MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 1219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	ATG	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019728	ACA	2	6	142	147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303568
3	NC_019728	A	6	6	176	181	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
4	NC_019728	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303568
5	NC_019728	CCAACC	2	12	271	282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303568
6	NC_019728	TTAC	2	8	306	313	25 %	50 %	0 %	25 %	428303568
7	NC_019728	G	7	7	359	365	0 %	0 %	100 %	0 %	428303568
8	NC_019728	CAG	2	6	421	426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303568
9	NC_019728	T	6	6	443	448	0 %	100 %	0 %	0 %	428303568
10	NC_019728	A	6	6	483	488	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
11	NC_019728	A	6	6	528	533	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
12	NC_019728	GTT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303568
13	NC_019728	ATG	2	6	664	669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303568
14	NC_019728	AAAC	2	8	808	815	75 %	0 %	0 %	25 %	428303568
15	NC_019728	TGG	2	6	825	830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303568
16	NC_019728	AG	3	6	891	896	50 %	0 %	50 %	0 %	428303568
17	NC_019728	TTGA	2	8	937	944	25 %	50 %	25 %	0 %	428303568
18	NC_019728	GAA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303568
19	NC_019728	TC	3	6	969	974	0 %	50 %	0 %	50 %	428303568
20	NC_019728	AAG	2	6	986	991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303568
21	NC_019728	AAC	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019728	ATG	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
23	NC_019728	AGA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303569
24	NC_019728	TGG	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303569
25	NC_019728	ACAA	2	8	1263	1270	75 %	0 %	0 %	25 %	428303569
26	NC_019728	CCTT	2	8	1397	1404	0 %	50 %	0 %	50 %	428303569
27	NC_019728	GTAT	2	8	1412	1419	25 %	50 %	25 %	0 %	428303569
28	NC_019728	ATG	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
29	NC_019728	AAG	2	6	1451	1456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303569
30	NC_019728	CTG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303569
31	NC_019728	AGA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303569
32	NC_019728	TGA	3	9	1580	1588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
33	NC_019728	ATT	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303569
34	NC_019728	CTG	2	6	1615	1620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303569
35	NC_019728	TAA	3	9	1640	1648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303569
36	NC_019728	TC	3	6	1651	1656	0 %	50 %	0 %	50 %	428303569
37	NC_019728	AGT	2	6	1677	1682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
38	NC_019728	GCA	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303569
39	NC_019728	AGTG	2	8	1871	1878	25 %	25 %	50 %	0 %	428303569
40	NC_019728	CTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303569
41	NC_019728	ACT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303569
42	NC_019728	GGA	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303569
43	NC_019728	TCT	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303569
44	NC_019728	CTT	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303569
45	NC_019728	AAT	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303569
46	NC_019728	GAT	3	9	2127	2135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
47	NC_019728	ATC	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303570
48	NC_019728	CA	3	6	2183	2188	50 %	0 %	0 %	50 %	428303570
49	NC_019728	ACT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303570
50	NC_019728	CAA	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303570
51	NC_019728	CAG	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
52	NC_019728	AAAG	2	8	2441	2448	75 %	0 %	25 %	0 %	428303570
53	NC_019728	AGCA	2	8	2451	2458	50 %	0 %	25 %	25 %	428303570
54	NC_019728	CAG	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
55	NC_019728	GCA	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
56	NC_019728	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303570
57	NC_019728	GACT	2	8	2632	2639	25 %	25 %	25 %	25 %	428303570
58	NC_019728	TGCTT	2	10	2722	2731	0 %	60 %	20 %	20 %	428303570
59	NC_019728	ATGTA	2	10	2755	2764	40 %	40 %	20 %	0 %	428303570
60	NC_019728	GTTC	2	8	2779	2786	0 %	50 %	25 %	25 %	428303570
61	NC_019728	AGC	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
62	NC_019728	TGG	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303570
63	NC_019728	GAGAA	2	10	2954	2963	60 %	0 %	40 %	0 %	428303570
64	NC_019728	AGC	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
65	NC_019728	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303570
66	NC_019728	ATT	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303570
67	NC_019728	ATTT	2	8	3222	3229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019728	T	7	7	3227	3233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019728	A	8	8	3244	3251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019728	GA	3	6	3478	3483	50 %	0 %	50 %	0 %	428303571
71	NC_019728	GAA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
72	NC_019728	CA	3	6	3630	3635	50 %	0 %	0 %	50 %	428303571
73	NC_019728	AAG	2	6	3716	3721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
74	NC_019728	GAAT	2	8	3773	3780	50 %	25 %	25 %	0 %	428303571
