MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 36087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019566	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019566	TAC	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019566	TGT	2	6	52	57	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019566	ACT	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019566	TTA	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019566	ACA	2	6	115	120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019566	TAA	2	6	155	160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019566	TGTA	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019566	A	7	7	177	183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019566	TGAAT	2	10	195	204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019566	TAAT	2	8	242	249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019566	ATT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019566	AGAT	2	8	286	293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019566	TAAT	2	8	330	337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019566	AT	3	6	697	702	50 %	50 %	0 %	0 %	426400512
16	NC_019566	TGC	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400512
17	NC_019566	ATG	3	9	795	803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400512
18	NC_019566	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400512
19	NC_019566	GT	3	6	849	854	0 %	50 %	50 %	0 %	426400512
20	NC_019566	TAT	2	6	922	927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400512
21	NC_019566	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400512
22	NC_019566	CTG	2	6	990	995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400512
23	NC_019566	GGA	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400512
24	NC_019566	TAT	2	6	1135	1140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400512
25	NC_019566	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400512
26	NC_019566	TAT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400513
27	NC_019566	A	6	6	1383	1388	100 %	0 %	0 %	0 %	426400513
28	NC_019566	GCT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400513
29	NC_019566	CTAT	2	8	1435	1442	25 %	50 %	0 %	25 %	426400513
30	NC_019566	TGT	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400513
31	NC_019566	TGC	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400513
32	NC_019566	GA	3	6	1612	1617	50 %	0 %	50 %	0 %	426400513
33	NC_019566	TGT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400513
34	NC_019566	ATCG	2	8	1677	1684	25 %	25 %	25 %	25 %	426400513
35	NC_019566	GAT	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400513
36	NC_019566	GTT	2	6	1859	1864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400514
37	NC_019566	ACA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400514
38	NC_019566	TCG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400514
39	NC_019566	ATG	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400514
40	NC_019566	GTG	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400514
41	NC_019566	GTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400514
42	NC_019566	CT	3	6	2133	2138	0 %	50 %	0 %	50 %	426400514
43	NC_019566	CTT	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400514
44	NC_019566	GTA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400514
45	NC_019566	CAG	2	6	2264	2269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400514
46	NC_019566	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400514
47	NC_019566	AAAG	2	8	2448	2455	75 %	0 %	25 %	0 %	426400514
48	NC_019566	AAC	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400514
49	NC_019566	GTT	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400515
50	NC_019566	ATT	2	6	2597	2602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400515
51	NC_019566	TCT	2	6	2656	2661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400515
52	NC_019566	T	6	6	2715	2720	0 %	100 %	0 %	0 %	426400515
53	NC_019566	GTC	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400515
54	NC_019566	TTGACA	2	12	2897	2908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400515
55	NC_019566	TTTA	2	8	2963	2970	25 %	75 %	0 %	0 %	426400515
56	NC_019566	ATTG	2	8	2973	2980	25 %	50 %	25 %	0 %	426400515
57	NC_019566	TAA	2	6	3015	3020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400515
58	NC_019566	A	7	7	3065	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	426400515
59	NC_019566	GTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400515
60	NC_019566	GTG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400515
61	NC_019566	TTG	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019566	AT	3	6	3206	3211	50 %	50 %	0 %	0 %	426400516
63	NC_019566	T	8	8	3225	3232	0 %	100 %	0 %	0 %	426400516
64	NC_019566	AT	3	6	3237	3242	50 %	50 %	0 %	0 %	426400516
65	NC_019566	GTA	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400516
66	NC_019566	CTAG	2	8	3301	3308	25 %	25 %	25 %	25 %	426400516
67	NC_019566	TC	3	6	3313	3318	0 %	50 %	0 %	50 %	426400516
68	NC_019566	AAT	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400516
69	NC_019566	T	6	6	3383	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	426400516
70	NC_019566	ATT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400516
71	NC_019566	TAG	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400516
72	NC_019566	AAAAG	2	10	3588	3597	80 %	0 %	20 %	0 %	426400516
73	NC_019566	AAT	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400516
74	NC_019566	G	6	6	3643	3648	0 %	0 %	100 %	0 %	426400516
75	NC_019566	ATGA	2	8	3649	3656	50 %	25 %	25 %	0 %	426400516
76	NC_019566	A	6	6	3667	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019566	TTA	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019566	TAA	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019566	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019566	AAT	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019566	TAA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019566	TTAA	2	8	3808	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019566	ATT	2	6	3819	3824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019566	TA	3	6	3834	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019566	TCT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019566	ATG	2	6	3910	3915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019566	TATT	2	8	3921	3928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019566	TTTA	2	8	3931	3938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019566	GTAA	2	8	3958	3965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019566	TAG	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019566	AAT	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019566	TCT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019566	GTAT	2	8	4050	4057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019566	T	10	10	4083	4092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019566	TAA	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019566	T	6	6	4115	4120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019566	AAG	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019566	TAA	2	6	4160	4165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019566	CTTG	2	8	4174	4181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019566	TAAT	2	8	4183	4190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019566	TAATT	2	10	4205	4214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019566	TAG	2	6	4215	4220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019566	T	6	6	4221	4226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019566	A	8	8	4243	4250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019566	GTA	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019566	GTA	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019566	ATT	4	12	4287	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019566	GTT	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019566	ATTAA	2	10	4313	4322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019566	TAA	2	6	4355	4360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019566	TCT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019566	AGA	2	6	4383	4388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019566	A	6	6	4394	4399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019566	AAT	2	6	4410	4415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019566	ATTA	2	8	4419	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019566	ATT	2	6	4550	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019566	AAT	2	6	4557	4562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019566	ATT	2	6	4573	4578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019566	TTA	2	6	4594	4599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019566	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019566	A	7	7	4631	4637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019566	ATT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019566	GTTTTA	2	12	4651	4662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019566	AAT	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019566	AT	3	6	4694	4699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019566	ATT	2	6	4761	4766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019566	AT	3	6	4768	4773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019566	TAT	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019566	T	7	7	4858	4864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019566	ATAAA	3	15	4876	4890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019566	TTA	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019566	AATTT	2	10	4916	4925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019566	T	7	7	4975	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019566	TTA	2	6	5060	5065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400517
