MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_019682	GAT	2	6	6304649	6304654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720720
123002	NC_019682	TTG	2	6	6304690	6304695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720720
123003	NC_019682	G	6	6	6304695	6304700	0 %	0 %	100 %	0 %	427720720
123004	NC_019682	GAA	2	6	6304820	6304825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720720
123005	NC_019682	TTGG	2	8	6304898	6304905	0 %	50 %	50 %	0 %	427720720
123006	NC_019682	CGT	2	6	6304990	6304995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720720
123007	NC_019682	GAT	2	6	6305012	6305017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720720
123008	NC_019682	TGA	2	6	6305095	6305100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720720
123009	NC_019682	GGA	2	6	6305108	6305113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427720720
123010	NC_019682	GTCTTG	2	12	6305414	6305425	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427720720
123011	NC_019682	TAG	2	6	6305426	6305431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720720
123012	NC_019682	ATTG	2	8	6305479	6305486	25 %	50 %	25 %	0 %	427720720
123013	NC_019682	CGC	2	6	6305524	6305529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427720720
123014	NC_019682	GA	3	6	6305535	6305540	50 %	0 %	50 %	0 %	427720720
123015	NC_019682	GGC	2	6	6305585	6305590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427720720
123016	NC_019682	TAT	2	6	6305611	6305616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720720
123017	NC_019682	AGT	2	6	6305628	6305633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720720
123018	NC_019682	TGG	2	6	6305636	6305641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720720
123019	NC_019682	AT	3	6	6305679	6305684	50 %	50 %	0 %	0 %	427720720
123020	NC_019682	T	6	6	6305704	6305709	0 %	100 %	0 %	0 %	427720720
123021	NC_019682	GGT	2	6	6305765	6305770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720720
123022	NC_019682	ATT	2	6	6305825	6305830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720720
123023	NC_019682	T	6	6	6305869	6305874	0 %	100 %	0 %	0 %	427720720
123024	NC_019682	ATT	2	6	6305877	6305882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720720
123025	NC_019682	T	7	7	6305938	6305944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123026	NC_019682	AGA	2	6	6305972	6305977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123027	NC_019682	TTA	2	6	6306011	6306016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123028	NC_019682	TC	3	6	6306038	6306043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123029	NC_019682	GGA	2	6	6306072	6306077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123030	NC_019682	ATT	2	6	6306121	6306126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720721
123031	NC_019682	ACA	2	6	6306150	6306155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720721
123032	NC_019682	CGG	2	6	6306217	6306222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427720721
123033	NC_019682	TGG	2	6	6306229	6306234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720721
123034	NC_019682	T	6	6	6306236	6306241	0 %	100 %	0 %	0 %	427720721
123035	NC_019682	CTT	2	6	6306331	6306336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720721
123036	NC_019682	TGGG	2	8	6306365	6306372	0 %	25 %	75 %	0 %	427720721
123037	NC_019682	ATGG	2	8	6306404	6306411	25 %	25 %	50 %	0 %	427720721
123038	NC_019682	TTG	3	9	6306422	6306430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720721
123039	NC_019682	T	6	6	6306466	6306471	0 %	100 %	0 %	0 %	427720721
123040	NC_019682	AAT	2	6	6306522	6306527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720721
123041	NC_019682	GGT	2	6	6306563	6306568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720721
123042	NC_019682	GAT	2	6	6306569	6306574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720721
123043	NC_019682	G	6	6	6306673	6306678	0 %	0 %	100 %	0 %	427720721
123044	NC_019682	GATT	2	8	6306707	6306714	25 %	50 %	25 %	0 %	427720721
123045	NC_019682	GAT	2	6	6306779	6306784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720721
123046	NC_019682	TTC	2	6	6306839	6306844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720721
123047	NC_019682	ATC	2	6	6306855	6306860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720721
123048	NC_019682	GTTG	2	8	6306872	6306879	0 %	50 %	50 %	0 %	427720721
123049	NC_019682	TAG	2	6	6306914	6306919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720721
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123051	NC_019682	TGG	3	9	6306989	6306997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720721
123052	NC_019682	TG	3	6	6307068	6307073	0 %	50 %	50 %	0 %	427720721
123053	NC_019682	GAT	2	6	6307088	6307093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720721
123054	NC_019682	T	6	6	6307118	6307123	0 %	100 %	0 %	0 %	427720721
123055	NC_019682	TGA	2	6	6307201	6307206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720721
123056	NC_019682	TTG	2	6	6307218	6307223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720721
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123059	NC_019682	GTT	2	6	6307309	6307314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720721
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123067	NC_019682	TC	3	6	6307627	6307632	0 %	50 %	0 %	50 %	427720721
