MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_019753	T	6	6	487561	487566	0 %	100 %	0 %	0 %	428304070
10003	NC_019753	TTC	2	6	487587	487592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304070
10004	NC_019753	TTC	2	6	487620	487625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304070
10005	NC_019753	TCT	2	6	487705	487710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304070
10006	NC_019753	CTA	2	6	487754	487759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304070
10007	NC_019753	TCT	2	6	487766	487771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304070
10008	NC_019753	CTA	2	6	487822	487827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304070
10009	NC_019753	AAT	2	6	487876	487881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304070
10010	NC_019753	TTG	2	6	487917	487922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428304070
10011	NC_019753	CCG	2	6	488021	488026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428304070
10012	NC_019753	CAT	2	6	488028	488033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304070
10013	NC_019753	GTA	2	6	488076	488081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304070
10014	NC_019753	CCA	2	6	488147	488152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428304070
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10016	NC_019753	ACT	2	6	488227	488232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_019753	ACC	2	6	488274	488279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_019753	TGT	2	6	488348	488353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_019753	CAA	2	6	488407	488412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_019753	AAGTT	2	10	488441	488450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_019753	GTT	2	6	488455	488460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_019753	A	6	6	488734	488739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_019753	ATGG	2	8	488765	488772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_019753	TTA	2	6	488773	488778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_019753	TGC	2	6	488811	488816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_019753	CAA	2	6	488896	488901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_019753	AAG	2	6	488982	488987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_019753	GTT	2	6	488998	489003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_019753	CAT	2	6	489040	489045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_019753	ACA	2	6	489066	489071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_019753	ACTTA	2	10	489072	489081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10032	NC_019753	T	6	6	489141	489146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_019753	AAG	2	6	489201	489206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_019753	ATT	2	6	489250	489255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_019753	TCC	2	6	489261	489266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_019753	AG	3	6	489295	489300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_019753	GAA	2	6	489346	489351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_019753	GAT	2	6	489433	489438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428304071
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10041	NC_019753	GGTAA	2	10	489624	489633	40 %	20 %	40 %	0 %	428304071
10042	NC_019753	AAT	2	6	489656	489661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304071
10043	NC_019753	ATCA	2	8	489725	489732	50 %	25 %	0 %	25 %	428304071
10044	NC_019753	CGCT	2	8	489758	489765	0 %	25 %	25 %	50 %	428304072
10045	NC_019753	CAT	2	6	489789	489794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304072
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10052	NC_019753	T	6	6	490093	490098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_019753	GCA	2	6	490117	490122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_019753	A	7	7	490167	490173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_019753	AAC	2	6	490185	490190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_019753	GGC	2	6	490264	490269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_019753	GCC	2	6	490274	490279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_019753	T	9	9	490280	490288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_019753	TAC	2	6	490354	490359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10065	NC_019753	TGA	3	9	490465	490473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10068	NC_019753	GTA	2	6	490565	490570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10071	NC_019753	CAAC	2	8	490628	490635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_019753	AAG	2	6	490716	490721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_019753	ACT	2	6	490906	490911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_019753	ATGCTG	2	12	490986	490997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10075	NC_019753	GAA	2	6	491027	491032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_019753	CAG	2	6	491046	491051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_019753	AAG	2	6	491091	491096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10080	NC_019753	AGC	2	6	491191	491196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10085	NC_019753	AGTC	2	8	491413	491420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10089	NC_019753	ACTATC	2	12	491590	491601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10091	NC_019753	GTG	2	6	491622	491627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_019753	AAG	2	6	491628	491633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_019753	TAA	2	6	491680	491685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304073
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10097	NC_019753	TA	3	6	491802	491807	50 %	50 %	0 %	0 %	428304073
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10100	NC_019753	TCTTT	2	10	491917	491926	0 %	80 %	0 %	20 %	428304073
10101	NC_019753	ATA	2	6	491950	491955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428304073
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10104	NC_019753	A	6	6	492053	492058	100 %	0 %	0 %	0 %	428304073
10105	NC_019753	T	6	6	492072	492077	0 %	100 %	0 %	0 %	428304073
10106	NC_019753	ATTC	2	8	492087	492094	25 %	50 %	0 %	25 %	428304073
10107	NC_019753	T	7	7	492095	492101	0 %	100 %	0 %	0 %	428304073
10108	NC_019753	TCC	2	6	492117	492122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428304073
10109	NC_019753	CTCTTC	2	12	492134	492145	0 %	50 %	0 %	50 %	428304073
10110	NC_019753	CTT	2	6	492162	492167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304073
10111	NC_019753	TTC	2	6	492179	492184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304073
10112	NC_019753	TCT	2	6	492195	492200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304073
10113	NC_019753	TAAAC	2	10	492210	492219	60 %	20 %	0 %	20 %	428304073
10114	NC_019753	TCT	2	6	492331	492336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428304073
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10121	NC_019753	CTTCT	2	10	492551	492560	0 %	60 %	0 %	40 %	428304073
10122	NC_019753	A	6	6	492637	492642	100 %	0 %	0 %	0 %	428304073
10123	NC_019753	TCAT	2	8	492670	492677	25 %	50 %	0 %	25 %	428304073
10124	NC_019753	TC	3	6	492698	492703	0 %	50 %	0 %	50 %	428304073
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10494	NC_019753	T	6	6	508587	508592	0 %	100 %	0 %	0 %	428304090
10495	NC_019753	AAAC	2	8	508621	508628	75 %	0 %	0 %	25 %	428304090
10496	NC_019753	ATT	2	6	508673	508678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428304090
10497	NC_019753	GAAT	2	8	508722	508729	50 %	25 %	25 %	0 %	428304090
10498	NC_019753	TTAT	2	8	508809	508816	25 %	75 %	0 %	0 %	428304090
10499	NC_019753	CAT	2	6	508825	508830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428304090
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