75	NC_019728	AT	3	6	3794	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	428303571
76	NC_019728	A	6	6	3801	3806	100 %	0 %	0 %	0 %	428303571
77	NC_019728	TGA	2	6	3909	3914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303571
78	NC_019728	A	7	7	3919	3925	100 %	0 %	0 %	0 %	428303571
79	NC_019728	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303571
80	NC_019728	GA	3	6	4019	4024	50 %	0 %	50 %	0 %	428303571
81	NC_019728	TGT	2	6	4052	4057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303571
82	NC_019728	AT	3	6	4133	4138	50 %	50 %	0 %	0 %	428303571
83	NC_019728	AAG	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
84	NC_019728	T	6	6	4165	4170	0 %	100 %	0 %	0 %	428303571
85	NC_019728	CGA	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303571
86	NC_019728	GTC	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303571
87	NC_019728	ATC	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303571
88	NC_019728	TTA	2	6	4252	4257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303571
89	NC_019728	CAA	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303571
90	NC_019728	GAA	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
91	NC_019728	TGA	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
92	NC_019728	TAT	2	6	4455	4460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303572
93	NC_019728	AAC	2	6	4477	4482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303572
94	NC_019728	A	6	6	4535	4540	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
95	NC_019728	TG	3	6	4544	4549	0 %	50 %	50 %	0 %	428303572
96	NC_019728	AGA	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
97	NC_019728	CTG	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303572
98	NC_019728	GCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303572
99	NC_019728	AGA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
100	NC_019728	A	8	8	4861	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
101	NC_019728	AT	3	6	4938	4943	50 %	50 %	0 %	0 %	428303572
102	NC_019728	CAA	2	6	4956	4961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303572
103	NC_019728	CAA	2	6	4996	5001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303572
104	NC_019728	TAAT	2	8	5010	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	428303572
105	NC_019728	TGC	2	6	5032	5037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303572
106	NC_019728	TGA	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
107	NC_019728	AAG	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
108	NC_019728	AGA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
109	NC_019728	AAAG	2	8	5077	5084	75 %	0 %	25 %	0 %	428303572
110	NC_019728	AC	3	6	5127	5132	50 %	0 %	0 %	50 %	428303572
111	NC_019728	TGA	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
112	NC_019728	AGA	2	6	5215	5220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
113	NC_019728	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
114	NC_019728	GAAAA	2	10	5379	5388	80 %	0 %	20 %	0 %	428303572
115	NC_019728	TAA	2	6	5392	5397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303572
116	NC_019728	ATA	2	6	5411	5416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303572
117	NC_019728	A	8	8	5443	5450	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
118	NC_019728	AG	3	6	5481	5486	50 %	0 %	50 %	0 %	428303572
119	NC_019728	TAAAT	2	10	5524	5533	60 %	40 %	0 %	0 %	428303572
120	NC_019728	TC	3	6	5546	5551	0 %	50 %	0 %	50 %	428303572
121	NC_019728	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
122	NC_019728	A	6	6	5561	5566	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
123	NC_019728	TGA	2	6	5584	5589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
124	NC_019728	GAA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
125	NC_019728	GAA	2	6	5613	5618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
126	NC_019728	CAAT	2	8	5624	5631	50 %	25 %	0 %	25 %	428303572
127	NC_019728	AG	3	6	5652	5657	50 %	0 %	50 %	0 %	428303572
128	NC_019728	AAAC	2	8	5661	5668	75 %	0 %	0 %	25 %	428303572
129	NC_019728	ACAA	2	8	5706	5713	75 %	0 %	0 %	25 %	428303572
130	NC_019728	A	6	6	5735	5740	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
131	NC_019728	TCG	2	6	5741	5746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303572
132	NC_019728	TAA	2	6	5776	5781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019728	TTA	2	6	5784	5789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019728	CAT	2	6	5823	5828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303573
135	NC_019728	TGT	2	6	6017	6022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303573
136	NC_019728	T	6	6	6046	6051	0 %	100 %	0 %	0 %	428303573
137	NC_019728	AGA	2	6	6062	6067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303573
138	NC_019728	TGT	3	9	6074	6082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303573
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400	NC_019728	GTC	2	6	18435	18440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303580
401	NC_019728	GAC	2	6	18450	18455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303580
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404	NC_019728	ACT	2	6	18703	18708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303580
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499	NC_019728	TAAA	2	8	23438	23445	75 %	25 %	0 %	0 %	428303582
500	NC_019728	A	7	7	23468	23474	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582

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