MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_019682	TGA	3	9	1243784	1243792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24002	NC_019682	TCGG	2	8	1243843	1243850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24003	NC_019682	TTC	2	6	1243990	1243995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24004	NC_019682	T	6	6	1244000	1244005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24005	NC_019682	ATT	2	6	1244065	1244070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24006	NC_019682	ATTA	2	8	1244138	1244145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24007	NC_019682	T	6	6	1244169	1244174	0 %	100 %	0 %	0 %	427716487
24008	NC_019682	GAG	2	6	1244197	1244202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716487
24009	NC_019682	ACG	2	6	1244383	1244388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716487
24010	NC_019682	CACC	2	8	1244403	1244410	25 %	0 %	0 %	75 %	427716487
24011	NC_019682	CTG	3	9	1244452	1244460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716487
24012	NC_019682	GCA	2	6	1244469	1244474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716487
24013	NC_019682	ACA	2	6	1244484	1244489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716487
24014	NC_019682	CAT	2	6	1244527	1244532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716487
24015	NC_019682	CAT	2	6	1244601	1244606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716487
24016	NC_019682	AAC	2	6	1244608	1244613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716487
24017	NC_019682	AACC	2	8	1244648	1244655	50 %	0 %	0 %	50 %	427716487
24018	NC_019682	T	6	6	1244665	1244670	0 %	100 %	0 %	0 %	427716487
24019	NC_019682	TCAC	2	8	1244702	1244709	25 %	25 %	0 %	50 %	427716487
24020	NC_019682	TAA	2	6	1244725	1244730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716487
24021	NC_019682	TCA	2	6	1244732	1244737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716487
24022	NC_019682	TGGT	2	8	1244746	1244753	0 %	50 %	50 %	0 %	427716487
24023	NC_019682	GATT	2	8	1244787	1244794	25 %	50 %	25 %	0 %	427716487
24024	NC_019682	CTT	2	6	1244856	1244861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716487
24025	NC_019682	CAC	2	6	1244872	1244877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716487
24026	NC_019682	AG	3	6	1244888	1244893	50 %	0 %	50 %	0 %	427716487
24027	NC_019682	ATC	2	6	1244908	1244913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716487
24028	NC_019682	AAT	2	6	1244974	1244979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716487
24029	NC_019682	TCT	2	6	1244993	1244998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716487
24030	NC_019682	C	6	6	1245030	1245035	0 %	0 %	0 %	100 %	427716487
24031	NC_019682	A	6	6	1245079	1245084	100 %	0 %	0 %	0 %	427716487
24032	NC_019682	TAA	2	6	1245100	1245105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716487
24033	NC_019682	GCT	2	6	1245113	1245118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716487
24034	NC_019682	AGA	2	6	1245121	1245126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716487
24035	NC_019682	TTTC	2	8	1245147	1245154	0 %	75 %	0 %	25 %	427716487
24036	NC_019682	A	7	7	1245191	1245197	100 %	0 %	0 %	0 %	427716487
24037	NC_019682	AAT	2	6	1245244	1245249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716487
24038	NC_019682	A	7	7	1245265	1245271	100 %	0 %	0 %	0 %	427716487
24039	NC_019682	TCT	2	6	1245308	1245313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716487
24040	NC_019682	GAA	2	6	1245316	1245321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716487
24041	NC_019682	TAA	2	6	1245382	1245387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716487
24042	NC_019682	CAAT	2	8	1245432	1245439	50 %	25 %	0 %	25 %	427716487
24043	NC_019682	CTC	2	6	1245447	1245452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716487
24044	NC_019682	TTC	2	6	1245538	1245543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716487
24045	NC_019682	CAGT	2	8	1245597	1245604	25 %	25 %	25 %	25 %	427716487
24046	NC_019682	TAA	2	6	1245628	1245633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716487
24047	NC_019682	TGCCAG	2	12	1245640	1245651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427716487
24048	NC_019682	AT	3	6	1245678	1245683	50 %	50 %	0 %	0 %	427716487
24049	NC_019682	A	6	6	1245710	1245715	100 %	0 %	0 %	0 %	427716487
24050	NC_019682	TC	3	6	1245733	1245738	0 %	50 %	0 %	50 %	427716487
24051	NC_019682	TAC	2	6	1245772	1245777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716487
24052	NC_019682	A	7	7	1245793	1245799	100 %	0 %	0 %	0 %	427716487
24053	NC_019682	TTA	2	6	1245859	1245864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24054	NC_019682	AGT	2	6	1245935	1245940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716488
24055	NC_019682	TCC	2	6	1245972	1245977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716488
24056	NC_019682	AT	3	6	1245992	1245997	50 %	50 %	0 %	0 %	427716488
24057	NC_019682	CAT	2	6	1246058	1246063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716488
24058	NC_019682	T	8	8	1246091	1246098	0 %	100 %	0 %	0 %	427716488
