MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120001	NC_019682	TTA	2	6	6148596	6148601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720585
120002	NC_019682	ACC	2	6	6148611	6148616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427720585
120003	NC_019682	GAC	2	6	6148706	6148711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720585
120004	NC_019682	GAT	2	6	6148773	6148778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720585
120005	NC_019682	CAG	2	6	6148923	6148928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720585
120006	NC_019682	ATTT	2	8	6148950	6148957	25 %	75 %	0 %	0 %	427720585
120007	NC_019682	T	7	7	6148955	6148961	0 %	100 %	0 %	0 %	427720585
120008	NC_019682	AGA	2	6	6148976	6148981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720585
120009	NC_019682	CAA	2	6	6149010	6149015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720585
120010	NC_019682	TCC	2	6	6149072	6149077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427720585
120011	NC_019682	AGA	2	6	6149197	6149202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120012	NC_019682	T	6	6	6149213	6149218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120013	NC_019682	AT	3	6	6149229	6149234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120014	NC_019682	TACT	2	8	6149239	6149246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120015	NC_019682	ATA	2	6	6149263	6149268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120016	NC_019682	AAC	3	9	6149376	6149384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120017	NC_019682	ATTG	2	8	6149390	6149397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120018	NC_019682	TTGA	2	8	6149409	6149416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120019	NC_019682	T	7	7	6149422	6149428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120020	NC_019682	AGG	2	6	6149444	6149449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120021	NC_019682	GTC	2	6	6149459	6149464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720586
120022	NC_019682	TCA	2	6	6149501	6149506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720586
120023	NC_019682	AATA	2	8	6149530	6149537	75 %	25 %	0 %	0 %	427720586
120024	NC_019682	TCAA	2	8	6149684	6149691	50 %	25 %	0 %	25 %	427720586
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120026	NC_019682	AAG	2	6	6149747	6149752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720586
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120028	NC_019682	TTG	2	6	6149788	6149793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720586
120029	NC_019682	ATT	2	6	6149814	6149819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720586
120030	NC_019682	AAG	2	6	6149929	6149934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120031	NC_019682	ATC	2	6	6150014	6150019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120032	NC_019682	CCT	2	6	6150035	6150040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120033	NC_019682	CAC	2	6	6150254	6150259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427720587
120034	NC_019682	CTA	2	6	6150347	6150352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720587
120035	NC_019682	T	6	6	6150363	6150368	0 %	100 %	0 %	0 %	427720587
120036	NC_019682	T	6	6	6150409	6150414	0 %	100 %	0 %	0 %	427720587
120037	NC_019682	ATA	2	6	6150430	6150435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720587
120038	NC_019682	ATA	2	6	6150446	6150451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720587
120039	NC_019682	TTC	2	6	6150496	6150501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720587
120040	NC_019682	CAAT	2	8	6150531	6150538	50 %	25 %	0 %	25 %	427720587
120041	NC_019682	CAAT	2	8	6150543	6150550	50 %	25 %	0 %	25 %	427720587
120042	NC_019682	TGG	2	6	6150646	6150651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720587
120043	NC_019682	GCC	2	6	6150660	6150665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427720587
120044	NC_019682	AAT	2	6	6150693	6150698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720587
120045	NC_019682	TTG	2	6	6150833	6150838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720587
120046	NC_019682	ATA	2	6	6150883	6150888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120047	NC_019682	CCA	2	6	6150928	6150933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120048	NC_019682	ACC	2	6	6150934	6150939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120049	NC_019682	AAT	2	6	6151011	6151016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720588
120050	NC_019682	AGAT	2	8	6151039	6151046	50 %	25 %	25 %	0 %	427720588
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120052	NC_019682	GCC	2	6	6151167	6151172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427720588
120053	NC_019682	GT	3	6	6151304	6151309	0 %	50 %	50 %	0 %	427720588
120054	NC_019682	ATTG	2	8	6151432	6151439	25 %	50 %	25 %	0 %	427720588
120055	NC_019682	TCA	2	6	6151488	6151493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720588
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120058	NC_019682	AGCA	2	8	6151546	6151553	50 %	0 %	25 %	25 %	427720588
120059	NC_019682	TTC	2	6	6151643	6151648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720588
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120062	NC_019682	TCA	2	6	6151737	6151742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720588
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120067	NC_019682	GGC	3	9	6151943	6151951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427720588
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120071	NC_019682	TAAAG	2	10	6152115	6152124	60 %	20 %	20 %	0 %	427720588
120072	NC_019682	A	6	6	6152311	6152316	100 %	0 %	0 %	0 %	427720588
120073	NC_019682	CAT	2	6	6152431	6152436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720588
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120086	NC_019682	TCAA	2	8	6152877	6152884	50 %	25 %	0 %	25 %	427720589
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120088	NC_019682	TATT	2	8	6153009	6153016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120089	NC_019682	TAG	2	6	6153024	6153029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120090	NC_019682	AAT	2	6	6153039	6153044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120091	NC_019682	GCAG	2	8	6153056	6153063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120092	NC_019682	GA	3	6	6153064	6153069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120093	NC_019682	AGA	2	6	6153076	6153081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120094	NC_019682	TTTACT	2	12	6153108	6153119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120095	NC_019682	ACTT	2	8	6153145	6153152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120096	NC_019682	GGTTG	2	10	6153168	6153177	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
