MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_019682	TGCT	2	8	1293112	1293119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25002	NC_019682	ATT	2	6	1293135	1293140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25003	NC_019682	TTA	2	6	1293154	1293159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25004	NC_019682	T	6	6	1293223	1293228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25005	NC_019682	AGC	2	6	1293304	1293309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25006	NC_019682	AAT	2	6	1293310	1293315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25007	NC_019682	ATCA	2	8	1293351	1293358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25008	NC_019682	TCT	2	6	1293370	1293375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25009	NC_019682	ACG	2	6	1293538	1293543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716533
25010	NC_019682	CCA	2	6	1293552	1293557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716533
25011	NC_019682	GCT	2	6	1293559	1293564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716533
25012	NC_019682	CGA	2	6	1293596	1293601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716533
25013	NC_019682	GTTG	2	8	1293614	1293621	0 %	50 %	50 %	0 %	427716533
25014	NC_019682	GAT	2	6	1293629	1293634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716533
25015	NC_019682	TCAC	2	8	1293638	1293645	25 %	25 %	0 %	50 %	427716533
25016	NC_019682	GGA	2	6	1293669	1293674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716533
25017	NC_019682	CT	3	6	1293676	1293681	0 %	50 %	0 %	50 %	427716533
25018	NC_019682	ATT	2	6	1293694	1293699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716533
25019	NC_019682	CCG	2	6	1293859	1293864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716533
25020	NC_019682	TCT	2	6	1293865	1293870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716533
25021	NC_019682	TCT	2	6	1293878	1293883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716533
25022	NC_019682	AGC	2	6	1293901	1293906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716533
25023	NC_019682	TTG	2	6	1293910	1293915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716533
25024	NC_019682	TTTC	2	8	1293917	1293924	0 %	75 %	0 %	25 %	427716533
25025	NC_019682	TGT	2	6	1293938	1293943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716533
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25028	NC_019682	CTC	2	6	1294167	1294172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716533
25029	NC_019682	AGC	2	6	1294180	1294185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716533
25030	NC_019682	ACC	2	6	1294231	1294236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716533
25031	NC_019682	CCAGAG	2	12	1294388	1294399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716533
25032	NC_019682	CTACCA	2	12	1294421	1294432	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	427716533
25033	NC_019682	TAC	2	6	1294452	1294457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716533
25034	NC_019682	ACC	2	6	1294498	1294503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716533
25035	NC_019682	CCT	2	6	1294508	1294513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716533
25036	NC_019682	CCACCT	2	12	1294517	1294528	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	427716533
25037	NC_019682	GCT	2	6	1294529	1294534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716533
25038	NC_019682	TCTG	2	8	1294611	1294618	0 %	50 %	25 %	25 %	427716533
25039	NC_019682	AGG	2	6	1294705	1294710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716533
25040	NC_019682	T	7	7	1294727	1294733	0 %	100 %	0 %	0 %	427716533
25041	NC_019682	CAA	2	6	1294803	1294808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716533
25042	NC_019682	AT	4	8	1294985	1294992	50 %	50 %	0 %	0 %	427716533
25043	NC_019682	TCC	2	6	1295121	1295126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25044	NC_019682	ATT	2	6	1295138	1295143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25045	NC_019682	AAAT	2	8	1295190	1295197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25046	NC_019682	GGGAAA	2	12	1295291	1295302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25047	NC_019682	AATTT	2	10	1295309	1295318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25048	NC_019682	TTAG	2	8	1295334	1295341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25049	NC_019682	AAG	2	6	1295350	1295355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25050	NC_019682	TGT	2	6	1295358	1295363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25051	NC_019682	GGC	2	6	1295412	1295417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716534
25052	NC_019682	GTG	2	6	1295418	1295423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716534
25053	NC_019682	ATT	2	6	1295466	1295471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716534
25054	NC_019682	AAC	2	6	1295499	1295504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716534
25055	NC_019682	CGCA	2	8	1295603	1295610	25 %	0 %	25 %	50 %	427716534
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25057	NC_019682	AGA	2	6	1295648	1295653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716534
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25060	NC_019682	CTA	2	6	1295982	1295987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716534
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25063	NC_019682	GA	3	6	1296010	1296015	50 %	0 %	50 %	0 %	427716534
25064	NC_019682	GCC	2	6	1296048	1296053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716535
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25070	NC_019682	TGA	2	6	1296330	1296335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716535
25071	NC_019682	TAAA	2	8	1296438	1296445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25072	NC_019682	GT	3	6	1296459	1296464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25073	NC_019682	TTA	2	6	1296510	1296515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25074	NC_019682	TGG	2	6	1296616	1296621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25075	NC_019682	CGT	2	6	1296700	1296705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716536
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25078	NC_019682	ATC	2	6	1296808	1296813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716536
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25091	NC_019682	T	7	7	1297313	1297319	0 %	100 %	0 %	0 %	427716536
25092	NC_019682	TCAA	2	8	1297345	1297352	50 %	25 %	0 %	25 %	427716536
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25110	NC_019682	CCTG	2	8	1298182	1298189	0 %	25 %	25 %	50 %	427716536
25111	NC_019682	GTT	2	6	1298363	1298368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716536
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25114	NC_019682	T	8	8	1298529	1298536	0 %	100 %	0 %	0 %	427716536
25115	NC_019682	TAC	2	6	1298620	1298625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25116	NC_019682	T	6	6	1298660	1298665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25117	NC_019682	GATG	2	8	1298762	1298769	25 %	25 %	50 %	0 %	427716537
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25119	NC_019682	ACCAA	2	10	1299083	1299092	60 %	0 %	0 %	40 %	427716538
25120	NC_019682	CAG	2	6	1299121	1299126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716538
25121	NC_019682	CTT	2	6	1299268	1299273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716538
25122	NC_019682	CCA	2	6	1299309	1299314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716538
