MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_019682	TTG	2	6	518377	518382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715829
10002	NC_019682	CA	3	6	518419	518424	50 %	0 %	0 %	50 %	427715829
10003	NC_019682	TG	3	6	518434	518439	0 %	50 %	50 %	0 %	427715829
10004	NC_019682	T	6	6	518495	518500	0 %	100 %	0 %	0 %	427715829
10005	NC_019682	GTA	2	6	518526	518531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715829
10006	NC_019682	CGT	2	6	518543	518548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715829
10007	NC_019682	AGT	2	6	518549	518554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715829
10008	NC_019682	T	6	6	518559	518564	0 %	100 %	0 %	0 %	427715829
10009	NC_019682	GT	3	6	518655	518660	0 %	50 %	50 %	0 %	427715829
10010	NC_019682	TGG	2	6	518697	518702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715829
10011	NC_019682	GGT	2	6	518745	518750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715829
10012	NC_019682	ACC	2	6	518823	518828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715829
10013	NC_019682	TTTC	2	8	518876	518883	0 %	75 %	0 %	25 %	427715829
10014	NC_019682	TGG	2	6	518956	518961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715829
10015	NC_019682	CAG	2	6	519174	519179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715829
10016	NC_019682	CCT	2	6	519187	519192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715829
10017	NC_019682	TCA	2	6	519251	519256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715829
10018	NC_019682	CAT	2	6	519287	519292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715829
10019	NC_019682	CCA	2	6	519321	519326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715829
10020	NC_019682	TTG	2	6	519330	519335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715829
10021	NC_019682	GCT	2	6	519361	519366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715829
10022	NC_019682	TAG	2	6	519391	519396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715829
10023	NC_019682	CGT	2	6	519437	519442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715829
10024	NC_019682	ACC	2	6	519480	519485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715829
10025	NC_019682	CTGC	2	8	519542	519549	0 %	25 %	25 %	50 %	427715829
10026	NC_019682	TTGTC	2	10	519571	519580	0 %	60 %	20 %	20 %	427715829
10027	NC_019682	ATT	2	6	519603	519608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715829
10028	NC_019682	CCT	2	6	519628	519633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715829
10029	NC_019682	ATT	2	6	519732	519737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715829
10030	NC_019682	GCC	2	6	519747	519752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715829
10031	NC_019682	TAC	2	6	519821	519826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715829
10032	NC_019682	TCA	2	6	519874	519879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715829
10033	NC_019682	CCA	2	6	519925	519930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715829
10034	NC_019682	TC	3	6	519976	519981	0 %	50 %	0 %	50 %	427715829
10035	NC_019682	ATTT	2	8	520007	520014	25 %	75 %	0 %	0 %	427715829
10036	NC_019682	GATC	2	8	520016	520023	25 %	25 %	25 %	25 %	427715829
10037	NC_019682	TTCT	2	8	520028	520035	0 %	75 %	0 %	25 %	427715829
10038	NC_019682	T	6	6	520078	520083	0 %	100 %	0 %	0 %	427715829
10039	NC_019682	CT	3	6	520246	520251	0 %	50 %	0 %	50 %	427715829
10040	NC_019682	ATT	2	6	520311	520316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715829
10041	NC_019682	CCA	2	6	520339	520344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715829
10042	NC_019682	CAT	2	6	520364	520369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715829
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10044	NC_019682	GAA	2	6	520440	520445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715829
10045	NC_019682	TGA	2	6	520449	520454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715829
10046	NC_019682	GGT	2	6	520480	520485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715829
10047	NC_019682	TTG	2	6	520502	520507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715829
10048	NC_019682	CAG	3	9	520584	520592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715829
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10050	NC_019682	GAA	2	6	520637	520642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715829
10051	NC_019682	TGA	2	6	520675	520680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_019682	TAG	2	6	520735	520740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_019682	T	6	6	520743	520748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_019682	TCA	3	9	520752	520760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_019682	GATG	2	8	520792	520799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_019682	GT	3	6	520848	520853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_019682	ACAA	2	8	520984	520991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_019682	A	6	6	520993	520998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_019682	AAT	2	6	521032	521037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_019682	CCGC	2	8	521116	521123	0 %	0 %	25 %	75 %	427715830
10061	NC_019682	AAGT	2	8	521179	521186	50 %	25 %	25 %	0 %	427715830
10062	NC_019682	AAC	2	6	521229	521234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715830
10063	NC_019682	ATTT	2	8	521394	521401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_019682	GATT	2	8	521438	521445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_019682	TAA	2	6	521455	521460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_019682	CAG	2	6	521565	521570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715831
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10069	NC_019682	TTTC	2	8	521637	521644	0 %	75 %	0 %	25 %	427715831
10070	NC_019682	GCCA	2	8	521683	521690	25 %	0 %	25 %	50 %	427715831
10071	NC_019682	GTAG	2	8	521698	521705	25 %	25 %	50 %	0 %	427715831
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10086	NC_019682	TTC	2	6	522216	522221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715832
