MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_019682	GCA	2	6	543262	543267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715852
10502	NC_019682	AGC	2	6	543268	543273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715852
10503	NC_019682	TGAG	2	8	543294	543301	25 %	25 %	50 %	0 %	427715852
10504	NC_019682	TGC	2	6	543325	543330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715852
10505	NC_019682	GAT	2	6	543368	543373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715852
10506	NC_019682	CGT	2	6	543434	543439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715852
10507	NC_019682	TA	3	6	543486	543491	50 %	50 %	0 %	0 %	427715853
10508	NC_019682	ATC	2	6	543502	543507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715853
10509	NC_019682	T	6	6	543556	543561	0 %	100 %	0 %	0 %	427715853
10510	NC_019682	AATT	2	8	543562	543569	50 %	50 %	0 %	0 %	427715853
10511	NC_019682	CAA	2	6	543584	543589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715853
10512	NC_019682	ATA	2	6	543624	543629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715853
10513	NC_019682	CCTGTA	2	12	543716	543727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427715853
10514	NC_019682	TTA	2	6	543788	543793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715853
10515	NC_019682	AGCA	2	8	543870	543877	50 %	0 %	25 %	25 %	427715853
10516	NC_019682	GGT	2	6	543882	543887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715853
10517	NC_019682	ATTTTG	2	12	543894	543905	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	427715853
10518	NC_019682	ATTT	2	8	543930	543937	25 %	75 %	0 %	0 %	427715853
10519	NC_019682	CAA	2	6	544025	544030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715854
10520	NC_019682	AATCA	2	10	544040	544049	60 %	20 %	0 %	20 %	427715854
10521	NC_019682	CTA	2	6	544051	544056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715854
10522	NC_019682	GTC	2	6	544062	544067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715854
10523	NC_019682	TCG	2	6	544091	544096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715854
10524	NC_019682	GCGAT	2	10	544116	544125	20 %	20 %	40 %	20 %	427715854
10525	NC_019682	CTGAA	2	10	544151	544160	40 %	20 %	20 %	20 %	427715854
10526	NC_019682	ATCG	2	8	544180	544187	25 %	25 %	25 %	25 %	427715854
10527	NC_019682	CTA	3	9	544222	544230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715854
10528	NC_019682	CAC	2	6	544298	544303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715854
10529	NC_019682	A	6	6	544330	544335	100 %	0 %	0 %	0 %	427715854
10530	NC_019682	ATA	2	6	544347	544352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715854
10531	NC_019682	ATC	2	6	544385	544390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715854
10532	NC_019682	GTC	2	6	544413	544418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715854
10533	NC_019682	AAT	2	6	544466	544471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715854
10534	NC_019682	CTGT	2	8	544533	544540	0 %	50 %	25 %	25 %	427715854
10535	NC_019682	TCA	2	6	544549	544554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715854
10536	NC_019682	ATATAG	2	12	544623	544634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_019682	GAGT	2	8	544696	544703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_019682	CTC	2	6	544704	544709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10539	NC_019682	CAAA	2	8	544726	544733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10540	NC_019682	TAG	2	6	544779	544784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_019682	G	6	6	544981	544986	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_019682	CAG	2	6	545004	545009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_019682	AAT	2	6	545035	545040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_019682	T	7	7	545077	545083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_019682	TAG	2	6	545086	545091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_019682	AC	3	6	545106	545111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10547	NC_019682	CTT	2	6	545131	545136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_019682	CATC	2	8	545148	545155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10549	NC_019682	GAA	2	6	545172	545177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_019682	TAA	2	6	545230	545235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_019682	TGCT	2	8	545251	545258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10552	NC_019682	AG	3	6	545289	545294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_019682	TTAT	2	8	545326	545333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_019682	CCA	2	6	545334	545339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10555	NC_019682	ATG	2	6	545405	545410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_019682	TGA	2	6	545418	545423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_019682	AT	4	8	545541	545548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_019682	TG	3	6	545553	545558	0 %	50 %	50 %	0 %	427715855
10559	NC_019682	ATTTA	2	10	545614	545623	40 %	60 %	0 %	0 %	427715855
10560	NC_019682	TAG	2	6	545625	545630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715855
10561	NC_019682	A	7	7	545654	545660	100 %	0 %	0 %	0 %	427715855
