546412	546421	40 %	40 %	0 %	20 %	428304124
11238	NC_019753	TCT	2	6	546426	546431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304124
11239	NC_019753	T	6	6	546457	546462	0 %	100 %	0 %	0 %	428304124
11240	NC_019753	TAA	2	6	546519	546524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304124
11241	NC_019753	CCA	2	6	546610	546615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304124
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11490	NC_019753	GATT	2	8	558991	558998	25 %	50 %	25 %	0 %	428304133
11491	NC_019753	ATC	2	6	559016	559021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304133
11492	NC_019753	CTGCTT	2	12	559037	559048	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428304133
11493	NC_019753	GTA	2	6	559049	559054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304133
11494	NC_019753	ATT	2	6	559085	559090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304133
11495	NC_019753	ATC	2	6	559118	559123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304133
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11498	NC_019753	GATT	2	8	559297	559304	25 %	50 %	25 %	0 %	428304133
11499	NC_019753	AGC	2	6	559385	559390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428304133
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