MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_019753	CAAT	2	8	5312179	5312186	50 %	25 %	0 %	25 %	428308163
109002	NC_019753	T	6	6	5312190	5312195	0 %	100 %	0 %	0 %	428308163
109003	NC_019753	T	7	7	5312326	5312332	0 %	100 %	0 %	0 %	428308163
109004	NC_019753	AAC	2	6	5312352	5312357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308163
109005	NC_019753	TCA	3	9	5312413	5312421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308163
109006	NC_019753	ATT	2	6	5312484	5312489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308163
109007	NC_019753	ATTA	2	8	5312511	5312518	50 %	50 %	0 %	0 %	428308163
109008	NC_019753	TGCC	2	8	5312522	5312529	0 %	25 %	25 %	50 %	428308163
109009	NC_019753	TTAC	2	8	5312578	5312585	25 %	50 %	0 %	25 %	428308163
109010	NC_019753	CCCAA	2	10	5312588	5312597	40 %	0 %	0 %	60 %	428308163
109011	NC_019753	T	6	6	5312611	5312616	0 %	100 %	0 %	0 %	428308163
109012	NC_019753	CTT	2	6	5312627	5312632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308163
109013	NC_019753	ATAA	2	8	5312693	5312700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109014	NC_019753	TAA	2	6	5312723	5312728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109015	NC_019753	GTT	2	6	5312745	5312750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109016	NC_019753	CTT	2	6	5312756	5312761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109017	NC_019753	ATT	2	6	5312763	5312768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109018	NC_019753	CTT	2	6	5312782	5312787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109019	NC_019753	AAG	2	6	5312801	5312806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308164
109020	NC_019753	TCT	3	9	5312926	5312934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308164
109021	NC_019753	ATGG	2	8	5313033	5313040	25 %	25 %	50 %	0 %	428308164
109022	NC_019753	ACA	2	6	5313043	5313048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308164
109023	NC_019753	TTGAA	2	10	5313060	5313069	40 %	40 %	20 %	0 %	428308164
109024	NC_019753	TCA	2	6	5313103	5313108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308164
109025	NC_019753	TGC	2	6	5313255	5313260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308164
109026	NC_019753	CTT	2	6	5313323	5313328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308164
109027	NC_019753	AAC	2	6	5313393	5313398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109028	NC_019753	GTTA	2	8	5313424	5313431	25 %	50 %	25 %	0 %	428308165
109029	NC_019753	TGC	2	6	5313486	5313491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308165
109030	NC_019753	TTG	2	6	5313592	5313597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308165
109031	NC_019753	AT	3	6	5313599	5313604	50 %	50 %	0 %	0 %	428308165
109032	NC_019753	CTG	2	6	5313701	5313706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308165
109033	NC_019753	TCG	2	6	5313736	5313741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308165
109034	NC_019753	AAAT	2	8	5313814	5313821	75 %	25 %	0 %	0 %	428308165
109035	NC_019753	ATT	2	6	5313834	5313839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308165
109036	NC_019753	ATT	2	6	5313894	5313899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308165
109037	NC_019753	CAAA	2	8	5313911	5313918	75 %	0 %	0 %	25 %	428308165
109038	NC_019753	CCA	2	6	5313919	5313924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308165
109039	NC_019753	CATCC	2	10	5313941	5313950	20 %	20 %	0 %	60 %	428308165
109040	NC_019753	CTT	2	6	5313983	5313988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308165
109041	NC_019753	T	7	7	5314031	5314037	0 %	100 %	0 %	0 %	428308165
109042	NC_019753	GCC	2	6	5314106	5314111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308166
109043	NC_019753	AGT	2	6	5314163	5314168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308166
109044	NC_019753	TTG	2	6	5314197	5314202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308166
109045	NC_019753	GTT	2	6	5314262	5314267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308166
109046	NC_019753	T	6	6	5314298	5314303	0 %	100 %	0 %	0 %	428308166
109047	NC_019753	T	6	6	5314320	5314325	0 %	100 %	0 %	0 %	428308166
109048	NC_019753	TCA	2	6	5314345	5314350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308166
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109051	NC_019753	AAATG	2	10	5314433	5314442	60 %	20 %	20 %	0 %	428308166
109052	NC_019753	ATT	2	6	5314618	5314623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308166
109053	NC_019753	GCTT	2	8	5314715	5314722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109054	NC_019753	GTA	3	9	5314739	5314747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109055	NC_019753	T	6	6	5314766	5314771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109056	NC_019753	TTA	2	6	5314801	5314806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109057	NC_019753	AT	4	8	5314817	5314824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109058	NC_019753	TAT	2	6	5314893	5314898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109059	NC_019753	AAT	2	6	5314966	5314971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308167
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109067	NC_019753	TTG	2	6	5315434	5315439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308167
109068	NC_019753	GT	3	6	5315517	5315522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.