MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 1646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019727	TCT	2	6	74037	74042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303525
1502	NC_019727	AGA	3	9	74126	74134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1503	NC_019727	TCAT	2	8	74143	74150	25 %	50 %	0 %	25 %	428303525
1504	NC_019727	CTG	2	6	74169	74174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303525
1505	NC_019727	TCAA	2	8	74221	74228	50 %	25 %	0 %	25 %	428303525
1506	NC_019727	AGC	2	6	74237	74242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303525
1507	NC_019727	AGCT	2	8	74275	74282	25 %	25 %	25 %	25 %	428303525
1508	NC_019727	A	6	6	74304	74309	100 %	0 %	0 %	0 %	428303525
1509	NC_019727	GCT	2	6	74322	74327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303525
1510	NC_019727	A	6	6	74375	74380	100 %	0 %	0 %	0 %	428303525
1511	NC_019727	AGA	2	6	74468	74473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1512	NC_019727	AC	3	6	74495	74500	50 %	0 %	0 %	50 %	428303525
1513	NC_019727	TAGA	2	8	74677	74684	50 %	25 %	25 %	0 %	428303525
1514	NC_019727	AAG	2	6	74692	74697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1515	NC_019727	TC	4	8	74720	74727	0 %	50 %	0 %	50 %	428303525
1516	NC_019727	ATT	2	6	74762	74767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303525
1517	NC_019727	CAA	2	6	74769	74774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303525
1518	NC_019727	AAT	2	6	74789	74794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303525
1519	NC_019727	TCC	2	6	74861	74866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303525
1520	NC_019727	TA	3	6	74883	74888	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
1521	NC_019727	GA	3	6	74936	74941	50 %	0 %	50 %	0 %	428303525
1522	NC_019727	TA	3	6	75044	75049	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
1523	NC_019727	GAA	2	6	75056	75061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1524	NC_019727	ATA	2	6	75073	75078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303525
1525	NC_019727	TTA	2	6	75169	75174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303525
1526	NC_019727	AGA	2	6	75197	75202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1527	NC_019727	GAA	2	6	75239	75244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1528	NC_019727	TA	3	6	75278	75283	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
1529	NC_019727	A	6	6	75286	75291	100 %	0 %	0 %	0 %	428303525
1530	NC_019727	TTAAT	2	10	75298	75307	40 %	60 %	0 %	0 %	428303525
1531	NC_019727	AAC	2	6	75321	75326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303525
1532	NC_019727	AAG	4	12	75352	75363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1533	NC_019727	GTTG	2	8	75400	75407	0 %	50 %	50 %	0 %	428303525
1534	NC_019727	AAT	2	6	75419	75424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303525
1535	NC_019727	T	6	6	75530	75535	0 %	100 %	0 %	0 %	428303525
1536	NC_019727	TAG	2	6	75604	75609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
1537	NC_019727	A	7	7	75610	75616	100 %	0 %	0 %	0 %	428303525
1538	NC_019727	TAG	2	6	75679	75684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
1539	NC_019727	AGA	2	6	75725	75730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1540	NC_019727	A	6	6	75759	75764	100 %	0 %	0 %	0 %	428303525
1541	NC_019727	GAA	2	6	75780	75785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1542	NC_019727	GCA	2	6	75804	75809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303525
1543	NC_019727	TC	4	8	75818	75825	0 %	50 %	0 %	50 %	428303525
1544	NC_019727	AGA	2	6	75833	75838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303525
1545	NC_019727	GAC	2	6	75844	75849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303525
1546	NC_019727	CAT	2	6	75867	75872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303525
1547	NC_019727	GTG	2	6	75991	75996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303525
1548	NC_019727	TAGC	2	8	76051	76058	25 %	25 %	25 %	25 %	428303525
1549	NC_019727	CTG	2	6	76077	76082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303525
1550	NC_019727	TGA	2	6	76090	76095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
1551	NC_019727	ATA	2	6	76150	76155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303525
1552	NC_019727	CAAT	2	8	76209	76216	50 %	25 %	0 %	25 %	428303525
1553	NC_019727	CGCA	2	8	76287	76294	25 %	0 %	25 %	50 %	428303525
1554	NC_019727	ATG	2	6	76312	76317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
1555	NC_019727	AT	3	6	76349	76354	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
1556	NC_019727	CTT	2	6	76377	76382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303525
1557	NC_019727	TCAA	2	8	76396	76403	50 %	25 %	0 %	25 %	428303525
1558	NC_019727	ACT	2	6	76443	76448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303525
1559	NC_019727	TCT	2	6	76491	76496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303525
1560	NC_019727	CTA	2	6	76622	76627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303525
1561	NC_019727	GAT	2	6	76683	76688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
1562	NC_019727	CAA	3	9	76746	76754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303525
1563	NC_019727	GAT	2	6	76794	76799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
1564	NC_019727	AGCT	2	8	76954	76961	25 %	25 %	25 %	25 %	428303525
1565	NC_019727	CA	3	6	77042	77047	50 %	0 %	0 %	50 %	428303525
1566	NC_019727	GGA	2	6	77157	77162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303525
1567	NC_019727	GATG	2	8	77171	77178	25 %	25 %	50 %	0 %	428303525
1568	NC_019727	TGT	2	6	77325	77330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303525
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1570	NC_019727	GAT	2	6	77466	77471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