24059	NC_019682	GTT	2	6	1246127	1246132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716488
24060	NC_019682	GCT	2	6	1246149	1246154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716488
24061	NC_019682	C	6	6	1246229	1246234	0 %	0 %	0 %	100 %	427716488
24062	NC_019682	CCA	2	6	1246237	1246242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716488
24063	NC_019682	GAA	2	6	1246243	1246248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716488
24064	NC_019682	T	6	6	1246275	1246280	0 %	100 %	0 %	0 %	427716488
24065	NC_019682	AAT	2	6	1246361	1246366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716488
24066	NC_019682	CGA	2	6	1246393	1246398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716488
24067	NC_019682	TGG	2	6	1246428	1246433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716488
24068	NC_019682	ATC	2	6	1246503	1246508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716488
24069	NC_019682	AGG	2	6	1246569	1246574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716488
24070	NC_019682	CTC	2	6	1246736	1246741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716488
24071	NC_019682	ATA	2	6	1246744	1246749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716488
24072	NC_019682	ATTT	2	8	1246773	1246780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24073	NC_019682	AT	3	6	1246786	1246791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24074	NC_019682	GCA	2	6	1246835	1246840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24075	NC_019682	ATT	2	6	1246911	1246916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716489
24076	NC_019682	GAT	2	6	1246941	1246946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716489
24077	NC_019682	GCA	2	6	1246987	1246992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716489
24078	NC_019682	TTC	2	6	1247073	1247078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716489
24079	NC_019682	GCG	2	6	1247239	1247244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716489
24080	NC_019682	ACT	2	6	1247298	1247303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716489
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24082	NC_019682	GAC	2	6	1247397	1247402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716489
24083	NC_019682	TAG	2	6	1247432	1247437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716489
24084	NC_019682	ATA	2	6	1247443	1247448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716489
24085	NC_019682	ATA	2	6	1247501	1247506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716489
24086	NC_019682	CCT	2	6	1247513	1247518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716489
24087	NC_019682	ATA	2	6	1247564	1247569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716489
24088	NC_019682	AGG	2	6	1247580	1247585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716489
24089	NC_019682	AGC	2	6	1247624	1247629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716489
24090	NC_019682	GTTT	2	8	1247630	1247637	0 %	75 %	25 %	0 %	427716489
24091	NC_019682	AAT	2	6	1247700	1247705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24092	NC_019682	A	7	7	1247759	1247765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24093	NC_019682	AGT	2	6	1247803	1247808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24094	NC_019682	GTT	2	6	1247827	1247832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24095	NC_019682	CCTA	2	8	1247871	1247878	25 %	25 %	0 %	50 %	427716490
24096	NC_019682	GA	4	8	1247922	1247929	50 %	0 %	50 %	0 %	427716490
24097	NC_019682	GAT	2	6	1247965	1247970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716490
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24099	NC_019682	ACT	2	6	1248103	1248108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716490
24100	NC_019682	GAT	2	6	1248109	1248114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716490
24101	NC_019682	A	6	6	1248115	1248120	100 %	0 %	0 %	0 %	427716490
24102	NC_019682	CTA	2	6	1248121	1248126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716490
24103	NC_019682	TGA	2	6	1248158	1248163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716490
24104	NC_019682	CCT	2	6	1248188	1248193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716490
24105	NC_019682	GCT	3	9	1248205	1248213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716490
24106	NC_019682	CCAG	2	8	1248258	1248265	25 %	0 %	25 %	50 %	427716490
24107	NC_019682	GAT	2	6	1248295	1248300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716490
24108	NC_019682	CAAT	2	8	1248329	1248336	50 %	25 %	0 %	25 %	427716490
24109	NC_019682	GCC	2	6	1248356	1248361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716490
24110	NC_019682	TAA	2	6	1248396	1248401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716490
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24114	NC_019682	ATA	2	6	1248608	1248613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716490
24115	NC_019682	GAT	2	6	1248655	1248660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716490
24116	NC_019682	CGC	2	6	1248690	1248695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716490