10562	NC_019682	ATT	2	6	545665	545670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715855
10563	NC_019682	A	7	7	545716	545722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_019682	AAT	2	6	545779	545784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715856
10565	NC_019682	CT	3	6	545884	545889	0 %	50 %	0 %	50 %	427715856
10566	NC_019682	GATCGC	2	12	545897	545908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427715856
10567	NC_019682	ACAG	2	8	545971	545978	50 %	0 %	25 %	25 %	427715856
10568	NC_019682	TGG	2	6	545982	545987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715856
10569	NC_019682	CA	3	6	546077	546082	50 %	0 %	0 %	50 %	427715856
10570	NC_019682	TGG	2	6	546102	546107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715856
10571	NC_019682	TTA	2	6	546412	546417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715856
10572	NC_019682	AAAATA	2	12	546485	546496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	427715856
10573	NC_019682	ACC	2	6	546525	546530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715856
10574	NC_019682	ACC	2	6	546590	546595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715856
10575	NC_019682	GATC	2	8	546691	546698	25 %	25 %	25 %	25 %	427715856
10576	NC_019682	CCG	2	6	546705	546710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715856
10577	NC_019682	AGC	2	6	546742	546747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715856
10578	NC_019682	ATT	3	9	546752	546760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715856
10579	NC_019682	CCA	2	6	546767	546772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715856
10580	NC_019682	CCG	2	6	546777	546782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715856
10581	NC_019682	CTG	2	6	546783	546788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715856
10582	NC_019682	GTC	2	6	546818	546823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715856
10583	NC_019682	AAC	2	6	546824	546829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715856
10584	NC_019682	CGG	2	6	546859	546864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715856
10585	NC_019682	GAT	2	6	546866	546871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715856
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10587	NC_019682	AAG	2	6	546945	546950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715856
10588	NC_019682	CCG	2	6	546957	546962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715856
10589	NC_019682	TG	3	6	546975	546980	0 %	50 %	50 %	0 %	427715856
10590	NC_019682	CAC	2	6	547102	547107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715856
10591	NC_019682	A	6	6	547109	547114	100 %	0 %	0 %	0 %	427715856
10592	NC_019682	TC	3	6	547214	547219	0 %	50 %	0 %	50 %	427715856
10593	NC_019682	GAA	2	6	547256	547261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715856
10594	NC_019682	AAG	2	6	547280	547285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715856
10595	NC_019682	TGG	2	6	547309	547314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715856
10596	NC_019682	AGC	2	6	547406	547411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715856
10597	NC_019682	AAG	2	6	547452	547457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715856
10598	NC_019682	CAG	2	6	547485	547490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715856
10599	NC_019682	TAC	2	6	547514	547519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715856
10600	NC_019682	TCT	2	6	547618	547623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_019682	CGT	2	6	547630	547635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_019682	CAC	2	6	547825	547830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715857
10603	NC_019682	ATT	2	6	547868	547873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715857
10604	NC_019682	CCA	2	6	547877	547882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715857
10605	NC_019682	GCA	2	6	547918	547923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715857
10606	NC_019682	TA	3	6	547949	547954	50 %	50 %	0 %	0 %	427715857
10607	NC_019682	CAC	2	6	548013	548018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715857
10608	NC_019682	TGTT	2	8	548029	548036	0 %	75 %	25 %	0 %	427715857
10609	NC_019682	GAAA	2	8	548107	548114	75 %	0 %	25 %	0 %	427715857
10610	NC_019682	TTC	2	6	548147	548152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715857
10611	NC_019682	TGA	2	6	548251	548256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715857
10612	NC_019682	TGA	2	6	548263	548268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715857
10613	NC_019682	CTA	2	6	548299	548304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715857
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10616	NC_019682	TGA	2	6	548602	548607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715857
10617	NC_019682	TAT	2	6	548641	548646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715857
10618	NC_019682	TGG	2	6	548662	548667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715857
10619	NC_019682	CACCCA	2	12	548673	548684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715857
10620	NC_019682	ACA	2	6	548721	548726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715857
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