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123070	NC_019682	TCT	2	6	6307677	6307682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720721
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123091	NC_019682	CAT	2	6	6308897	6308902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720722
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123098	NC_019682	T	10	10	6309040	6309049	0 %	100 %	0 %	0 %	427720722
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123101	NC_019682	TCCATT	2	12	6309214	6309225	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	427720722
123102	NC_019682	AGT	2	6	6309300	6309305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720722
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123113	NC_019682	T	6	6	6309677	6309682	0 %	100 %	0 %	0 %	427720722
123114	NC_019682	GCTG	2	8	6309745	6309752	0 %	25 %	50 %	25 %	427720722
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123116	NC_019682	TGG	2	6	6309873	6309878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720722
123117	NC_019682	TTG	2	6	6310029	6310034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720722
123118	NC_019682	TTG	2	6	6310113	6310118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720722
123119	NC_019682	CAT	2	6	6310131	6310136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720722
123120	NC_019682	CTG	2	6	6310209	6310214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720722
123121	NC_019682	CTG	2	6	6310341	6310346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720722
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123128	NC_019682	T	6	6	6310607	6310612	0 %	100 %	0 %	0 %	427720722
123129	NC_019682	CTTT	2	8	6310652	6310659	0 %	75 %	0 %	25 %	427720722
123130	NC_019682	TCT	2	6	6310666	6310671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720722
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123132	NC_019682	ACTGC	2	10	6310739	6310748	20 %	20 %	20 %	40 %	427720722
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123136	NC_019682	CTT	2	6	6310973	6310978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720722
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123138	NC_019682	CTG	2	6	6311120	6311125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720722
123139	NC_019682	TG	3	6	6311194	6311199	0 %	50 %	50 %	0 %	427720722
123140	NC_019682	TCT	2	6	6311266	6311271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720722
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123146	NC_019682	TTG	2	6	6311445	6311450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720722
123147	NC_019682	CAA	2	6	6311604	6311609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720722
123148	NC_019682	TCG	2	6	6311631	6311636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720722
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123150	NC_019682	ATA	2	6	6311745	6311750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720722
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123152	NC_019682	CTT	2	6	6311831	6311836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720722
123153	NC_019682	CAA	2	6	6311849	6311854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720722
123154	NC_019682	GTCT	2	8	6311921	6311928	0 %	50 %	25 %	25 %	427720722
123155	NC_019682	CTT	2	6	6311930	6311935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720722
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123165	NC_019682	CAT	3	9	6312461	6312469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720722
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123167	NC_019682	TGA	2	6	6312557	6312562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720722
123168	NC_019682	TTGTCG	2	12	6312574	6312585	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427720722
123169	NC_019682	TCT	2	6	6312595	6312600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720722
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123184	NC_019682	GTT	2	6	6313276	6313281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720722
123185	NC_019682	GTA	2	6	6313296	6313301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720722
123186	NC_019682	TCT	2	6	6313303	6313308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720722
123187	NC_019682	CAAT	2	8	6313342	6313349	50 %	25 %	0 %	25 %	427720722
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123190	NC_019682	TTG	2	6	6313434	6313439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720722
123191	NC_019682	T	8	8	6313488	6313495	0 %	100 %	0 %	0 %	427720722
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123195	NC_019682	TA	3	6	6313794	6313799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123196	NC_019682	A	6	6	6313807	6313812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123199	NC_019682	TTGA	2	8	6313903	6313910	25 %	50 %	25 %	0 %	427720723