24117	NC_019682	TGG	2	6	1248778	1248783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716490
24118	NC_019682	TTG	2	6	1248851	1248856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716490
24119	NC_019682	ATC	2	6	1248869	1248874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716490
24120	NC_019682	TAT	2	6	1248886	1248891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716490
24121	NC_019682	GAA	2	6	1248898	1248903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716490
24122	NC_019682	CGC	2	6	1248979	1248984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716490
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24124	NC_019682	TGG	2	6	1249028	1249033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716490
24125	NC_019682	TATTC	2	10	1249055	1249064	20 %	60 %	0 %	20 %	427716490
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24131	NC_019682	GGTTTT	2	12	1249363	1249374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716490
24132	NC_019682	T	6	6	1249435	1249440	0 %	100 %	0 %	0 %	427716490
24133	NC_019682	CTG	2	6	1249454	1249459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716490
24134	NC_019682	ACA	2	6	1249493	1249498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716490
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24139	NC_019682	AAC	2	6	1249630	1249635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24140	NC_019682	ATT	2	6	1249727	1249732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24141	NC_019682	ATT	2	6	1249734	1249739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24142	NC_019682	GTT	2	6	1249835	1249840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24143	NC_019682	AAT	2	6	1249843	1249848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24144	NC_019682	ATG	2	6	1249921	1249926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24146	NC_019682	ATAA	2	8	1249943	1249950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24147	NC_019682	CAAT	2	8	1249970	1249977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24148	NC_019682	TAA	2	6	1250036	1250041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716491
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24151	NC_019682	TACCT	2	10	1250070	1250079	20 %	40 %	0 %	40 %	427716491
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24173	NC_019682	GGTT	2	8	1250783	1250790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24174	NC_019682	GTT	2	6	1250861	1250866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24176	NC_019682	A	7	7	1251013	1251019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24186	NC_019682	GTT	2	6	1251371	1251376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24189	NC_019682	GA	3	6	1251422	1251427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24190	NC_019682	T	6	6	1251447	1251452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24191	NC_019682	TAG	2	6	1251545	1251550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24193	NC_019682	TTA	2	6	1251591	1251596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24195	NC_019682	GTA	2	6	1251632	1251637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24222	NC_019682	TAT	2	6	1253551	1253556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716494
24223	NC_019682	GGGT	2	8	1253740	1253747	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24224	NC_019682	AAT	2	6	1253800	1253805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24225	NC_019682	CCA	2	6	1253830	1253835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24226	NC_019682	TC	3	6	1253928	1253933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24227	NC_019682	TGA	2	6	1254031	1254036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716495
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24230	NC_019682	ACAT	2	8	1254143	1254150	50 %	25 %	0 %	25 %	427716495
24231	NC_019682	CGC	2	6	1254184	1254189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716495
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24233	NC_019682	CAG	2	6	1254297	1254302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716495
24234	NC_019682	AGC	2	6	1254322	1254327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716495
24235	NC_019682	CGAC	2	8	1254340	1254347	25 %	0 %	25 %	50 %	427716495
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24354	NC_019682	A	6	6	1259686	1259691	100 %	0 %	0 %	0 %	427716502
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24474	NC_019682	A	6	6	1266858	1266863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24475	NC_019682	TCA	2	6	1266896	1266901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24476	NC_019682	TCA	2	6	1266903	1266908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24477	NC_019682	TAA	2	6	1266964	1266969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24478	NC_019682	TTA	2	6	1266986	1266991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716509
24479	NC_019682	TGG	2	6	1267007	1267012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716509
24480	NC_019682	G	6	6	1267026	1267031	0 %	0 %	100 %	0 %	427716509
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