MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_019682	TAT	2	6	620474	620479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_019682	CTT	2	6	620480	620485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_019682	AAT	2	6	620496	620501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_019682	ACT	2	6	620551	620556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715914
12005	NC_019682	TCA	2	6	620663	620668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715914
12006	NC_019682	T	6	6	620697	620702	0 %	100 %	0 %	0 %	427715914
12007	NC_019682	AGC	2	6	620748	620753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715914
12008	NC_019682	AGT	2	6	620787	620792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715914
12009	NC_019682	TCT	2	6	620867	620872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715914
12010	NC_019682	GAA	2	6	620886	620891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715914
12011	NC_019682	CGA	2	6	621059	621064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715914
12012	NC_019682	AGC	3	9	621070	621078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715914
12013	NC_019682	GAA	2	6	621091	621096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715914
12014	NC_019682	TGCC	2	8	621381	621388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12015	NC_019682	TAC	2	6	621416	621421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715915
12016	NC_019682	ACTA	2	8	621432	621439	50 %	25 %	0 %	25 %	427715915
12017	NC_019682	CCA	2	6	621484	621489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715915
12018	NC_019682	TGC	2	6	621727	621732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715915
12019	NC_019682	ATC	2	6	621912	621917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715915
12020	NC_019682	TGC	3	9	622017	622025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715915
12021	NC_019682	TGA	2	6	622070	622075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715915
12022	NC_019682	CTTTT	2	10	622101	622110	0 %	80 %	0 %	20 %	427715915
12023	NC_019682	TTGGGT	2	12	622122	622133	0 %	50 %	50 %	0 %	427715915
12024	NC_019682	AGT	2	6	622135	622140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715915
12025	NC_019682	TTG	2	6	622146	622151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715915
12026	NC_019682	CAT	2	6	622196	622201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715915
12027	NC_019682	CAG	2	6	622242	622247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715915
12028	NC_019682	CAC	2	6	622296	622301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715915
12029	NC_019682	ACC	2	6	622443	622448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715915
12030	NC_019682	TTGG	2	8	622463	622470	0 %	50 %	50 %	0 %	427715915
12031	NC_019682	GCA	2	6	622480	622485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715915
12032	NC_019682	TGA	2	6	622493	622498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715915
12033	NC_019682	TTAC	2	8	622516	622523	25 %	50 %	0 %	25 %	427715915
12034	NC_019682	TGA	3	9	622549	622557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715915
12035	NC_019682	AAC	2	6	622654	622659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715915
12036	NC_019682	CGT	2	6	622728	622733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715915
12037	NC_019682	AAT	2	6	622850	622855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715915
12038	NC_019682	CTT	2	6	622889	622894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715915
12039	NC_019682	TGC	2	6	622948	622953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715915
12040	NC_019682	GCAA	2	8	622988	622995	50 %	0 %	25 %	25 %	427715915
12041	NC_019682	CCG	2	6	623126	623131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715915
12042	NC_019682	ATC	2	6	623136	623141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715915
12043	NC_019682	AGT	2	6	623149	623154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715915
12044	NC_019682	ATTT	2	8	623222	623229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_019682	AAT	2	6	623243	623248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_019682	AAAT	2	8	623252	623259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_019682	TG	3	6	623324	623329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_019682	GA	4	8	623376	623383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_019682	AAT	2	6	623460	623465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715916
12050	NC_019682	AAT	2	6	623479	623484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715916
12051	NC_019682	CATC	2	8	623502	623509	25 %	25 %	0 %	50 %	427715916
12052	NC_019682	AGA	2	6	623569	623574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715916
12053	NC_019682	T	8	8	623598	623605	0 %	100 %	0 %	0 %	427715916
12054	NC_019682	CTTG	2	8	623616	623623	0 %	50 %	25 %	25 %	427715916
12055	NC_019682	GTG	2	6	623691	623696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715916
12056	NC_019682	TGT	2	6	623709	623714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715916
12057	NC_019682	CCT	2	6	623721	623726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715916
12058	NC_019682	AT	3	6	623767	623772	50 %	50 %	0 %	0 %	427715916
12059	NC_019682	GCA	2	6	623808	623813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715916
12060	NC_019682	AGC	2	6	623846	623851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715916
12061	NC_019682	TTG	2	6	623865	623870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715916
12062	NC_019682	ATC	2	6	623898	623903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_019682	TAAAA	2	10	623939	623948	80 %	20 %	0 %	0 %	427715917
12064	NC_019682	TCT	2	6	624008	624013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715917
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12066	NC_019682	G	7	7	624154	624160	0 %	0 %	100 %	0 %	427715917
12067	NC_019682	AGT	2	6	624210	624215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715917
12068	NC_019682	GTA	2	6	624238	624243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715917
12069	NC_019682	ACT	2	6	624261	624266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715917
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12072	NC_019682	TCA	2	6	624607	624612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715917
12073	NC_019682	TCT	2	6	624631	624636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715917
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12075	NC_019682	GCG	2	6	624694	624699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715917
12076	NC_019682	GGC	2	6	624708	624713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715917
12077	NC_019682	TAA	2	6	624991	624996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715917
12078	NC_019682	CCA	2	6	625166	625171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715917
12079	NC_019682	TCA	2	6	625180	625185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715917
12080	NC_019682	CCG	2	6	625196	625201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715917
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12082	NC_019682	TGA	3	9	625429	625437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715917
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12084	NC_019682	CAG	2	6	625485	625490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715917
12085	NC_019682	GCT	2	6	625492	625497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715917
12086	NC_019682	TGA	2	6	625510	625515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715917
12087	NC_019682	CA	3	6	625521	625526	50 %	0 %	0 %	50 %	427715917
12088	NC_019682	AAC	2	6	625628	625633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715917
12089	NC_019682	GAT	2	6	625696	625701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715917
12090	NC_019682	CTG	2	6	625706	625711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715917
12091	NC_019682	TTG	2	6	625743	625748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715917
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12093	NC_019682	GCT	2	6	625804	625809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715917
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12095	NC_019682	ACTC	2	8	625890	625897	25 %	25 %	0 %	50 %	427715917
12096	NC_019682	TATT	2	8	625988	625995	25 %	75 %	0 %	0 %	427715917
12097	NC_019682	TGC	2	6	626038	626043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715917
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12099	NC_019682	GCT	2	6	626087	626092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715917
12100	NC_019682	TAT	2	6	626111	626116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715917
12101	NC_019682	GTG	2	6	626208	626213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715917
12102	NC_019682	TAAAA	2	10	626322	626331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_019682	TAAAT	2	10	626388	626397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_019682	ATT	2	6	626428	626433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715918
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12108	NC_019682	AG	3	6	626552	626557	50 %	0 %	50 %	0 %	427715918
12109	NC_019682	TTG	2	6	626564	626569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715918
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12115	NC_019682	TTAAC	2	10	626809	626818	40 %	40 %	0 %	20 %	427715918
12116	NC_019682	AAAT	2	8	626839	626846	75 %	25 %	0 %	0 %	427715918
12117	NC_019682	TCT	2	6	626906	626911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715919
12118	NC_019682	GTT	2	6	626967	626972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715919
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12236	NC_019682	AACG	2	8	633019	633026	50 %	0 %	25 %	25 %	427715925
12237	NC_019682	ATA	2	6	633094	633099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715925
12238	NC_019682	AATA	2	8	633157	633164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12485	NC_019682	TGG	2	6	644300	644305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715936
12486	NC_019682	ATTTG	2	10	644395	644404	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12487	NC_019682	CAG	2	6	644453	644458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12488	NC_019682	AGC	2	6	644470	644475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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