120097	NC_019682	TTG	2	6	6153239	6153244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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120100	NC_019682	TCA	2	6	6153422	6153427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720590
120101	NC_019682	AGCT	2	8	6153433	6153440	25 %	25 %	25 %	25 %	427720590
120102	NC_019682	T	6	6	6153476	6153481	0 %	100 %	0 %	0 %	427720590
120103	NC_019682	CTA	2	6	6153531	6153536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720590
120104	NC_019682	AT	3	6	6153580	6153585	50 %	50 %	0 %	0 %	427720590
120105	NC_019682	TGG	2	6	6153770	6153775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120106	NC_019682	ATT	2	6	6153958	6153963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120107	NC_019682	CGG	2	6	6154086	6154091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427720591
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120112	NC_019682	TAGC	2	8	6154343	6154350	25 %	25 %	25 %	25 %	427720591
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120114	NC_019682	CCAA	2	8	6154405	6154412	50 %	0 %	0 %	50 %	427720591
120115	NC_019682	ACT	2	6	6154417	6154422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720591
120116	NC_019682	TGC	3	9	6154498	6154506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720591
120117	NC_019682	TTG	2	6	6154513	6154518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720591
120118	NC_019682	TC	4	8	6154544	6154551	0 %	50 %	0 %	50 %	427720591
120119	NC_019682	GCT	2	6	6154565	6154570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720591
120120	NC_019682	TTGCGC	2	12	6154621	6154632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720591
120121	NC_019682	T	7	7	6154685	6154691	0 %	100 %	0 %	0 %	427720591
120122	NC_019682	T	6	6	6154707	6154712	0 %	100 %	0 %	0 %	427720591
120123	NC_019682	TTA	2	6	6154715	6154720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720591
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120131	NC_019682	ATG	2	6	6155053	6155058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720591
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120141	NC_019682	CTA	2	6	6155369	6155374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120142	NC_019682	CTG	2	6	6155397	6155402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120143	NC_019682	ATG	2	6	6155501	6155506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720592
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120179	NC_019682	A	7	7	6157172	6157178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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120192	NC_019682	T	6	6	6157728	6157733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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120209	NC_019682	GGGGT	2	10	6158586	6158595	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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120238	NC_019682	AAG	2	6	6159997	6160002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720595
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120286	NC_019682	TG	3	6	6162650	6162655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120287	NC_019682	TACC	2	8	6162700	6162707	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120288	NC_019682	GAAT	2	8	6162715	6162722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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120296	NC_019682	TAT	2	6	6163178	6163183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720597
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120307	NC_019682	GTTT	2	8	6163465	6163472	0 %	75 %	25 %	0 %	427720597
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120309	NC_019682	TTC	2	6	6163584	6163589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720597
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120311	NC_019682	A	6	6	6163687	6163692	100 %	0 %	0 %	0 %	427720598
120312	NC_019682	CGT	2	6	6163724	6163729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720598
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120324	NC_019682	GTAG	2	8	6164310	6164317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120325	NC_019682	TGG	2	6	6164343	6164348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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120328	NC_019682	TAC	2	6	6164434	6164439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120329	NC_019682	ATG	2	6	6164616	6164621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720599
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120333	NC_019682	T	7	7	6164765	6164771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120334	NC_019682	AGC	2	6	6164824	6164829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120338	NC_019682	G	6	6	6164973	6164978	0 %	0 %	100 %	0 %	427720600
120339	NC_019682	TGG	2	6	6165025	6165030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720600
120340	NC_019682	CGC	2	6	6165060	6165065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427720600
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120342	NC_019682	ATG	2	6	6165078	6165083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720600
120343	NC_019682	AAGC	2	8	6165084	6165091	50 %	0 %	25 %	25 %	427720600
120344	NC_019682	CTG	2	6	6165136	6165141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720600
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120347	NC_019682	CAA	2	6	6165225	6165230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720600
120348	NC_019682	AAG	2	6	6165244	6165249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720600
120349	NC_019682	TGC	2	6	6165348	6165353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120350	NC_019682	TTC	2	6	6165534	6165539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720601
120351	NC_019682	GAA	2	6	6165582	6165587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720601
120352	NC_019682	AGA	2	6	6165680	6165685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720601
120353	NC_019682	GCA	2	6	6165726	6165731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720601
120354	NC_019682	TG	3	6	6165753	6165758	0 %	50 %	50 %	0 %	427720601
120355	NC_019682	TGG	2	6	6165788	6165793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720601
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120470	NC_019682	GCA	2	6	6172015	6172020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720608
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