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123208	NC_019682	TA	3	6	6314474	6314479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123209	NC_019682	TTTA	2	8	6314490	6314497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123210	NC_019682	T	6	6	6314521	6314526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123211	NC_019682	AT	3	6	6314554	6314559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123212	NC_019682	TAT	2	6	6314563	6314568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123213	NC_019682	TTA	2	6	6314569	6314574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123214	NC_019682	AAC	2	6	6314591	6314596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123215	NC_019682	GTT	2	6	6314611	6314616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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123217	NC_019682	TAA	2	6	6314764	6314769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123218	NC_019682	TAA	2	6	6314773	6314778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123219	NC_019682	CAT	2	6	6314852	6314857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123220	NC_019682	TGA	2	6	6314875	6314880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123221	NC_019682	TTAT	2	8	6314916	6314923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123222	NC_019682	ACA	2	6	6314960	6314965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123223	NC_019682	CTT	2	6	6315029	6315034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123224	NC_019682	GCT	2	6	6315055	6315060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720724
123225	NC_019682	TTG	2	6	6315071	6315076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720724
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123227	NC_019682	ATT	2	6	6315197	6315202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720724
123228	NC_019682	GGAT	2	8	6315280	6315287	25 %	25 %	50 %	0 %	427720724
123229	NC_019682	A	6	6	6315295	6315300	100 %	0 %	0 %	0 %	427720724
123230	NC_019682	CTG	2	6	6315353	6315358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720724
123231	NC_019682	GCA	2	6	6315388	6315393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720724
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123233	NC_019682	AAT	2	6	6315421	6315426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720724
123234	NC_019682	TAA	2	6	6315479	6315484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720724
123235	NC_019682	CAG	2	6	6315502	6315507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720724
123236	NC_019682	TTC	2	6	6315545	6315550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720724
123237	NC_019682	T	7	7	6315604	6315610	0 %	100 %	0 %	0 %	427720724
123238	NC_019682	AACT	2	8	6315614	6315621	50 %	25 %	0 %	25 %	427720724
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123240	NC_019682	TG	3	6	6315649	6315654	0 %	50 %	50 %	0 %	427720724
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123246	NC_019682	TCA	2	6	6316104	6316109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720724
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123250	NC_019682	TCA	2	6	6316284	6316289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720724
123251	NC_019682	CGG	2	6	6316311	6316316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427720724
123252	NC_019682	TTC	2	6	6316366	6316371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123253	NC_019682	CAA	2	6	6316392	6316397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123254	NC_019682	ATTT	2	8	6316417	6316424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123255	NC_019682	A	7	7	6316442	6316448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123256	NC_019682	GTA	2	6	6316462	6316467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123257	NC_019682	GTCA	2	8	6316512	6316519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123258	NC_019682	TGA	2	6	6316552	6316557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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123262	NC_019682	TAT	2	6	6316717	6316722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720725
123263	NC_019682	GTTA	2	8	6316724	6316731	25 %	50 %	25 %	0 %	427720725
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123266	NC_019682	T	6	6	6316854	6316859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123267	NC_019682	ATTT	2	8	6316921	6316928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123268	NC_019682	GCT	2	6	6316930	6316935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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123270	NC_019682	ATTG	2	8	6317085	6317092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123271	NC_019682	GCT	2	6	6317096	6317101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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123339	NC_019682	TGA	2	6	6321103	6321108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720729
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123343	NC_019682	CTA	2	6	6321344	6321349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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123345	NC_019682	CTT	2	6	6321529	6321534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123346	NC_019682	AAG	2	6	6321536	6321541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123347	NC_019682	ATTGAA	2	12	6321627	6321638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	427720730
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123349	NC_019682	GTAT	2	8	6321695	6321702	25 %	50 %	25 %	0 %	427720730
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123351	NC_019682	TG	3	6	6321821	6321826	0 %	50 %	50 %	0 %	427720730
123352	NC_019682	TCG	2	6	6321873	6321878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720730
123353	NC_019682	ATC	2	6	6321879	6321884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720730
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