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25220	NC_019682	TTCTTT	2	12	1305273	1305284	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25221	NC_019682	AGGG	2	8	1305374	1305381	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25222	NC_019682	A	6	6	1305384	1305389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25223	NC_019682	ATCA	2	8	1305400	1305407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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25229	NC_019682	GTA	2	6	1305863	1305868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716544
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25232	NC_019682	CTA	2	6	1306002	1306007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716544
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25235	NC_019682	AAT	2	6	1306126	1306131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716544
25236	NC_019682	ATT	2	6	1306186	1306191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716544
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25340	NC_019682	GTT	2	6	1311096	1311101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716545
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25342	NC_019682	CCTC	2	8	1311226	1311233	0 %	25 %	0 %	75 %	427716545
25343	NC_019682	CAC	2	6	1311330	1311335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716545
25344	NC_019682	ATCGC	2	10	1311370	1311379	20 %	20 %	20 %	40 %	427716545
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25349	NC_019682	TTC	2	6	1311496	1311501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716545
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25352	NC_019682	A	6	6	1311655	1311660	100 %	0 %	0 %	0 %	427716545
25353	NC_019682	ATC	2	6	1311742	1311747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716545
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25355	NC_019682	ATG	2	6	1311763	1311768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716545
25356	NC_019682	TCC	2	6	1311778	1311783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716545
25357	NC_019682	CTA	2	6	1311834	1311839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716545
25358	NC_019682	CAC	2	6	1311879	1311884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716545
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25361	NC_019682	TGT	2	6	1312037	1312042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716545
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25363	NC_019682	TCCT	2	8	1312117	1312124	0 %	50 %	0 %	50 %	427716545
25364	NC_019682	ATT	2	6	1312147	1312152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716545
25365	NC_019682	TAC	2	6	1312153	1312158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716545
25366	NC_019682	TAA	2	6	1312159	1312164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716545
25367	NC_019682	TCT	2	6	1312178	1312183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716545
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25371	NC_019682	TGAT	2	8	1312262	1312269	25 %	50 %	25 %	0 %	427716545
25372	NC_019682	ATC	2	6	1312270	1312275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716545
25373	NC_019682	TAC	2	6	1312279	1312284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716545
25374	NC_019682	AT	3	6	1312414	1312419	50 %	50 %	0 %	0 %	427716545
25375	NC_019682	CTGA	2	8	1312504	1312511	25 %	25 %	25 %	25 %	427716545
25376	NC_019682	GTC	2	6	1312527	1312532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716545
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25382	NC_019682	TTGA	2	8	1312921	1312928	25 %	50 %	25 %	0 %	427716546
25383	NC_019682	CAT	2	6	1313021	1313026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716546
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25389	NC_019682	TAC	2	6	1313415	1313420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716547
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25392	NC_019682	A	6	6	1313513	1313518	100 %	0 %	0 %	0 %	427716547
25393	NC_019682	ATT	2	6	1313544	1313549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716547
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25403	NC_019682	CAACC	2	10	1313946	1313955	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25404	NC_019682	AACTG	2	10	1313969	1313978	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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25435	NC_019682	TATC	2	8	1315421	1315428	25 %	50 %	0 %	25 %	427716549
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25443	NC_019682	TTAA	2	8	1315752	1315759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25444	NC_019682	TTGA	2	8	1315790	1315797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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25450	NC_019682	AT	3	6	1316066	1316071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25471	NC_019682	T	6	6	1317393	1317398	0 %	100 %	0 %	0 %	427716551
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25474	NC_019682	GGA	2	6	1317445	1317450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716551
25475	NC_019682	TTC	2	6	1317502	1317507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716551
25476	NC_019682	GGA	2	6	1317521	1317526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716551
25477	NC_019682	TTC	2	6	1317595	1317600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716551
25478	NC_019682	TCT	2	6	1317674	1317679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716551
25479	NC_019682	TG	3	6	1317721	1317726	0 %	50 %	50 %	0 %	427716551
25480	NC_019682	T	7	7	1317796	1317802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25481	NC_019682	GAT	2	6	1318067	1318072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716552
25482	NC_019682	TGC	2	6	1318149	1318154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716552
25483	NC_019682	A	7	7	1318221	1318227	100 %	0 %	0 %	0 %	427716552
25484	NC_019682	GGA	2	6	1318262	1318267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716552
25485	NC_019682	CAGACC	2	12	1318329	1318340	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427716552
25486	NC_019682	TAC	3	9	1318471	1318479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716552
25487	NC_019682	CAG	2	6	1318488	1318493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716552
25488	NC_019682	TTGGT	2	10	1318673	1318682	0 %	60 %	40 %	0 %	427716552
25489	NC_019682	GTG	2	6	1318710	1318715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716552
25490	NC_019682	GCC	2	6	1318757	1318762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716552
25491	NC_019682	CAG	2	6	1318804	1318809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716552
25492	NC_019682	TTAA	2	8	1318811	1318818	50 %	50 %	0 %	0 %	427716552
25493	NC_019682	TTG	2	6	1318892	1318897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716552
25494	NC_019682	GTT	2	6	1318951	1318956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716552
25495	NC_019682	CTA	2	6	1319016	1319021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716552
25496	NC_019682	TGG	2	6	1319040	1319045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716552
25497	NC_019682	ATT	2	6	1319054	1319059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716552
25498	NC_019682	AGTG	2	8	1319101	1319108	25 %	25 %	50 %	0 %	427716552
25499	NC_019682	TGT	2	6	1319221	1319226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716552
25500	NC_019682	ACT	2	6	1319228	1319233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716552

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