10087	NC_019682	GTA	2	6	522270	522275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715832
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10091	NC_019682	GGC	2	6	522425	522430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715832
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10094	NC_019682	GATCC	2	10	522456	522465	20 %	20 %	20 %	40 %	427715832
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10096	NC_019682	ACA	2	6	522633	522638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_019682	ATT	2	6	522725	522730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_019682	CTT	2	6	522916	522921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715833
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10102	NC_019682	AGCT	2	8	523244	523251	25 %	25 %	25 %	25 %	427715833
10103	NC_019682	CGG	2	6	523315	523320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715833
10104	NC_019682	TAA	2	6	523321	523326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715833
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10106	NC_019682	ACCCAC	2	12	523452	523463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715833
10107	NC_019682	GTG	2	6	523580	523585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715833
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10109	NC_019682	GT	3	6	523904	523909	0 %	50 %	50 %	0 %	427715833
10110	NC_019682	ATTC	2	8	524006	524013	25 %	50 %	0 %	25 %	427715833
10111	NC_019682	AGC	2	6	524058	524063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715833
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10115	NC_019682	GTG	2	6	524219	524224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715833
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10117	NC_019682	CCA	2	6	524245	524250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715833
10118	NC_019682	TAC	2	6	524264	524269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715833
10119	NC_019682	GCG	2	6	524280	524285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715833
10120	NC_019682	CAC	2	6	524294	524299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715833
10121	NC_019682	CTA	2	6	524378	524383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715833
10122	NC_019682	GAC	2	6	524435	524440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715833
10123	NC_019682	GTAG	2	8	524442	524449	25 %	25 %	50 %	0 %	427715833
10124	NC_019682	GAC	2	6	524450	524455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715833
10125	NC_019682	GGC	2	6	524462	524467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715833
10126	NC_019682	CT	3	6	524556	524561	0 %	50 %	0 %	50 %	427715833
10127	NC_019682	TG	3	6	524668	524673	0 %	50 %	50 %	0 %	427715833
10128	NC_019682	TTA	2	6	524809	524814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715833
10129	NC_019682	TTTC	2	8	524891	524898	0 %	75 %	0 %	25 %	427715833
10130	NC_019682	TGA	2	6	524993	524998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715833
10131	NC_019682	CTT	2	6	525074	525079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715833
10132	NC_019682	AAT	2	6	525119	525124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715833
10133	NC_019682	CTA	2	6	525155	525160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715833
10134	NC_019682	AAT	2	6	525183	525188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715833
10135	NC_019682	CTT	2	6	525206	525211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715833
10136	NC_019682	CTA	2	6	525217	525222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715833
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10140	NC_019682	GAC	2	6	525466	525471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715833
10141	NC_019682	GAC	2	6	525494	525499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715833
10142	NC_019682	CAA	2	6	525603	525608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715833
10143	NC_019682	CGA	2	6	525782	525787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715833
10144	NC_019682	ACC	2	6	525897	525902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715833
10145	NC_019682	CAC	2	6	525998	526003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715833
10146	NC_019682	CTAG	2	8	526012	526019	25 %	25 %	25 %	25 %	427715833
10147	NC_019682	A	6	6	526048	526053	100 %	0 %	0 %	0 %	427715833
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10149	NC_019682	AAT	2	6	526101	526106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715833
10150	NC_019682	TTCA	2	8	526176	526183	25 %	50 %	0 %	25 %	427715833
10151	NC_019682	A	6	6	526198	526203	100 %	0 %	0 %	0 %	427715833
10152	NC_019682	TTG	2	6	526209	526214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715833
10153	NC_019682	TCG	2	6	526229	526234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715833
10154	NC_019682	CCA	2	6	526279	526284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715833
10155	NC_019682	CAT	2	6	526319	526324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10156	NC_019682	TTAGA	2	10	526433	526442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10157	NC_019682	TGG	2	6	526460	526465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10158	NC_019682	AAG	2	6	526472	526477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_019682	ACAGG	2	10	526574	526583	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10160	NC_019682	CTGA	2	8	526616	526623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10161	NC_019682	ATA	2	6	526643	526648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_019682	TAA	2	6	526714	526719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_019682	TGC	2	6	526738	526743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10172	NC_019682	CTG	2	6	527127	527132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715834