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1572	NC_019727	TAG	2	6	77518	77523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
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1575	NC_019727	T	7	7	77690	77696	0 %	100 %	0 %	0 %	428303525
1576	NC_019727	AAC	2	6	77735	77740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303525
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1578	NC_019727	ATA	2	6	77982	77987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303525
1579	NC_019727	TCT	2	6	78041	78046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303525
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1581	NC_019727	TAG	2	6	78157	78162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303525
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1584	NC_019727	CGG	2	6	78367	78372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_019727	GCC	2	6	78376	78381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_019727	TCA	2	6	78477	78482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_019727	ACA	2	6	78526	78531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_019727	CAC	2	6	78536	78541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_019727	TAAG	2	8	78620	78627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019727	CGG	2	6	78629	78634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_019727	CT	3	6	78693	78698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_019727	TAAA	2	8	78707	78714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_019727	TTA	2	6	78762	78767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_019727	AT	4	8	78826	78833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_019727	A	7	7	78879	78885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_019727	ATC	2	6	78947	78952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_019727	TAG	2	6	78959	78964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_019727	TGA	2	6	78975	78980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_019727	AATT	2	8	78999	79006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_019727	CAG	2	6	79040	79045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_019727	TATT	2	8	79102	79109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_019727	T	6	6	79117	79122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_019727	GAT	2	6	79123	79128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_019727	ATT	3	9	79140	79148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_019727	ACG	2	6	79178	79183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_019727	GAT	2	6	79204	79209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_019727	TA	3	6	79211	79216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_019727	AAT	2	6	79228	79233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_019727	TTAT	2	8	79234	79241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_019727	TTCAT	2	10	79308	79317	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_019727	AGA	3	9	79356	79364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019727	AAAG	2	8	79372	79379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_019727	AGT	2	6	79456	79461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_019727	ATT	2	6	79476	79481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_019727	TAT	2	6	79568	79573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_019727	TA	3	6	79591	79596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_019727	AATT	2	8	79612	79619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_019727	AGA	2	6	79727	79732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_019727	GAA	2	6	79749	79754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_019727	AAG	2	6	79755	79760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019727	AGA	2	6	79799	79804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_019727	TGG	2	6	79817	79822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019727	TAG	2	6	79843	79848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_019727	TAA	2	6	79897	79902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_019727	AGA	2	6	79946	79951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019727	AGCA	2	8	79966	79973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_019727	AAG	2	6	80023	80028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019727	A	6	6	80051	80056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019727	TAA	2	6	80057	80062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_019727	GAA	2	6	80103	80108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019727	AAAG	2	8	80119	80126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_019727	GAC	2	6	80166	80171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_019727	AGA	2	6	80186	80191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_019727	ATT	2	6	80193	80198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_019727	T	6	6	80259	80264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_019727	T	7	7	80273	80279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_019727	AACT	2	8	80413	80420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1639	NC_019727	T	6	6	80468	80473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1640	NC_019727	ATTTT	2	10	80521	80530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1641	NC_019727	ATT	2	6	80560	80565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1642	NC_019727	CTTAA	2	10	80572	80581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1643	NC_019727	CTC	2	6	80636	80641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1644	NC_019727	ATT	2	6	80694	80699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1645	NC_019727	ATTC	2	8	80715	80722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1646	NC_019727	TCA	2	6	80737	80742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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