135	NC_019566	CAG	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400517
136	NC_019566	TGA	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
137	NC_019566	ATT	2	6	5191	5196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400517
138	NC_019566	GCT	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400517
139	NC_019566	TTGTAT	2	12	5333	5344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	426400517
140	NC_019566	AAC	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400517
141	NC_019566	AGT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
142	NC_019566	TCA	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400517
143	NC_019566	AAC	2	6	5549	5554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400517
144	NC_019566	GT	3	6	5653	5658	0 %	50 %	50 %	0 %	426400517
145	NC_019566	CTG	2	6	5711	5716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400517
146	NC_019566	GAG	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400517
147	NC_019566	ATTGAG	2	12	5836	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
148	NC_019566	AG	3	6	5916	5921	50 %	0 %	50 %	0 %	426400517
149	NC_019566	ATC	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400517
150	NC_019566	CTG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400517
151	NC_019566	TG	3	6	6062	6067	0 %	50 %	50 %	0 %	426400517
152	NC_019566	GAC	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400517
153	NC_019566	ATG	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
154	NC_019566	ATT	3	9	6415	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019566	T	8	8	6422	6429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019566	TATT	2	8	6459	6466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019566	AAAT	2	8	6470	6477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019566	AT	3	6	6514	6519	50 %	50 %	0 %	0 %	426400518
159	NC_019566	TTG	2	6	6525	6530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400518
160	NC_019566	A	10	10	6533	6542	100 %	0 %	0 %	0 %	426400518
161	NC_019566	A	8	8	6569	6576	100 %	0 %	0 %	0 %	426400518
162	NC_019566	TCTTTA	2	12	6589	6600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	426400518
163	NC_019566	CAA	2	6	6628	6633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400519
164	NC_019566	GCT	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400519
165	NC_019566	CGA	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400519
166	NC_019566	ATC	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400519
167	NC_019566	GCTTTC	2	12	6891	6902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	426400519
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169	NC_019566	CGC	2	6	7001	7006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400519
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171	NC_019566	TA	3	6	7107	7112	50 %	50 %	0 %	0 %	426400519
172	NC_019566	T	7	7	7143	7149	0 %	100 %	0 %	0 %	426400519
173	NC_019566	CAT	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400519
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175	NC_019566	GAA	2	6	7193	7198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400519
176	NC_019566	GTA	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
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178	NC_019566	GAG	2	6	7410	7415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400519
179	NC_019566	AAT	2	6	7464	7469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400519
180	NC_019566	CTTAAT	2	12	7482	7493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400519
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183	NC_019566	ATC	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400519
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185	NC_019566	AT	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	426400519
186	NC_019566	GAT	2	6	7715	7720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
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213	NC_019566	T	6	6	9460	9465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_019566	CT	3	6	9486	9491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
215	NC_019566	TCT	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400520
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219	NC_019566	TA	3	6	9755	9760	50 %	50 %	0 %	0 %	426400520
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242	NC_019566	TTAGC	2	10	10988	10997	20 %	40 %	20 %	20 %	426400521
243	NC_019566	T	9	9	11101	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	426400522
244	NC_019566	AT	3	6	11303	11308	50 %	50 %	0 %	0 %	426400523
245	NC_019566	ATA	2	6	11319	11324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400523
246	NC_019566	TTA	2	6	11384	11389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_019566	T	8	8	11404	11411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_019566	A	6	6	11428	11433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_019566	TATT	2	8	11464	11471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_019566	AAAT	2	8	11472	11479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019566	T	9	9	11483	11491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019566	T	6	6	11532	11537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_019566	GTTA	2	8	11554	11561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019566	AAGC	2	8	11601	11608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
255	NC_019566	T	6	6	11692	11697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_019566	TAAT	2	8	11732	11739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_019566	TAAA	2	8	11752	11759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_019566	T	6	6	11761	11766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_019566	TGT	2	6	12023	12028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400524
262	NC_019566	TAT	2	6	12216	12221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400524
263	NC_019566	AGTT	2	8	12305	12312	25 %	50 %	25 %	0 %	426400524
264	NC_019566	TAG	2	6	12313	12318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400524
265	NC_019566	ACT	2	6	12387	12392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400524
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268	NC_019566	ACC	2	6	12486	12491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400524
269	NC_019566	GC	3	6	12550	12555	0 %	0 %	50 %	50 %	426400524
270	NC_019566	AG	3	6	12628	12633	50 %	0 %	50 %	0 %	426400524
271	NC_019566	CTG	2	6	12685	12690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400524
272	NC_019566	GGA	2	6	12761	12766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400524
273	NC_019566	GTT	2	6	12774	12779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400524
274	NC_019566	AAG	2	6	12781	12786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400524
275	NC_019566	ACC	2	6	12803	12808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400524
276	NC_019566	TTA	2	6	12859	12864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_019566	TAA	2	6	12865	12870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_019566	A	6	6	12985	12990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_019566	TTA	2	6	18826	18831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_019566	TAA	2	6	18866	18871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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