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10175	NC_019682	GTCA	2	8	527329	527336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10176	NC_019682	CAG	2	6	527474	527479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10197	NC_019682	CAA	2	6	528272	528277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10198	NC_019682	AAT	2	6	528321	528326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10199	NC_019682	TAT	2	6	528391	528396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10200	NC_019682	TAG	2	6	528409	528414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10201	NC_019682	CAAA	2	8	528470	528477	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10202	NC_019682	CAAA	2	8	528486	528493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10203	NC_019682	AACC	2	8	528507	528514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10204	NC_019682	ATA	2	6	528519	528524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10205	NC_019682	ACCA	2	8	528526	528533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10206	NC_019682	CCAA	2	8	528534	528541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10207	NC_019682	A	6	6	528540	528545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10208	NC_019682	AATCC	2	10	528552	528561	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10209	NC_019682	AAT	2	6	528563	528568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10210	NC_019682	TCT	2	6	528597	528602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10211	NC_019682	TTG	2	6	528641	528646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10212	NC_019682	CAG	2	6	528715	528720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10213	NC_019682	T	7	7	528722	528728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10214	NC_019682	AT	3	6	528748	528753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10215	NC_019682	GTA	2	6	528809	528814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10216	NC_019682	CAG	2	6	528883	528888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10219	NC_019682	ACA	2	6	529105	529110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10220	NC_019682	GATA	2	8	529114	529121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10221	NC_019682	TGG	2	6	529193	529198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10222	NC_019682	CGG	2	6	529230	529235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10223	NC_019682	TAT	2	6	529248	529253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10224	NC_019682	TTTG	2	8	529284	529291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10225	NC_019682	ACAGC	2	10	529391	529400	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10226	NC_019682	ATT	2	6	529421	529426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10227	NC_019682	CAT	2	6	529434	529439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10228	NC_019682	GTT	2	6	529615	529620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10229	NC_019682	CGC	2	6	529635	529640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10230	NC_019682	AGA	2	6	529642	529647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10231	NC_019682	AGA	2	6	529753	529758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_019682	C	8	8	529799	529806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10233	NC_019682	TGA	2	6	529901	529906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10234	NC_019682	AAG	2	6	529973	529978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10235	NC_019682	AT	3	6	529988	529993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_019682	CAGAA	2	10	530072	530081	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10237	NC_019682	TCA	2	6	530102	530107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10238	NC_019682	A	6	6	530133	530138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_019682	TCA	2	6	530168	530173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10240	NC_019682	TTG	2	6	530194	530199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_019682	T	6	6	530279	530284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_019682	CA	3	6	530294	530299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10243	NC_019682	AC	3	6	530317	530322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10244	NC_019682	TTC	2	6	530330	530335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_019682	AAG	2	6	530387	530392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_019682	GAT	2	6	530412	530417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_019682	ACT	2	6	530446	530451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_019682	CCG	2	6	530528	530533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715836
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10251	NC_019682	TG	3	6	530713	530718	0 %	50 %	50 %	0 %	427715836
10252	NC_019682	ACG	2	6	530755	530760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715836
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10356	NC_019682	AT	3	6	536386	536391	50 %	50 %	0 %	0 %	427715843
10357	NC_019682	GTA	2	6	536406	536411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715843
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10362	NC_019682	GCT	2	6	536727	536732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10363	NC_019682	ATTCA	2	10	536831	536840	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10364	NC_019682	CTT	2	6	536926	536931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715844
10365	NC_019682	TGC	2	6	536939	536944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715844
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10486	NC_019682	A	7	7	542722	542728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10487	NC_019682	ATC	2	6	542806	542811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10490	NC_019682	T	6	6	542964	542969	0 %	100 %	0 %	0 %	427715851
10491	NC_019682	GTTC	2	8	542978	542985	0 %	50 %	25 %	25 %	427715851
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10498	NC_019682	TG	3	6	543139	543144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_019682	ATCT	2	8	543172	543179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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